Cryo-em structure of designed zinc-induced icosahedron cage-i53-zn1-hehe-14
PDB DOI: 10.2210/pdb9k7y/pdb
Classification: METAL BINDING PROTEIN Organism(s): Escherichia Coli
Deposited: 2024-10-24 Deposition Author(s): Cao, L.X. , Qu, Y.N.
| Proteins | ||||
|---|---|---|---|---|
| Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Sequence |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | A | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | B | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | C | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | D | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | E | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | F | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | Q | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | M | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | X | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | G | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | R | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | N | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | Y | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | H | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | S | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | O | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | Z | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | I | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | T | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | P | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | 0 | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | J | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | U | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | 1 | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | K | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | V | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | 2 | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | L | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | W | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | 3 | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | 4 | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | 5 | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | 6 | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
| Cage-i53-Zn1-HEHE-14 | 7 | 256 | Escherichia Coli | MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTTEKLKKITKLLHELVDRGEIPEELATLATLLLYLVEKGLISEFDFIEHLVRLAEKLGVLEELKKVLEEVGDEFGLTLVYAISLLKEVEKEGDEELKEYVKLAIETLKEAFERKNYALLVSAKIIVENAEEILKAKKKGDEEKIKELLQRLKAAKIGTPLVREVVERYREEGEPLLDLLLHMAETTIRESEKLGVDPRLAAEVAREMVDGVGHETGETEAAFRVRRELDTVIL |
Method: ELECTRON MICROSCOPY