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4V9C
Allosteric control of the ribosome by small-molecule antibiotics Deposition Author(s): Altman, R. , Blanchard, S.C. , Cate, J.H.D. , Feldman, M.B. , Pulk, A. , Wang, L. , Wasserman, M.R.
Date: 2012-07-25 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.3 Å Organism(s): Escherichia Coli , Synthetic Construct Sequences Data: 4V9C_AA , 4V9C_CA , 4V9C_AJ , 4V9C_CJ , 4V9C_AK , 4V9C_CK , 4V9C_AL , 4V9C_CL , 4V9C_AM , 4V9C_CM , 4V9C_AN , 4V9C_CN , 4V9C_AO , 4V9C_CO , 4V9C_AP , 4V9C_CP , 4V9C_AQ , 4V9C_CQ , 4V9C_AR , 4V9C_CR , 4V9C_AS , 4V9C_CS , 4V9C_AB , 4V9C_CB , 4V9C_AT , 4V9C_CT , 4V9C_AU , 4V9C_CU , 4V9C_AV , 4V9C_CV , 4V9C_AX , 4V9C_CX , 4V9C_BA , 4V9C_DA , 4V9C_BB , 4V9C_DB , 4V9C_BC , 4V9C_DC , 4V9C_BD , 4V9C_DD , 4V9C_BE , 4V9C_DE , 4V9C_BF , 4V9C_DF , 4V9C_AC , 4V9C_CC , 4V9C_BG , 4V9C_DG , 4V9C_BH , 4V9C_DH , 4V9C_BI , 4V9C_DI , 4V9C_BJ , 4V9C_DJ , 4V9C_BK , 4V9C_DK , 4V9C_BL , 4V9C_DL , 4V9C_BM , 4V9C_DM , 4V9C_BN , 4V9C_DN , 4V9C_BO , 4V9C_DO , 4V9C_BP , 4V9C_DP , 4V9C_AD , 4V9C_CD , 4V9C_BQ , 4V9C_DQ , 4V9C_BR , 4V9C_DR , 4V9C_BS , 4V9C_DS , 4V9C_BT , 4V9C_DT , 4V9C_BU , 4V9C_DU , 4V9C_BV , 4V9C_DV , 4V9C_BW , 4V9C_DW , 4V9C_BX , 4V9C_DX , 4V9C_BY , 4V9C_DY , 4V9C_BZ , 4V9C_DZ , 4V9C_AE , 4V9C_CE , 4V9C_B0 , 4V9C_D0 , 4V9C_B1 , 4V9C_D1 , 4V9C_B2 , 4V9C_D2 , 4V9C_B3 , 4V9C_D3 , 4V9C_B4 , 4V9C_D4 , 4V9C_CY , 4V9C_AF , 4V9C_CF , 4V9C_AG , 4V9C_CG , 4V9C_AH , 4V9C_CH , 4V9C_AI , 4V9C_CI
4V9D
Structures of the bacterial ribosome in classical and hybrid states of trna binding Deposition Author(s): Blanchard, S.C. , Cate, J.H.D. , Chen, V.B. , Dunkle, J.A. , Feldman, M.B. , Kapral, G.J. , Noeske, J. , Pulk, A. , Richardson, J.S. , Wang, L.
Date: 2012-07-31 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3 Å Organism(s): Escherichia Coli , Synthetic Construct Sequences Data: 4V9D_AA , 4V9D_BA , 4V9D_AJ , 4V9D_BJ , 4V9D_AK , 4V9D_BK , 4V9D_AL , 4V9D_BL , 4V9D_AM , 4V9D_BM , 4V9D_AN , 4V9D_BN , 4V9D_AO , 4V9D_BO , 4V9D_AP , 4V9D_BP , 4V9D_AQ , 4V9D_BQ , 4V9D_AR , 4V9D_BR , 4V9D_AS , 4V9D_BS , 4V9D_AB , 4V9D_BB , 4V9D_AT , 4V9D_BT , 4V9D_AU , 4V9D_BU , 4V9D_AV , 4V9D_BV , 4V9D_AX , 4V9D_BX , 4V9D_AY , 4V9D_CA , 4V9D_DA , 4V9D_CB , 4V9D_CC , 4V9D_DC , 4V9D_CD , 4V9D_DD , 4V9D_CE , 4V9D_DE , 4V9D_AC , 4V9D_BC , 4V9D_CF , 4V9D_DF , 4V9D_CG , 4V9D_DG , 4V9D_CH , 4V9D_DH , 4V9D_CI , 4V9D_DI , 4V9D_CJ , 4V9D_DJ , 4V9D_CK , 4V9D_DK , 4V9D_CL , 4V9D_DL , 4V9D_CM , 4V9D_DM , 4V9D_CN , 4V9D_DN , 4V9D_CO , 4V9D_DO , 4V9D_AD , 4V9D_BD , 4V9D_CP , 4V9D_DP , 4V9D_CQ , 4V9D_DQ , 4V9D_CR , 4V9D_DR , 4V9D_CS , 4V9D_DS , 4V9D_CT , 4V9D_DT , 4V9D_CU , 4V9D_DU , 4V9D_CV , 4V9D_DV , 4V9D_CW , 4V9D_CX , 4V9D_DX , 4V9D_CY , 4V9D_DY , 4V9D_AE , 4V9D_BE , 4V9D_CZ , 4V9D_DZ , 4V9D_C0 , 4V9D_D0 , 4V9D_C1 , 4V9D_D1 , 4V9D_C2 , 4V9D_D2 , 4V9D_C3 , 4V9D_D3 , 4V9D_C4 , 4V9D_D4 , 4V9D_DB , 4V9D_DW , 4V9D_AF , 4V9D_BF , 4V9D_AG , 4V9D_BG , 4V9D_AH , 4V9D_BH , 4V9D_AI , 4V9D_BI
4V9O
Control of ribosomal subunit rotation by elongation factor g Deposition Author(s): Cate, J.H.D. , Pulk, A.
Date: 2013-05-03 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 2.9 Å Organism(s): Escherichia Coli , Synthetic Construct Sequences Data: 4V9O_AB , 4V9O_CB , 4V9O_EB , 4V9O_GB , 4V9O_AJ , 4V9O_CJ , 4V9O_EJ , 4V9O_GJ , 4V9O_AK , 4V9O_CK , 4V9O_EK , 4V9O_GK , 4V9O_AL , 4V9O_CL , 4V9O_EL , 4V9O_GL , 4V9O_AM , 4V9O_CM , 4V9O_EM , 4V9O_GM , 4V9O_AN , 4V9O_CN , 4V9O_EN , 4V9O_GN , 4V9O_AO , 4V9O_CO , 4V9O_EO , 4V9O_GO , 4V9O_AP , 4V9O_CP , 4V9O_EP , 4V9O_GP , 4V9O_AQ , 4V9O_CQ , 4V9O_EQ , 4V9O_GQ , 4V9O_AR , 4V9O_CR , 4V9O_ER , 4V9O_GR , 4V9O_AS , 4V9O_CS , 4V9O_ES , 4V9O_GS , 4V9O_AC , 4V9O_CC , 4V9O_EC , 4V9O_GC , 4V9O_AT , 4V9O_CT , 4V9O_ET , 4V9O_GT , 4V9O_AU , 4V9O_CU , 4V9O_EU , 4V9O_GU , 4V9O_AV , 4V9O_CV , 4V9O_EV , 4V9O_GV , 4V9O_AW , 4V9O_CW , 4V9O_EW , 4V9O_GW , 4V9O_AX , 4V9O_CX , 4V9O_EX , 4V9O_GX , 4V9O_AY , 4V9O_CY , 4V9O_EY , 4V9O_GY , 4V9O_AZ , 4V9O_CZ , 4V9O_EZ , 4V9O_GZ , 4V9O_A0 , 4V9O_C0 , 4V9O_E0 , 4V9O_G0 , 4V9O_A1 , 4V9O_C1 , 4V9O_E1 , 4V9O_G1 , 4V9O_A2 , 4V9O_C2 , 4V9O_E2 , 4V9O_G2 , 4V9O_AA , 4V9O_CA , 4V9O_EA , 4V9O_GA , 4V9O_A3 , 4V9O_C3 , 4V9O_E3 , 4V9O_G3 , 4V9O_A4 , 4V9O_C4 , 4V9O_E4 , 4V9O_G4 , 4V9O_A5 , 4V9O_C5 , 4V9O_E5 , 4V9O_A6 , 4V9O_BB , 4V9O_DB , 4V9O_FB , 4V9O_HB , 4V9O_BA , 4V9O_DA , 4V9O_FA , 4V9O_HA , 4V9O_BC , 4V9O_DC , 4V9O_FC , 4V9O_HC , 4V9O_BD , 4V9O_DD , 4V9O_FD , 4V9O_HD , 4V9O_BE , 4V9O_DE , 4V9O_FE , 4V9O_HE , 4V9O_BF , 4V9O_DF , 4V9O_FF , 4V9O_HF , 4V9O_AD , 4V9O_CD , 4V9O_ED , 4V9O_GD , 4V9O_BG , 4V9O_DG , 4V9O_FG , 4V9O_HG , 4V9O_BH , 4V9O_DH , 4V9O_FH , 4V9O_HH , 4V9O_BI , 4V9O_DI , 4V9O_FI , 4V9O_HI , 4V9O_BJ , 4V9O_DJ , 4V9O_FJ , 4V9O_HJ , 4V9O_BK , 4V9O_DK , 4V9O_FK , 4V9O_HK , 4V9O_BL , 4V9O_DL , 4V9O_FL , 4V9O_HL , 4V9O_BM , 4V9O_DM , 4V9O_FM , 4V9O_HM , 4V9O_BN , 4V9O_DN , 4V9O_FN , 4V9O_HN , 4V9O_BO , 4V9O_DO , 4V9O_FO , 4V9O_HO , 4V9O_BP , 4V9O_DP , 4V9O_FP , 4V9O_HP , 4V9O_AE , 4V9O_CE , 4V9O_EE , 4V9O_GE , 4V9O_BQ , 4V9O_DQ , 4V9O_FQ , 4V9O_HQ , 4V9O_BR , 4V9O_DR , 4V9O_FR , 4V9O_HR , 4V9O_BS , 4V9O_DS , 4V9O_FS , 4V9O_HS , 4V9O_BT , 4V9O_DT , 4V9O_FT , 4V9O_HT , 4V9O_BU , 4V9O_DU , 4V9O_FU , 4V9O_HU , 4V9O_BV , 4V9O_DV , 4V9O_FV , 4V9O_HV , 4V9O_BW , 4V9O_DW , 4V9O_FW , 4V9O_HW , 4V9O_AF , 4V9O_CF , 4V9O_EF , 4V9O_GF , 4V9O_AG , 4V9O_CG , 4V9O_EG , 4V9O_GG , 4V9O_AH , 4V9O_CH , 4V9O_EH , 4V9O_GH , 4V9O_AI , 4V9O_CI , 4V9O_EI , 4V9O_GI
4V9P
Control of ribosomal subunit rotation by elongation factor g Deposition Author(s): Cate, J.H.D. , Pulk, A.
Date: 2013-05-03 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 2.9 Å Organism(s): Escherichia Coli , Synthetic Construct Sequences Data: 4V9P_AA , 4V9P_CA , 4V9P_EA , 4V9P_GA , 4V9P_AJ , 4V9P_CJ , 4V9P_EJ , 4V9P_GJ , 4V9P_AK , 4V9P_CK , 4V9P_EK , 4V9P_GK , 4V9P_AL , 4V9P_CL , 4V9P_EL , 4V9P_GL , 4V9P_AM , 4V9P_CM , 4V9P_EM , 4V9P_GM , 4V9P_AN , 4V9P_CN , 4V9P_EN , 4V9P_GN , 4V9P_AO , 4V9P_CO , 4V9P_EO , 4V9P_GO , 4V9P_AP , 4V9P_CP , 4V9P_EP , 4V9P_GP , 4V9P_AQ , 4V9P_CQ , 4V9P_EQ , 4V9P_GQ , 4V9P_AR , 4V9P_CR , 4V9P_ER , 4V9P_GR , 4V9P_AS , 4V9P_CS , 4V9P_ES , 4V9P_GS , 4V9P_AB , 4V9P_CB , 4V9P_EB , 4V9P_GB , 4V9P_AT , 4V9P_CT , 4V9P_ET , 4V9P_GT , 4V9P_AU , 4V9P_CU , 4V9P_EU , 4V9P_GU , 4V9P_AV , 4V9P_CV , 4V9P_EV , 4V9P_GV , 4V9P_AW , 4V9P_CW , 4V9P_EW , 4V9P_GW , 4V9P_AX , 4V9P_CX , 4V9P_EX , 4V9P_GX , 4V9P_AY , 4V9P_CY , 4V9P_EY , 4V9P_GY , 4V9P_AZ , 4V9P_CZ , 4V9P_EZ , 4V9P_GZ , 4V9P_A0 , 4V9P_C0 , 4V9P_E0 , 4V9P_G0 , 4V9P_A1 , 4V9P_C1 , 4V9P_E1 , 4V9P_G1 , 4V9P_A2 , 4V9P_C2 , 4V9P_E2 , 4V9P_G2 , 4V9P_AC , 4V9P_CC , 4V9P_EC , 4V9P_GC , 4V9P_A3 , 4V9P_C3 , 4V9P_E3 , 4V9P_G3 , 4V9P_A4 , 4V9P_C4 , 4V9P_E4 , 4V9P_G4 , 4V9P_A5 , 4V9P_E5 , 4V9P_BA , 4V9P_DA , 4V9P_FA , 4V9P_HA , 4V9P_BB , 4V9P_DB , 4V9P_FB , 4V9P_HB , 4V9P_BC , 4V9P_DC , 4V9P_FC , 4V9P_HC , 4V9P_BD , 4V9P_DD , 4V9P_FD , 4V9P_HD , 4V9P_BE , 4V9P_DE , 4V9P_FE , 4V9P_HE , 4V9P_BF , 4V9P_DF , 4V9P_FF , 4V9P_HF , 4V9P_BG , 4V9P_DG , 4V9P_FG , 4V9P_HG , 4V9P_AD , 4V9P_CD , 4V9P_ED , 4V9P_GD , 4V9P_BH , 4V9P_DH , 4V9P_FH , 4V9P_HH , 4V9P_BI , 4V9P_DI , 4V9P_FI , 4V9P_HI , 4V9P_BJ , 4V9P_DJ , 4V9P_FJ , 4V9P_HJ , 4V9P_BK , 4V9P_DK , 4V9P_FK , 4V9P_HK , 4V9P_BL , 4V9P_DL , 4V9P_FL , 4V9P_HL , 4V9P_BM , 4V9P_DM , 4V9P_FM , 4V9P_HM , 4V9P_BN , 4V9P_DN , 4V9P_FN , 4V9P_HN , 4V9P_BO , 4V9P_DO , 4V9P_FO , 4V9P_HO , 4V9P_BP , 4V9P_DP , 4V9P_FP , 4V9P_HP , 4V9P_BQ , 4V9P_DQ , 4V9P_FQ , 4V9P_HQ , 4V9P_AE , 4V9P_CE , 4V9P_EE , 4V9P_GE , 4V9P_BR , 4V9P_DR , 4V9P_FR , 4V9P_HR , 4V9P_BS , 4V9P_DS , 4V9P_FS , 4V9P_HS , 4V9P_BT , 4V9P_DT , 4V9P_FT , 4V9P_HT , 4V9P_BU , 4V9P_DU , 4V9P_FU , 4V9P_HU , 4V9P_BV , 4V9P_DV , 4V9P_FV , 4V9P_HV , 4V9P_BW , 4V9P_DW , 4V9P_FW , 4V9P_AF , 4V9P_CF , 4V9P_EF , 4V9P_GF , 4V9P_AG , 4V9P_CG , 4V9P_EG , 4V9P_GG , 4V9P_AH , 4V9P_CH , 4V9P_EH , 4V9P_GH , 4V9P_AI , 4V9P_CI , 4V9P_EI , 4V9P_GI
4WOI
4,5-linked aminoglycoside antibiotics regulate the bacterial ribosome by targeting dynamic conformational processes within intersubunit bridge b2 Deposition Author(s): Altman, R. , Blanchard, S. , Cate, J.H.D. , Garneau-Tsodikova, S. , Green, K. , Pulk, A. , Wasserman, M. , Zhou, Z. , Zinder, J.
Date: 2014-10-15 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3 Å Organism(s): Escherichia Coli , Escherichia Coli Str. K-12 Substr. Mds42 , Thermus Thermophilus , Synthetic Construct Sequences Data: 4WOI_AA , 4WOI_DA , 4WOI_AJ , 4WOI_DJ , 4WOI_AK , 4WOI_DK , 4WOI_AL , 4WOI_DL , 4WOI_AM , 4WOI_DM , 4WOI_AN , 4WOI_DN , 4WOI_AO , 4WOI_DO , 4WOI_AP , 4WOI_DP , 4WOI_AQ , 4WOI_DQ , 4WOI_AR , 4WOI_DR , 4WOI_AS , 4WOI_DS , 4WOI_AB , 4WOI_DB , 4WOI_AT , 4WOI_DT , 4WOI_AU , 4WOI_DU , 4WOI_AV , 4WOI_AW , 4WOI_DV , 4WOI_AX , 4WOI_DW , 4WOI_BA , 4WOI_CA , 4WOI_BB , 4WOI_CB , 4WOI_BC , 4WOI_CC , 4WOI_BD , 4WOI_CD , 4WOI_BE , 4WOI_CE , 4WOI_AC , 4WOI_DC , 4WOI_BF , 4WOI_CF , 4WOI_BG , 4WOI_CG , 4WOI_BH , 4WOI_CH , 4WOI_BI , 4WOI_CI , 4WOI_BJ , 4WOI_CJ , 4WOI_BK , 4WOI_CK , 4WOI_BL , 4WOI_CL , 4WOI_BM , 4WOI_CM , 4WOI_BN , 4WOI_CN , 4WOI_BO , 4WOI_CO , 4WOI_AD , 4WOI_DD , 4WOI_BP , 4WOI_CP , 4WOI_BQ , 4WOI_CQ , 4WOI_BR , 4WOI_CR , 4WOI_BS , 4WOI_CS , 4WOI_BT , 4WOI_CT , 4WOI_BU , 4WOI_CU , 4WOI_BV , 4WOI_CV , 4WOI_BW , 4WOI_CW , 4WOI_BX , 4WOI_CX , 4WOI_BY , 4WOI_CY , 4WOI_AE , 4WOI_DE , 4WOI_BZ , 4WOI_CZ , 4WOI_B0 , 4WOI_C0 , 4WOI_B1 , 4WOI_C1 , 4WOI_B2 , 4WOI_C2 , 4WOI_B3 , 4WOI_C3 , 4WOI_B4 , 4WOI_C4 , 4WOI_B5 , 4WOI_AF , 4WOI_DF , 4WOI_AG , 4WOI_DG , 4WOI_AH , 4WOI_DH , 4WOI_AI , 4WOI_DI
6I7V
Ribosomal protein paralogs bl31 and bl36 Deposition Author(s): Cate, J.H.D. , Liiv, A. , Lilleorg, S. , Peil, L. , Pulk, A. , Reier, K. , Remme, J. , Tammsalu, T.
Date: 2018-11-19 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 2.9 Å Organism(s): Escherichia Coli Sequences Data: 6I7V_AA , 6I7V_AF , 6I7V_BF , 6I7V_AG , 6I7V_BG , 6I7V_AH , 6I7V_BH , 6I7V_AI , 6I7V_BI , 6I7V_AJ , 6I7V_BJ , 6I7V_AK , 6I7V_BK , 6I7V_AL , 6I7V_AM , 6I7V_BM , 6I7V_AN , 6I7V_BN , 6I7V_AO , 6I7V_BO , 6I7V_BA , 6I7V_AP , 6I7V_BP , 6I7V_AQ , 6I7V_BQ , 6I7V_AR , 6I7V_BR , 6I7V_AS , 6I7V_BS , 6I7V_AT , 6I7V_BT , 6I7V_AU , 6I7V_BU , 6I7V_BL , 6I7V_CC , 6I7V_DC , 6I7V_CD , 6I7V_CE , 6I7V_DE , 6I7V_DA , 6I7V_CF , 6I7V_DF , 6I7V_CG , 6I7V_DG , 6I7V_CH , 6I7V_DH , 6I7V_CJ , 6I7V_DJ , 6I7V_CK , 6I7V_DK , 6I7V_CL , 6I7V_DL , 6I7V_CM , 6I7V_DM , 6I7V_CN , 6I7V_DN , 6I7V_CO , 6I7V_DO , 6I7V_CP , 6I7V_DP , 6I7V_CA , 6I7V_CQ , 6I7V_DQ , 6I7V_CR , 6I7V_DR , 6I7V_CS , 6I7V_DS , 6I7V_CT , 6I7V_DT , 6I7V_CU , 6I7V_DU , 6I7V_CV , 6I7V_DV , 6I7V_CW , 6I7V_DW , 6I7V_CX , 6I7V_DX , 6I7V_CY , 6I7V_DY , 6I7V_CZ , 6I7V_DZ , 6I7V_DB , 6I7V_CB , 6I7V_C0 , 6I7V_D0 , 6I7V_C1 , 6I7V_D1 , 6I7V_C2 , 6I7V_D2 , 6I7V_C3 , 6I7V_D3 , 6I7V_C4 , 6I7V_D4 , 6I7V_C5 , 6I7V_D5 , 6I7V_DD , 6I7V_D7 , 6I7V_AB , 6I7V_BB , 6I7V_AC , 6I7V_BC , 6I7V_AD , 6I7V_BD , 6I7V_AE , 6I7V_BE
7QGG
Neuronal rna granules are ribosome complexes stalled at the pre-translocation state Deposition Author(s): Kipper, K. , Mansour, A. , Pulk, A.
Date: 2021-12-08 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 2.86 Å Organism(s): Rattus Norvegicus Sequences Data: 7QGG_S2 , 7QGG_SL , 7QGG_SP , 7QGG_SQ , 7QGG_SR , 7QGG_SS , 7QGG_ST , 7QGG_SU , 7QGG_SV , 7QGG_SX , 7QGG_SA , 7QGG_SC , 7QGG_SD , 7QGG_SG , 7QGG_SJ , 7QGG_SM , 7QGG_SN , 7QGG_SO , 7QGG_SW , 7QGG_SB , 7QGG_SY , 7QGG_SZ , 7QGG_SE , 7QGG_SF , 7QGG_A , 7QGG_B , 7QGG_C , 7QGG_D , 7QGG_E , 7QGG_F , 7QGG_G , 7QGG_H , 7QGG_I , 7QGG_J , 7QGG_K , 7QGG_L , 7QGG_M , 7QGG_N , 7QGG_O , 7QGG_P , 7QGG_Q , 7QGG_R , 7QGG_S , 7QGG_T , 7QGG_U , 7QGG_V , 7QGG_W , 7QGG_X , 7QGG_Y , 7QGG_Z , 7QGG_SH , 7QGG_SI , 7QGG_CZ , 7QGG_SK