Capsid of vibrio cholerae phage mature vp1
PDB DOI: 10.2210/pdb9in6/pdb
Classification: VIRAL PROTEIN Organism(s): Vibrio Cholerae
Deposited: 2024-07-05 Deposition Author(s): Liu, H.R. , Pang, H.
Proteins | ||||
---|---|---|---|---|
Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Sequence |
major capsid of VP1 | M | 399 | Vibrio Cholerae | MATIAGLRGTGDWGNQERPTDFRETILWMEPNGQAPLQALMSKMSSQPTTDPEFSWWEEKLTHNRLEVKTEAAAGVTTLAVDTDQAWACVKGDILMVESVGGLWANEILKVVEDPTAGNALKVARGFAGTTAAVIPAGTFIIAIGTSFAEGSLAPKSATRNPVKLNNFCQIFKKSYEITKTADATKARTGSALANDKKRRMFDYYRDVEMAFIYGRKSETVGENGKPERTTGGLLNFITTNRTQFGTGAGKTELTEDSLIDFFANVFNYDGQGAGNQRIAFVGNTALTKINKLARNSPSTRINFDKQVTQVYGMNFTRWVLPQGEIFFKTHPLFNVHPELSKAMMVLNPKGIKERVLRATKPENDIQQVGQDSIKGQWIGEFGLEVNHEETMAFAGGIA |
major capsid of VP1 | N | 399 | Vibrio Cholerae | MATIAGLRGTGDWGNQERPTDFRETILWMEPNGQAPLQALMSKMSSQPTTDPEFSWWEEKLTHNRLEVKTEAAAGVTTLAVDTDQAWACVKGDILMVESVGGLWANEILKVVEDPTAGNALKVARGFAGTTAAVIPAGTFIIAIGTSFAEGSLAPKSATRNPVKLNNFCQIFKKSYEITKTADATKARTGSALANDKKRRMFDYYRDVEMAFIYGRKSETVGENGKPERTTGGLLNFITTNRTQFGTGAGKTELTEDSLIDFFANVFNYDGQGAGNQRIAFVGNTALTKINKLARNSPSTRINFDKQVTQVYGMNFTRWVLPQGEIFFKTHPLFNVHPELSKAMMVLNPKGIKERVLRATKPENDIQQVGQDSIKGQWIGEFGLEVNHEETMAFAGGIA |
major capsid of VP1 | O | 399 | Vibrio Cholerae | MATIAGLRGTGDWGNQERPTDFRETILWMEPNGQAPLQALMSKMSSQPTTDPEFSWWEEKLTHNRLEVKTEAAAGVTTLAVDTDQAWACVKGDILMVESVGGLWANEILKVVEDPTAGNALKVARGFAGTTAAVIPAGTFIIAIGTSFAEGSLAPKSATRNPVKLNNFCQIFKKSYEITKTADATKARTGSALANDKKRRMFDYYRDVEMAFIYGRKSETVGENGKPERTTGGLLNFITTNRTQFGTGAGKTELTEDSLIDFFANVFNYDGQGAGNQRIAFVGNTALTKINKLARNSPSTRINFDKQVTQVYGMNFTRWVLPQGEIFFKTHPLFNVHPELSKAMMVLNPKGIKERVLRATKPENDIQQVGQDSIKGQWIGEFGLEVNHEETMAFAGGIA |
major capsid of VP1 | P | 399 | Vibrio Cholerae | MATIAGLRGTGDWGNQERPTDFRETILWMEPNGQAPLQALMSKMSSQPTTDPEFSWWEEKLTHNRLEVKTEAAAGVTTLAVDTDQAWACVKGDILMVESVGGLWANEILKVVEDPTAGNALKVARGFAGTTAAVIPAGTFIIAIGTSFAEGSLAPKSATRNPVKLNNFCQIFKKSYEITKTADATKARTGSALANDKKRRMFDYYRDVEMAFIYGRKSETVGENGKPERTTGGLLNFITTNRTQFGTGAGKTELTEDSLIDFFANVFNYDGQGAGNQRIAFVGNTALTKINKLARNSPSTRINFDKQVTQVYGMNFTRWVLPQGEIFFKTHPLFNVHPELSKAMMVLNPKGIKERVLRATKPENDIQQVGQDSIKGQWIGEFGLEVNHEETMAFAGGIA |
major capsid of VP1 | Q | 399 | Vibrio Cholerae | MATIAGLRGTGDWGNQERPTDFRETILWMEPNGQAPLQALMSKMSSQPTTDPEFSWWEEKLTHNRLEVKTEAAAGVTTLAVDTDQAWACVKGDILMVESVGGLWANEILKVVEDPTAGNALKVARGFAGTTAAVIPAGTFIIAIGTSFAEGSLAPKSATRNPVKLNNFCQIFKKSYEITKTADATKARTGSALANDKKRRMFDYYRDVEMAFIYGRKSETVGENGKPERTTGGLLNFITTNRTQFGTGAGKTELTEDSLIDFFANVFNYDGQGAGNQRIAFVGNTALTKINKLARNSPSTRINFDKQVTQVYGMNFTRWVLPQGEIFFKTHPLFNVHPELSKAMMVLNPKGIKERVLRATKPENDIQQVGQDSIKGQWIGEFGLEVNHEETMAFAGGIA |
major capsid of VP1 | R | 399 | Vibrio Cholerae | MATIAGLRGTGDWGNQERPTDFRETILWMEPNGQAPLQALMSKMSSQPTTDPEFSWWEEKLTHNRLEVKTEAAAGVTTLAVDTDQAWACVKGDILMVESVGGLWANEILKVVEDPTAGNALKVARGFAGTTAAVIPAGTFIIAIGTSFAEGSLAPKSATRNPVKLNNFCQIFKKSYEITKTADATKARTGSALANDKKRRMFDYYRDVEMAFIYGRKSETVGENGKPERTTGGLLNFITTNRTQFGTGAGKTELTEDSLIDFFANVFNYDGQGAGNQRIAFVGNTALTKINKLARNSPSTRINFDKQVTQVYGMNFTRWVLPQGEIFFKTHPLFNVHPELSKAMMVLNPKGIKERVLRATKPENDIQQVGQDSIKGQWIGEFGLEVNHEETMAFAGGIA |
major capsid of VP1 | T | 399 | Vibrio Cholerae | MATIAGLRGTGDWGNQERPTDFRETILWMEPNGQAPLQALMSKMSSQPTTDPEFSWWEEKLTHNRLEVKTEAAAGVTTLAVDTDQAWACVKGDILMVESVGGLWANEILKVVEDPTAGNALKVARGFAGTTAAVIPAGTFIIAIGTSFAEGSLAPKSATRNPVKLNNFCQIFKKSYEITKTADATKARTGSALANDKKRRMFDYYRDVEMAFIYGRKSETVGENGKPERTTGGLLNFITTNRTQFGTGAGKTELTEDSLIDFFANVFNYDGQGAGNQRIAFVGNTALTKINKLARNSPSTRINFDKQVTQVYGMNFTRWVLPQGEIFFKTHPLFNVHPELSKAMMVLNPKGIKERVLRATKPENDIQQVGQDSIKGQWIGEFGLEVNHEETMAFAGGIA |
SHP of VP1 | C | 111 | Vibrio Cholerae | MLVHYGKLSDMPTVVDVNTTMGTDVPEDLLEIYVGCYAADGKTPAAGTGVLTFHGSWNGVHKRLIGTVDLAAAGEVIAYNPPLMFGGCKKLFVSYTGVGTQIVDVYVHRGE |
Method: ELECTRON MICROSCOPY