Cryo-em structure of glomalin (a group i chaperonin) from rhizophagus irregularis bgc bj09
PDB DOI: 10.2210/pdb9k47/pdb
Classification: CHAPERONE Organism(s): Rhizophagus Irregularis
Deposited: 2024-10-21 Deposition Author(s): Jia, M. , Tan, W. , Wang, Y.
| Proteins | ||||
|---|---|---|---|---|
| Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Sequence |
| glomalin | A | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | B | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | C | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | D | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | E | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | F | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | G | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | H | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | I | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | J | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | K | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | L | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | M | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
| glomalin | N | 595 | Rhizophagus Irregularis | MHHHHHHQRVSQFFNKAPHITIPPSLSMVSRNSKRPFLSRFYATHKELKFGVEGRASLLKGVDILAKAVAVTLGPKGRNVLIEQPYGSPKITKDGVTVAKSISLKDKFENLGARLVQDVANKTNEVAGDGTTTATILTRAIFAEGVKNVAAGCNPMDLRRGVQMAVDSIVKFLREKSRVITTSEEIAQVATISANGDTHVGKLIANAMEKVGKEGVITVKEGKTIEDELEITEGMRFDRGYISPYFITDAKTQKVEFEKPLILLTEKKISILQDILPALETSSTQRRPLLIIAEDIDGEALAACILNKLRGNLQVAAVKAPGFGDNRKSILGDLAILTGGTVFSDELDIKLERATPDLFGSTGSVTITKEDTILLNGEGSKDMINQRCEQIRAAINDSSVSDYEREKLQERLAKLSGGVAVIKVGGSSELEVGEKKDRFVDALNATRAAVEEGTVPGGGVALLKSTKCLDKLTPGNFDQQLGINIIKSALQKPAKIIADNAGEEGAVIVGKILDNHTDDFNYGYDAAKSEYGDLVSRGIVDPLKVVRTALVDASGVASLLTTTECTITEAPEENKTAGGMGRMGGMGGMGDMGMM |
Method: ELECTRON MICROSCOPY