PDBi (Protein Data Bank in India)

All in One Protein Databank
Home About Help Resources External Links Contact Us
Advanced Search
FASTA Sequence PDB Format mmCIF Format
FASTA Sequence PDB Format PDB Format(gz) PDBx/mmCIF Format PDBx/mmCIF Format(gz) PDBML/XML Format Validation Full PDF Validation CIF

8WU4

Cryo-em structure of native h. thermoluteolus th-1 groel

PDB DOI: 10.2210/pdb8wu4/pdb

Classification: CHAPERONE
Organism(s): Hydrogenophilus Thermoluteolus

Deposited: 2023-10-20
Deposition Author(s): Arakawa, T. , Fushinobu, S. , Gerle, C. , Gopalasingam, C.C. , Ishii, M. , Kameya, M. , Liao, Z. , Shigematsu, H.

Experimental Data Snapshot

Method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3.3 Å

8wu4
Literature

Cryo-em structure of native h. thermoluteolus th-1 groel

Arakawa, T. , Fushinobu, S. , Gerle, C. , Gopalasingam, C.C. , Ishii, M. , Kameya, M. , Liao, Z. , Shigematsu, H.

Primary Citation of Related Structures: 8WU4


Proteins
Molecule Chains Sequence Length Organism Sequence
Chaperonin GroEL A 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL B 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL C 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL D 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL E 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL F 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL G 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL H 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL I 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL J 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL K 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL L 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL M 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Chaperonin GroEL N 526 Hydrogenophilus Thermoluteolus AAKEVKFHDSARERLVAGVNLLANAVKTTLGPKGRNVVIERSFGAPIVTKDGVTVAKEIELKDKFENMGAQMVKEVASKTADVAGDGTTTATVLAQAIVREGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAIVEELKAISKPCSTTKEIAQVGTISANADSSIGEIIAQAMDKVGKEGVITVEDGKSLENELEVVEGMQFDRGYLSPYFINNPDKQVAVLDNPYILLHDKKISNIRDLLPVLEQVAKAGRPLLIIAEDVEGEALATLVVNNLRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGTVISEEVGLSLEKATLEDLGQAKRVEVAKEHTTIIDGAGDPAKIQARVKEIRVQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALLRAREAAVAKGLKGDNPDQEAGIKIVLRAVEQPLREIVANAGEEPSVIVAKVLEGKGNYGYNAATGEFGDMIEMGVLDPTKVTRSALQNAASVAGLMLTTECMIAEAP
Experimental Data

Method: ELECTRON MICROSCOPY

Deposited Date: 2023-10-20
Deposition Author(s): Arakawa, T. , Fushinobu, S. , Gerle, C. , Gopalasingam, C.C. , Ishii, M. , Kameya, M. , Liao, Z. , Shigematsu, H.