Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna and cognate trnalys in the a-site Deposition Author(s): Demeshkina, N. , Khusainov, I. , Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2015-10-12 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.2 Å Organism(s): Escherichia Coli , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 5E7K_13 , 5E7K_1G , 5E7K_1I , 5E7K_1A , 5E7K_2I , 5E7K_2A , 5E7K_3I , 5E7K_3A , 5E7K_4I , 5E7K_4A , 5E7K_5I , 5E7K_5A , 5E7K_6I , 5E7K_6A , 5E7K_7I , 5E7K_7A , 5E7K_8I , 5E7K_8A , 5E7K_9I , 5E7K_9A , 5E7K_AI , 5E7K_AA , 5E7K_1E , 5E7K_12 , 5E7K_BI , 5E7K_BA , 5E7K_1F , 5E7K_1B , 5E7K_1K , 5E7K_2K , 5E7K_2L , 5E7K_3K , 5E7K_4K , 5E7K_4L , 5E7K_1H , 5E7K_14 , 5E7K_16 , 5E7K_1J , 5E7K_71 , 5E7K_79 , 5E7K_11 , 5E7K_19 , 5E7K_2E , 5E7K_22 , 5E7K_21 , 5E7K_29 , 5E7K_31 , 5E7K_39 , 5E7K_41 , 5E7K_49 , 5E7K_51 , 5E7K_59 , 5E7K_61 , 5E7K_69 , 5E7K_58 , 5E7K_15 , 5E7K_68 , 5E7K_25 , 5E7K_78 , 5E7K_35 , 5E7K_88 , 5E7K_45 , 5E7K_98 , 5E7K_55 , 5E7K_3E , 5E7K_32 , 5E7K_A8 , 5E7K_65 , 5E7K_B8 , 5E7K_75 , 5E7K_C8 , 5E7K_85 , 5E7K_D8 , 5E7K_95 , 5E7K_E8 , 5E7K_A5 , 5E7K_F8 , 5E7K_B5 , 5E7K_G8 , 5E7K_C5 , 5E7K_H8 , 5E7K_D5 , 5E7K_I8 , 5E7K_E5 , 5E7K_J8 , 5E7K_F5 , 5E7K_4E , 5E7K_42 , 5E7K_K8 , 5E7K_G5 , 5E7K_L8 , 5E7K_H5 , 5E7K_M8 , 5E7K_N8 , 5E7K_J5 , 5E7K_P8 , 5E7K_L5 , 5E7K_Q8 , 5E7K_M5 , 5E7K_1L , 5E7K_3L , 5E7K_5E , 5E7K_52 , 5E7K_6E , 5E7K_62 , 5E7K_7E , 5E7K_72 , 5E7K_8E , 5E7K_82
Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna and trnalys in the a-site with wobble pair Deposition Author(s): Demeshkina, N. , Khusainov, I. , Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2015-10-13 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 2.95 Å Organism(s): Escherichia Coli , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 5E81_13 , 5E81_1G , 5E81_1I , 5E81_1A , 5E81_2I , 5E81_2A , 5E81_3I , 5E81_3A , 5E81_4I , 5E81_4A , 5E81_5I , 5E81_5A , 5E81_6I , 5E81_6A , 5E81_7I , 5E81_7A , 5E81_8I , 5E81_8A , 5E81_9I , 5E81_9A , 5E81_AI , 5E81_AA , 5E81_1E , 5E81_12 , 5E81_BI , 5E81_BA , 5E81_1F , 5E81_1B , 5E81_1K , 5E81_1L , 5E81_2K , 5E81_2L , 5E81_3K , 5E81_3L , 5E81_4K , 5E81_4L , 5E81_1H , 5E81_14 , 5E81_16 , 5E81_1J , 5E81_71 , 5E81_79 , 5E81_11 , 5E81_19 , 5E81_2E , 5E81_22 , 5E81_21 , 5E81_29 , 5E81_31 , 5E81_39 , 5E81_41 , 5E81_49 , 5E81_51 , 5E81_59 , 5E81_61 , 5E81_69 , 5E81_58 , 5E81_15 , 5E81_68 , 5E81_25 , 5E81_78 , 5E81_35 , 5E81_88 , 5E81_45 , 5E81_98 , 5E81_55 , 5E81_3E , 5E81_32 , 5E81_A8 , 5E81_65 , 5E81_B8 , 5E81_75 , 5E81_C8 , 5E81_85 , 5E81_D8 , 5E81_95 , 5E81_E8 , 5E81_A5 , 5E81_F8 , 5E81_B5 , 5E81_G8 , 5E81_C5 , 5E81_H8 , 5E81_D5 , 5E81_I8 , 5E81_E5 , 5E81_J8 , 5E81_F5 , 5E81_4E , 5E81_42 , 5E81_K8 , 5E81_G5 , 5E81_L8 , 5E81_H5 , 5E81_M8 , 5E81_N8 , 5E81_J5 , 5E81_P8 , 5E81_L5 , 5E81_Q8 , 5E81_M5 , 5E81_5E , 5E81_52 , 5E81_6E , 5E81_62 , 5E81_7E , 5E81_72 , 5E81_8E , 5E81_82
Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna and trnalys in the a-site with a u-u mismatch in the first position Deposition Author(s): Demeshkina, N. , Khusainov, I. , Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2015-11-04 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.15 Å Organism(s): Escherichia Coli K-12 , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 5EL4_13 , 5EL4_1G , 5EL4_1I , 5EL4_1A , 5EL4_2I , 5EL4_2A , 5EL4_3I , 5EL4_3A , 5EL4_4I , 5EL4_4A , 5EL4_5I , 5EL4_5A , 5EL4_6I , 5EL4_6A , 5EL4_7I , 5EL4_7A , 5EL4_8I , 5EL4_8A , 5EL4_9I , 5EL4_9A , 5EL4_AI , 5EL4_AA , 5EL4_1E , 5EL4_12 , 5EL4_BI , 5EL4_BA , 5EL4_1F , 5EL4_1B , 5EL4_1K , 5EL4_2K , 5EL4_2L , 5EL4_3K , 5EL4_4K , 5EL4_4L , 5EL4_1H , 5EL4_14 , 5EL4_16 , 5EL4_1J , 5EL4_71 , 5EL4_11 , 5EL4_19 , 5EL4_2E , 5EL4_22 , 5EL4_21 , 5EL4_29 , 5EL4_31 , 5EL4_39 , 5EL4_41 , 5EL4_49 , 5EL4_51 , 5EL4_59 , 5EL4_61 , 5EL4_69 , 5EL4_58 , 5EL4_15 , 5EL4_68 , 5EL4_25 , 5EL4_78 , 5EL4_35 , 5EL4_88 , 5EL4_45 , 5EL4_98 , 5EL4_55 , 5EL4_3E , 5EL4_32 , 5EL4_A8 , 5EL4_65 , 5EL4_B8 , 5EL4_75 , 5EL4_C8 , 5EL4_85 , 5EL4_D8 , 5EL4_95 , 5EL4_E8 , 5EL4_A5 , 5EL4_F8 , 5EL4_B5 , 5EL4_G8 , 5EL4_C5 , 5EL4_H8 , 5EL4_D5 , 5EL4_I8 , 5EL4_E5 , 5EL4_J8 , 5EL4_F5 , 5EL4_4E , 5EL4_42 , 5EL4_K8 , 5EL4_G5 , 5EL4_L8 , 5EL4_H5 , 5EL4_M8 , 5EL4_N8 , 5EL4_J5 , 5EL4_P8 , 5EL4_L5 , 5EL4_Q8 , 5EL4_M5 , 5EL4_1L , 5EL4_3L , 5EL4_5E , 5EL4_52 , 5EL4_6E , 5EL4_62 , 5EL4_7E , 5EL4_72 , 5EL4_8E , 5EL4_82
Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna and trnalys in the a-site with a u-u mismatch in the second position Deposition Author(s): Demeshkina, N. , Khusainov, I. , Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2015-11-04 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.15 Å Organism(s): Escherichia Coli K-12 , Thermus Thermophilus Hb8 Sequences Data: 5EL5_13 , 5EL5_1G , 5EL5_1I , 5EL5_1A , 5EL5_2I , 5EL5_2A , 5EL5_3I , 5EL5_3A , 5EL5_4I , 5EL5_4A , 5EL5_5I , 5EL5_5A , 5EL5_6I , 5EL5_6A , 5EL5_7I , 5EL5_7A , 5EL5_8I , 5EL5_8A , 5EL5_9I , 5EL5_9A , 5EL5_AI , 5EL5_AA , 5EL5_1E , 5EL5_12 , 5EL5_BI , 5EL5_BA , 5EL5_1F , 5EL5_1B , 5EL5_1K , 5EL5_2K , 5EL5_2L , 5EL5_3K , 5EL5_4K , 5EL5_4L , 5EL5_1H , 5EL5_14 , 5EL5_16 , 5EL5_1J , 5EL5_71 , 5EL5_11 , 5EL5_19 , 5EL5_2E , 5EL5_22 , 5EL5_21 , 5EL5_29 , 5EL5_31 , 5EL5_39 , 5EL5_41 , 5EL5_49 , 5EL5_51 , 5EL5_59 , 5EL5_61 , 5EL5_69 , 5EL5_58 , 5EL5_15 , 5EL5_68 , 5EL5_25 , 5EL5_78 , 5EL5_35 , 5EL5_88 , 5EL5_45 , 5EL5_98 , 5EL5_55 , 5EL5_3E , 5EL5_32 , 5EL5_A8 , 5EL5_65 , 5EL5_B8 , 5EL5_75 , 5EL5_C8 , 5EL5_85 , 5EL5_D8 , 5EL5_95 , 5EL5_E8 , 5EL5_A5 , 5EL5_F8 , 5EL5_B5 , 5EL5_G8 , 5EL5_C5 , 5EL5_H8 , 5EL5_D5 , 5EL5_I8 , 5EL5_E5 , 5EL5_J8 , 5EL5_F5 , 5EL5_4E , 5EL5_42 , 5EL5_K8 , 5EL5_G5 , 5EL5_L8 , 5EL5_H5 , 5EL5_M8 , 5EL5_N8 , 5EL5_J5 , 5EL5_P8 , 5EL5_L5 , 5EL5_Q8 , 5EL5_M5 , 5EL5_1L , 5EL5_3L , 5EL5_5E , 5EL5_52 , 5EL5_6E , 5EL5_62 , 5EL5_7E , 5EL5_72 , 5EL5_8E , 5EL5_82
Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna and trnalys in the a-site with a u-u mismatch in the first position and antibiotic paromomycin Deposition Author(s): Demeshkina, N. , Khusainov, I. , Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2015-11-04 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.1 Å Organism(s): Escherichia Coli K-12 , Escherichia Coli K-12 , Thermus Thermophilus , Thermus Thermophilus (Strain Hb8 / Atcc 27634 / Dsm 579) , Thermus Thermophilus Hb8 Sequences Data: 5EL6_13 , 5EL6_1G , 5EL6_1I , 5EL6_1A , 5EL6_2I , 5EL6_2A , 5EL6_3I , 5EL6_3A , 5EL6_4I , 5EL6_4A , 5EL6_5I , 5EL6_5A , 5EL6_6I , 5EL6_6A , 5EL6_7I , 5EL6_7A , 5EL6_8I , 5EL6_8A , 5EL6_9I , 5EL6_9A , 5EL6_AI , 5EL6_AA , 5EL6_1E , 5EL6_12 , 5EL6_BI , 5EL6_BA , 5EL6_1F , 5EL6_1B , 5EL6_1K , 5EL6_1L , 5EL6_2K , 5EL6_2L , 5EL6_3K , 5EL6_3L , 5EL6_4K , 5EL6_4L , 5EL6_1H , 5EL6_14 , 5EL6_16 , 5EL6_1J , 5EL6_71 , 5EL6_79 , 5EL6_11 , 5EL6_19 , 5EL6_2E , 5EL6_22 , 5EL6_21 , 5EL6_29 , 5EL6_31 , 5EL6_39 , 5EL6_41 , 5EL6_49 , 5EL6_51 , 5EL6_59 , 5EL6_61 , 5EL6_69 , 5EL6_58 , 5EL6_15 , 5EL6_68 , 5EL6_25 , 5EL6_78 , 5EL6_35 , 5EL6_88 , 5EL6_45 , 5EL6_98 , 5EL6_55 , 5EL6_3E , 5EL6_32 , 5EL6_A8 , 5EL6_65 , 5EL6_B8 , 5EL6_75 , 5EL6_C8 , 5EL6_85 , 5EL6_D8 , 5EL6_95 , 5EL6_E8 , 5EL6_A5 , 5EL6_F8 , 5EL6_B5 , 5EL6_G8 , 5EL6_C5 , 5EL6_H8 , 5EL6_D5 , 5EL6_I8 , 5EL6_E5 , 5EL6_J8 , 5EL6_F5 , 5EL6_4E , 5EL6_42 , 5EL6_K8 , 5EL6_G5 , 5EL6_L8 , 5EL6_H5 , 5EL6_M8 , 5EL6_N8 , 5EL6_J5 , 5EL6_P8 , 5EL6_L5 , 5EL6_Q8 , 5EL6_M5 , 5EL6_5E , 5EL6_52 , 5EL6_6E , 5EL6_62 , 5EL6_7E , 5EL6_72 , 5EL6_8E , 5EL6_82
Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna and trnalys in the a-site with a u-u mismatch in the second position and antibiotic paromomycin Deposition Author(s): Demeshkina, N. , Khusainov, I. , Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2015-11-04 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.15 Å Organism(s): Escherichia Coli K-12 , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 5EL7_13 , 5EL7_1G , 5EL7_1I , 5EL7_1A , 5EL7_2I , 5EL7_2A , 5EL7_3I , 5EL7_3A , 5EL7_4I , 5EL7_4A , 5EL7_5I , 5EL7_5A , 5EL7_6I , 5EL7_6A , 5EL7_7I , 5EL7_7A , 5EL7_8I , 5EL7_8A , 5EL7_9I , 5EL7_9A , 5EL7_AI , 5EL7_AA , 5EL7_1E , 5EL7_12 , 5EL7_BI , 5EL7_BA , 5EL7_1F , 5EL7_1B , 5EL7_1K , 5EL7_1L , 5EL7_2K , 5EL7_2L , 5EL7_3K , 5EL7_4K , 5EL7_4L , 5EL7_1H , 5EL7_14 , 5EL7_16 , 5EL7_1J , 5EL7_71 , 5EL7_79 , 5EL7_11 , 5EL7_19 , 5EL7_2E , 5EL7_22 , 5EL7_21 , 5EL7_29 , 5EL7_31 , 5EL7_39 , 5EL7_41 , 5EL7_49 , 5EL7_51 , 5EL7_59 , 5EL7_61 , 5EL7_69 , 5EL7_58 , 5EL7_15 , 5EL7_68 , 5EL7_25 , 5EL7_78 , 5EL7_35 , 5EL7_88 , 5EL7_45 , 5EL7_98 , 5EL7_55 , 5EL7_3E , 5EL7_32 , 5EL7_A8 , 5EL7_65 , 5EL7_B8 , 5EL7_75 , 5EL7_C8 , 5EL7_85 , 5EL7_D8 , 5EL7_95 , 5EL7_E8 , 5EL7_A5 , 5EL7_F8 , 5EL7_B5 , 5EL7_G8 , 5EL7_C5 , 5EL7_H8 , 5EL7_D5 , 5EL7_I8 , 5EL7_E5 , 5EL7_J8 , 5EL7_F5 , 5EL7_4E , 5EL7_42 , 5EL7_K8 , 5EL7_G5 , 5EL7_L8 , 5EL7_H5 , 5EL7_M8 , 5EL7_N8 , 5EL7_J5 , 5EL7_P8 , 5EL7_L5 , 5EL7_Q8 , 5EL7_M5 , 5EL7_3L , 5EL7_5E , 5EL7_52 , 5EL7_6E , 5EL7_62 , 5EL7_7E , 5EL7_72 , 5EL7_8E , 5EL7_82
70s ribosome from staphylococcus aureus Deposition Author(s): Bochler, A. , Chicher, J. , Grosse, F. , Hashem, Y. , Khusainov, I. , Marzi, S. , Menetret, J.F. , Myasnikov, A. , Romby, P. , Vicens, Q. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2016-07-13 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 3.8 Å Organism(s): Staphylococcus Aureus (Strain Nctc 8325) Sequences Data: 5LI0_A , 5LI0_J , 5LI0_K , 5LI0_L , 5LI0_M , 5LI0_N , 5LI0_O , 5LI0_P , 5LI0_Q , 5LI0_R , 5LI0_S , 5LI0_B , 5LI0_T , 5LI0_D , 5LI0_E , 5LI0_F , 5LI0_G , 5LI0_H , 5LI0_C , 5LI0_U , 5LI0_V , 5LI0_W , 5LI0_X , 5LI0_Y , 5LI0_Z , 5LI0_0 , 5LI0_1 , 5LI0_2 , 5LI0_3 , 5LI0_4 , 5LI0_5 , 5LI0_6 , 5LI0_7 , 5LI0_8 , 5LI0_I
Hibernating ribosome from staphylococcus aureus (unrotated state) Deposition Author(s): Ayupov, R. , Hashem, Y. , Khusainov, I. , Kieffer, B. , Myasnikov, A. , Simonetti, A. , Usachev, K. , Validov, S. , Vicens, Q. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2017-03-07 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 3.7 Å Organism(s): Staphylococcus Aureus (Strain Nctc 8325) , Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nctc 8325 Sequences Data: 5ND8_A , 5ND8_J , 5ND8_K , 5ND8_L , 5ND8_M , 5ND8_N , 5ND8_O , 5ND8_P , 5ND8_Q , 5ND8_R , 5ND8_S , 5ND8_B , 5ND8_T , 5ND8_U , 5ND8_V , 5ND8_D , 5ND8_E , 5ND8_F , 5ND8_G , 5ND8_H , 5ND8_C , 5ND8_W , 5ND8_X , 5ND8_Y , 5ND8_Z , 5ND8_0 , 5ND8_1 , 5ND8_2 , 5ND8_3 , 5ND8_4 , 5ND8_5 , 5ND8_6 , 5ND8_7 , 5ND8_8 , 5ND8_I
Hibernating ribosome from staphylococcus aureus (rotated state) Deposition Author(s): Ayupov, R. , Hashem, Y. , Khusainov, I. , Kieffer, B. , Myasnikov, A. , Simonetti, A. , Usachev, K. , Validov, S. , Vicens, Q. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2017-03-07 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 3.7 Å Organism(s): Staphylococcus Aureus (Strain Nctc 8325) , Staphylococcus Aureus Subsp. Aureus Nctc 8325 Sequences Data: 5ND9_A , 5ND9_J , 5ND9_K , 5ND9_L , 5ND9_M , 5ND9_N , 5ND9_O , 5ND9_P , 5ND9_Q , 5ND9_R , 5ND9_S , 5ND9_B , 5ND9_T , 5ND9_U , 5ND9_V , 5ND9_D , 5ND9_E , 5ND9_F , 5ND9_G , 5ND9_H , 5ND9_C , 5ND9_W , 5ND9_X , 5ND9_Y , 5ND9_Z , 5ND9_0 , 5ND9_1 , 5ND9_2 , 5ND9_3 , 5ND9_4 , 5ND9_5 , 5ND9_6 , 5ND9_7 , 5ND9_8 , 5ND9_I
70s ribosome initiation complex (ic) with experimentally assigned potassium ions Deposition Author(s): Khusainov, I. , Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2019-02-11 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.5 Å Organism(s): Escherichia Coli K-12 , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 6QNQ_13 , 6QNQ_1G , 6QNQ_1I , 6QNQ_1A , 6QNQ_2I , 6QNQ_2A , 6QNQ_3I , 6QNQ_3A , 6QNQ_4I , 6QNQ_4A , 6QNQ_5I , 6QNQ_5A , 6QNQ_6I , 6QNQ_6A , 6QNQ_7I , 6QNQ_7A , 6QNQ_8I , 6QNQ_8A , 6QNQ_9I , 6QNQ_9A , 6QNQ_AI , 6QNQ_AA , 6QNQ_1E , 6QNQ_12 , 6QNQ_BI , 6QNQ_BA , 6QNQ_1F , 6QNQ_1B , 6QNQ_1K , 6QNQ_3K , 6QNQ_3L , 6QNQ_2K , 6QNQ_4K , 6QNQ_4L , 6QNQ_1H , 6QNQ_14 , 6QNQ_16 , 6QNQ_1J , 6QNQ_71 , 6QNQ_11 , 6QNQ_19 , 6QNQ_21 , 6QNQ_29 , 6QNQ_2E , 6QNQ_22 , 6QNQ_31 , 6QNQ_39 , 6QNQ_41 , 6QNQ_49 , 6QNQ_51 , 6QNQ_59 , 6QNQ_61 , 6QNQ_69 , 6QNQ_38 , 6QNQ_58 , 6QNQ_15 , 6QNQ_68 , 6QNQ_25 , 6QNQ_78 , 6QNQ_35 , 6QNQ_88 , 6QNQ_45 , 6QNQ_98 , 6QNQ_55 , 6QNQ_3E , 6QNQ_32 , 6QNQ_A8 , 6QNQ_65 , 6QNQ_B8 , 6QNQ_75 , 6QNQ_C8 , 6QNQ_85 , 6QNQ_D8 , 6QNQ_95 , 6QNQ_E8 , 6QNQ_A5 , 6QNQ_F8 , 6QNQ_B5 , 6QNQ_G8 , 6QNQ_C5 , 6QNQ_H8 , 6QNQ_D5 , 6QNQ_I8 , 6QNQ_E5 , 6QNQ_J8 , 6QNQ_F5 , 6QNQ_4E , 6QNQ_42 , 6QNQ_K8 , 6QNQ_G5 , 6QNQ_L8 , 6QNQ_H5 , 6QNQ_M8 , 6QNQ_I5 , 6QNQ_N8 , 6QNQ_J5 , 6QNQ_O8 , 6QNQ_K5 , 6QNQ_P8 , 6QNQ_L5 , 6QNQ_Q8 , 6QNQ_M5 , 6QNQ_2L , 6QNQ_5E , 6QNQ_52 , 6QNQ_6E , 6QNQ_62 , 6QNQ_7E , 6QNQ_72 , 6QNQ_8E , 6QNQ_82