PDBi (Protein Data Bank in India)

All in One Protein Databank
Home About Help Resources External Links Contact Us
Advanced Search
FASTA Sequence PDB Format mmCIF Format
FASTA Sequence PDB Format PDB Format(gz) PDBx/mmCIF Format PDBx/mmCIF Format(gz) PDBML/XML Format Validation Full PDF Validation CIF

8AXL

Outer membrane secretin pore of the type 3 secretion system of shigella flexneri

PDB DOI: 10.2210/pdb8axl/pdb

Classification: PROTEIN TRANSPORT
Organism(s): Shigella Flexneri

Deposited: 2022-08-31
Deposition Author(s): Lunelli, M.

Experimental Data Snapshot

Method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3.42 Å

8axl
Literature

Outer membrane secretin pore of the type 3 secretion system of shigella flexneri

Lunelli, M.

Primary Citation of Related Structures: 8AXL


Proteins
Molecule Chains Sequence Length Organism Sequence
Outer membrane protein MxiD A 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD O 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD B 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD C 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD D 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD E 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD F 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD G 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD H 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD I 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD J 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD K 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD L 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD M 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Outer membrane protein MxiD N 566 Shigella Flexneri MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNPEEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVELVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNITQKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDVAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGVNWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSSLEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNSNEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSLVSYLNY
Experimental Data

Method: ELECTRON MICROSCOPY

Deposited Date: 2022-08-31
Deposition Author(s): Lunelli, M.