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9MU2

Sapi1 neck structure with dna, tail completion protein, and tape measure protein

PDB DOI: 10.2210/pdb9mu2/pdb

Classification: VIRUS LIKE PARTICLE
Organism(s): Staphylococcus Phage 80Alpha

Deposited: 2025-01-13
Deposition Author(s): Dokland, T. , Kizziah, J.L.

Experimental Data Snapshot

Method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3.54 Å

9mu2
Literature

Sapi1 neck structure with dna, tail completion protein, and tape measure protein

Dokland, T. , Kizziah, J.L.

Primary Citation of Related Structures: 9MU2


Proteins
Molecule Chains Sequence Length Organism Sequence
adaptor A 100 Staphylococcus Phage 80Alpha MRYEDRVIFQLEQVATYNPKTSKKENTLITYDAIPCNINPISRARKQLEFGDVKNDVSVLRIKESISYPVSHVLVNGIRYKIVDTRIYRHETSYYIEEVN
DUF3168 domain-containing protein B 127 Staphylococcus Phage 80Alpha MTPNLQLYNKAYETLQGYGFPVISRKEMQQEIPYPFFVIKMPESNRSKYTFDSYSGDTNLVIDIWSVSDDLGHHDGLVKRCIDDLTPSVKTNDYDFEEDDTNITQLVDDTTNQELLHTSITISYKTF
adaptor G 100 Staphylococcus Phage 80Alpha MRYEDRVIFQLEQVATYNPKTSKKENTLITYDAIPCNINPISRARKQLEFGDVKNDVSVLRIKESISYPVSHVLVNGIRYKIVDTRIYRHETSYYIEEVN
DUF3168 domain-containing protein H 127 Staphylococcus Phage 80Alpha MTPNLQLYNKAYETLQGYGFPVISRKEMQQEIPYPFFVIKMPESNRSKYTFDSYSGDTNLVIDIWSVSDDLGHHDGLVKRCIDDLTPSVKTNDYDFEEDDTNITQLVDDTTNQELLHTSITISYKTF
Head-tail connector protein S 110 Staphylococcus Phage 80Alpha MTTLADVKKRIGLKDEKQDEQLEEIIKSCESQLLSMLPIEVEQIPERFSYMIKEVAVKRYNRIGAEGMTSEAVDGRSNAYELNDFKEYEAIIDNYFNARTRTKKGRAVFF
Head-tail connector protein T 110 Staphylococcus Phage 80Alpha MTTLADVKKRIGLKDEKQDEQLEEIIKSCESQLLSMLPIEVEQIPERFSYMIKEVAVKRYNRIGAEGMTSEAVDGRSNAYELNDFKEYEAIIDNYFNARTRTKKGRAVFF
Head-tail connector protein Y 110 Staphylococcus Phage 80Alpha MTTLADVKKRIGLKDEKQDEQLEEIIKSCESQLLSMLPIEVEQIPERFSYMIKEVAVKRYNRIGAEGMTSEAVDGRSNAYELNDFKEYEAIIDNYFNARTRTKKGRAVFF
Head-tail connector protein Z 110 Staphylococcus Phage 80Alpha MTTLADVKKRIGLKDEKQDEQLEEIIKSCESQLLSMLPIEVEQIPERFSYMIKEVAVKRYNRIGAEGMTSEAVDGRSNAYELNDFKEYEAIIDNYFNARTRTKKGRAVFF
Major tail protein E 193 Staphylococcus Phage 80Alpha MANMKNSNDRIILFRKAGEKVDATKMLFLTEYGLSHEADTDTEDTMDGSYNTGGSVESTMSGTAKMFYGDDFADEIEDAVVDRVLYEAWEVESRIPGKNGDSAKFKAKYFQGFHNKFELKAEANGIDEYEYEYGVNGRFQRGFATLPEAVTKKLKATGYRFHDTTKEDALTSEDLTAIPQPKVDSSTVTPGEV
Major tail protein F 193 Staphylococcus Phage 80Alpha MANMKNSNDRIILFRKAGEKVDATKMLFLTEYGLSHEADTDTEDTMDGSYNTGGSVESTMSGTAKMFYGDDFADEIEDAVVDRVLYEAWEVESRIPGKNGDSAKFKAKYFQGFHNKFELKAEANGIDEYEYEYGVNGRFQRGFATLPEAVTKKLKATGYRFHDTTKEDALTSEDLTAIPQPKVDSSTVTPGEV
Major tail protein K 193 Staphylococcus Phage 80Alpha MANMKNSNDRIILFRKAGEKVDATKMLFLTEYGLSHEADTDTEDTMDGSYNTGGSVESTMSGTAKMFYGDDFADEIEDAVVDRVLYEAWEVESRIPGKNGDSAKFKAKYFQGFHNKFELKAEANGIDEYEYEYGVNGRFQRGFATLPEAVTKKLKATGYRFHDTTKEDALTSEDLTAIPQPKVDSSTVTPGEV
Major tail protein L 193 Staphylococcus Phage 80Alpha MANMKNSNDRIILFRKAGEKVDATKMLFLTEYGLSHEADTDTEDTMDGSYNTGGSVESTMSGTAKMFYGDDFADEIEDAVVDRVLYEAWEVESRIPGKNGDSAKFKAKYFQGFHNKFELKAEANGIDEYEYEYGVNGRFQRGFATLPEAVTKKLKATGYRFHDTTKEDALTSEDLTAIPQPKVDSSTVTPGEV
Major tail protein C 193 Staphylococcus Phage 80Alpha MANMKNSNDRIILFRKAGEKVDATKMLFLTEYGLSHEADTDTEDTMDGSYNTGGSVESTMSGTAKMFYGDDFADEIEDAVVDRVLYEAWEVESRIPGKNGDSAKFKAKYFQGFHNKFELKAEANGIDEYEYEYGVNGRFQRGFATLPEAVTKKLKATGYRFHDTTKEDALTSEDLTAIPQPKVDSSTVTPGEV
Major tail protein I 193 Staphylococcus Phage 80Alpha MANMKNSNDRIILFRKAGEKVDATKMLFLTEYGLSHEADTDTEDTMDGSYNTGGSVESTMSGTAKMFYGDDFADEIEDAVVDRVLYEAWEVESRIPGKNGDSAKFKAKYFQGFHNKFELKAEANGIDEYEYEYGVNGRFQRGFATLPEAVTKKLKATGYRFHDTTKEDALTSEDLTAIPQPKVDSSTVTPGEV
adaptor U 100 Staphylococcus Phage 80Alpha MRYEDRVIFQLEQVATYNPKTSKKENTLITYDAIPCNINPISRARKQLEFGDVKNDVSVLRIKESISYPVSHVLVNGIRYKIVDTRIYRHETSYYIEEVN
Tape measure protein M 1154 Staphylococcus Phage 80Alpha MTEYKIKATIEASVAKFKRQIDSAVKSVQRFKRVADQTKDVELNANDKKLQKTIKVAKKSLDAFSNKNVKAKLDASIQDLQQKILESNFELDKLNSKEASPEVKLQKQKLTKDIAEAENKLSELEKKRVNIDVNADNSKFNRVLKVSKASLEALNRSKAKAILDVDNSVANSKIKRTKEELKSIPNKTRSRLDVDTRLSIPTIYAFKKSLDALPNKKTTKVDVDTNGLKKVYAYIIKANDNFQRQMGNLANMFRVFGTVGSNMVGGLLTSSFSILIPVIASVVPVVFALLNAIKVLTGGVLALGGAVAIAGAGFVAFGAMAISAIKMLNDGTLQASSATNEYKKALDGVKSAWTDIIKQNQSAIFTTLANGLNTVKTAMQSLQPFFSGISRGMEEASQSVLKWAENSSVASRFFNMMNTTGVSVFNKLLSAAGGFGDGLVNVFTQLAPLFQWSADWLDRLGQSFSNWANSAAGENSITRFIEYTKTNLPIIGNIFKNVFAGINNLMNAFSGSSTGIFQSLEQMTAKFREWSEQVGQSQGFKDFVSYIQTNGPLIMQLIGNIARGLVAFATAMAPIASAVLRVAVAITGWIANLFEAHPATAQLVGVIITLVGAFRFLIAPILAVMDFLGPLAARLVALVTKFGWAKTGTLVLSKAMTSLKGPIKLVTAIFQLLFGKIGLIRNAITGLVTVFGILGGPITIVIGVIAALIAIFVLLWNKNEGFRNFIINAWNAIKTFMVNVWNVLKAVASVVWNAILTAITTAVSNVYNFIMIVWNQIVAYLQGLWNGIIAIATTVWNLLVTIITTVFTTIMTIVMTIWTAIWTFLSTIWNTIITIATTIWNLLVTVITTVFTTIMTIAMTIWNAIWTFLQTLWNTIVTVATKVWNAITTAISTALQAAWSFISNIWNTIWSFLSGILTTIWNKVVSIFTQVVSTISDKMSQAWNFIVTKGMQWVSTITSTLINFVNRVIQGFVNVVNKVSQGMTNAVNKIKSFIGDFVSAGADMIRGLIRGIGQMAGQLVDAAKNVAKKALDAAKSALGIHSPSREFMDVGMYSMLGFVKGIDNHSSKVIRNVSNVADKVVDAFQPTLNAPDISSITGNLSNLGGNINAQVQHTHSIETSPNMKTVKVEFDVNNDALTSIVNGRNAKRNSEYYL
Major tail protein D 193 Staphylococcus Phage 80Alpha MANMKNSNDRIILFRKAGEKVDATKMLFLTEYGLSHEADTDTEDTMDGSYNTGGSVESTMSGTAKMFYGDDFADEIEDAVVDRVLYEAWEVESRIPGKNGDSAKFKAKYFQGFHNKFELKAEANGIDEYEYEYGVNGRFQRGFATLPEAVTKKLKATGYRFHDTTKEDALTSEDLTAIPQPKVDSSTVTPGEV
Major tail protein J 193 Staphylococcus Phage 80Alpha MANMKNSNDRIILFRKAGEKVDATKMLFLTEYGLSHEADTDTEDTMDGSYNTGGSVESTMSGTAKMFYGDDFADEIEDAVVDRVLYEAWEVESRIPGKNGDSAKFKAKYFQGFHNKFELKAEANGIDEYEYEYGVNGRFQRGFATLPEAVTKKLKATGYRFHDTTKEDALTSEDLTAIPQPKVDSSTVTPGEV
DUF3168 domain-containing protein V 127 Staphylococcus Phage 80Alpha MTPNLQLYNKAYETLQGYGFPVISRKEMQQEIPYPFFVIKMPESNRSKYTFDSYSGDTNLVIDIWSVSDDLGHHDGLVKRCIDDLTPSVKTNDYDFEEDDTNITQLVDDTTNQELLHTSITISYKTF
Tape measure protein N 1154 Staphylococcus Phage 80Alpha MTEYKIKATIEASVAKFKRQIDSAVKSVQRFKRVADQTKDVELNANDKKLQKTIKVAKKSLDAFSNKNVKAKLDASIQDLQQKILESNFELDKLNSKEASPEVKLQKQKLTKDIAEAENKLSELEKKRVNIDVNADNSKFNRVLKVSKASLEALNRSKAKAILDVDNSVANSKIKRTKEELKSIPNKTRSRLDVDTRLSIPTIYAFKKSLDALPNKKTTKVDVDTNGLKKVYAYIIKANDNFQRQMGNLANMFRVFGTVGSNMVGGLLTSSFSILIPVIASVVPVVFALLNAIKVLTGGVLALGGAVAIAGAGFVAFGAMAISAIKMLNDGTLQASSATNEYKKALDGVKSAWTDIIKQNQSAIFTTLANGLNTVKTAMQSLQPFFSGISRGMEEASQSVLKWAENSSVASRFFNMMNTTGVSVFNKLLSAAGGFGDGLVNVFTQLAPLFQWSADWLDRLGQSFSNWANSAAGENSITRFIEYTKTNLPIIGNIFKNVFAGINNLMNAFSGSSTGIFQSLEQMTAKFREWSEQVGQSQGFKDFVSYIQTNGPLIMQLIGNIARGLVAFATAMAPIASAVLRVAVAITGWIANLFEAHPATAQLVGVIITLVGAFRFLIAPILAVMDFLGPLAARLVALVTKFGWAKTGTLVLSKAMTSLKGPIKLVTAIFQLLFGKIGLIRNAITGLVTVFGILGGPITIVIGVIAALIAIFVLLWNKNEGFRNFIINAWNAIKTFMVNVWNVLKAVASVVWNAILTAITTAVSNVYNFIMIVWNQIVAYLQGLWNGIIAIATTVWNLLVTIITTVFTTIMTIVMTIWTAIWTFLSTIWNTIITIATTIWNLLVTVITTVFTTIMTIAMTIWNAIWTFLQTLWNTIVTVATKVWNAITTAISTALQAAWSFISNIWNTIWSFLSGILTTIWNKVVSIFTQVVSTISDKMSQAWNFIVTKGMQWVSTITSTLINFVNRVIQGFVNVVNKVSQGMTNAVNKIKSFIGDFVSAGADMIRGLIRGIGQMAGQLVDAAKNVAKKALDAAKSALGIHSPSREFMDVGMYSMLGFVKGIDNHSSKVIRNVSNVADKVVDAFQPTLNAPDISSITGNLSNLGGNINAQVQHTHSIETSPNMKTVKVEFDVNNDALTSIVNGRNAKRNSEYYL
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Major tail protein X 193 Staphylococcus Phage 80Alpha MANMKNSNDRIILFRKAGEKVDATKMLFLTEYGLSHEADTDTEDTMDGSYNTGGSVESTMSGTAKMFYGDDFADEIEDAVVDRVLYEAWEVESRIPGKNGDSAKFKAKYFQGFHNKFELKAEANGIDEYEYEYGVNGRFQRGFATLPEAVTKKLKATGYRFHDTTKEDALTSEDLTAIPQPKVDSSTVTPGEV
Tape measure protein O 1154 Staphylococcus Phage 80Alpha MTEYKIKATIEASVAKFKRQIDSAVKSVQRFKRVADQTKDVELNANDKKLQKTIKVAKKSLDAFSNKNVKAKLDASIQDLQQKILESNFELDKLNSKEASPEVKLQKQKLTKDIAEAENKLSELEKKRVNIDVNADNSKFNRVLKVSKASLEALNRSKAKAILDVDNSVANSKIKRTKEELKSIPNKTRSRLDVDTRLSIPTIYAFKKSLDALPNKKTTKVDVDTNGLKKVYAYIIKANDNFQRQMGNLANMFRVFGTVGSNMVGGLLTSSFSILIPVIASVVPVVFALLNAIKVLTGGVLALGGAVAIAGAGFVAFGAMAISAIKMLNDGTLQASSATNEYKKALDGVKSAWTDIIKQNQSAIFTTLANGLNTVKTAMQSLQPFFSGISRGMEEASQSVLKWAENSSVASRFFNMMNTTGVSVFNKLLSAAGGFGDGLVNVFTQLAPLFQWSADWLDRLGQSFSNWANSAAGENSITRFIEYTKTNLPIIGNIFKNVFAGINNLMNAFSGSSTGIFQSLEQMTAKFREWSEQVGQSQGFKDFVSYIQTNGPLIMQLIGNIARGLVAFATAMAPIASAVLRVAVAITGWIANLFEAHPATAQLVGVIITLVGAFRFLIAPILAVMDFLGPLAARLVALVTKFGWAKTGTLVLSKAMTSLKGPIKLVTAIFQLLFGKIGLIRNAITGLVTVFGILGGPITIVIGVIAALIAIFVLLWNKNEGFRNFIINAWNAIKTFMVNVWNVLKAVASVVWNAILTAITTAVSNVYNFIMIVWNQIVAYLQGLWNGIIAIATTVWNLLVTIITTVFTTIMTIVMTIWTAIWTFLSTIWNTIITIATTIWNLLVTVITTVFTTIMTIAMTIWNAIWTFLQTLWNTIVTVATKVWNAITTAISTALQAAWSFISNIWNTIWSFLSGILTTIWNKVVSIFTQVVSTISDKMSQAWNFIVTKGMQWVSTITSTLINFVNRVIQGFVNVVNKVSQGMTNAVNKIKSFIGDFVSAGADMIRGLIRGIGQMAGQLVDAAKNVAKKALDAAKSALGIHSPSREFMDVGMYSMLGFVKGIDNHSSKVIRNVSNVADKVVDAFQPTLNAPDISSITGNLSNLGGNINAQVQHTHSIETSPNMKTVKVEFDVNNDALTSIVNGRNAKRNSEYYL
HK97 gp10 family phage protein P 115 Staphylococcus Phage 80Alpha MNIDGLDALLNQFHDMKTNIDDDVDDILQENAKEYVVRAKLKAREVMNKGYWTGNLSRNIRYKKTGDLQYTITSHAAYSGFLEFGTRYMEAEPFMWPVYEVIRKSTVEELKALFE

Nucleic Acids / Hybrid
Molecule Chains Sequence Length Organism Sequence
DNA, 5'-3' q 16181 NA 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Experimental Data

Method: ELECTRON MICROSCOPY

Deposited Date: 2025-01-13
Deposition Author(s): Dokland, T. , Kizziah, J.L.