PDBi (Protein Data Bank in India)

All in One Protein Databank
Home About Help Resources External Links Contact Us
Advanced Search
FASTA Sequence PDB Format mmCIF Format
FASTA Sequence PDB Format PDB Format(gz) PDBx/mmCIF Format PDBx/mmCIF Format(gz) PDBML/XML Format Validation Full PDF Validation CIF

9K7Z

Cryo-em structure of designed zinc-induced icosahedron cage-i53-zn1-hehe-16

PDB DOI: 10.2210/pdb9k7z/pdb

Classification: METAL BINDING PROTEIN
Organism(s): Escherichia Coli

Deposited: 2024-10-24
Deposition Author(s): Cao, L.X. , Qu, Y.N.

Experimental Data Snapshot

Method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 2.65 Å

9k7z
Literature

Cryo-em structure of designed zinc-induced icosahedron cage-i53-zn1-hehe-16

Cao, L.X. , Qu, Y.N.

Primary Citation of Related Structures: 9K7Z


Proteins
Molecule Chains Sequence Length Organism Sequence
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 A 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 B 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 C 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 D 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 E 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 F 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 Q 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 M 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 X 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 G 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 R 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 N 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 Y 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 H 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 S 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 O 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 Z 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 I 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 T 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 P 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 0 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 J 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 U 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 1 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 K 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 V 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 2 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 L 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 W 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 3 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 4 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 5 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 6 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Cage-i53-Zn1-HEHE-16 7 258 Escherichia Coli MGHHHHHHHHSSGLEVLFQGPGGTMEKLEVAVEHLKEAIELIEKGEYVKADLILTDILRLLEEEGVKSLIKQAKELHIEVFKLLKEGEYKEAKALVEALRVSVELYILIKRGVREGRPIEEIAREVGRKLVELAKRLEKEGISWEEIIELIERILESIREILKEEGLPESEINRILAVSILEVAKYLLEKLGFDYLVELLDRAIEYILKGRSELAVHLLDDIIRRVHEEIERYGDDVPEELLLLDLLVQKARDLAARI
Experimental Data

Method: ELECTRON MICROSCOPY

Deposited Date: 2024-10-24
Deposition Author(s): Cao, L.X. , Qu, Y.N.