Cryoem structure of a computationally designed t3 tetrahedral nanocage
PDB DOI: 10.2210/pdb8tl7/pdb
Classification: DE NOVO PROTEIN Organism(s): Synthetic Construct
Deposited: 2023-07-26 Deposition Author(s): Borst, A.J. , Weidle, C.
Cryoem structure of a computationally designed t3 tetrahedral nanocage
Primary Citation of Related Structures: 8TL7
Proteins | ||||
---|---|---|---|---|
Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Sequence |
Computationally designed protein | A | 710 | Synthetic Construct | MEELREIAERAEADMREISELAEELVEDPVYAVAVRGMALVGAAGVFALGVGGPPEVLEEARRRVEEAAREALRKYEEGADVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKKGEDVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKEGADESELVAEVMTATAEAVGEIAEATIEATDDPEKRRKIAEFAREKMRRIRELARKLVEDPVLAAAVAARALVLSAAVFAKAYGGPEEYSRLMRRWVEKAAELARRARRLGADESVLVAALMRVAAIAVTAIAMMTVMGVQNAPPEERERILAEATEMIARVLAEATRRVMKRLEDPEAAAELALATIEAITELFVDALEIIRSGEVASRLAKSGIEVIAELAEAAIEHIDDPEQLKKIVKKAAEAIKKIVEELIKKDVEDELLAEVTSEGNRKLSRITSKALTKIKDEKAAAELTIEAIEAITENFLLALERIKDGEVAAKLAEDGLLEIYRLAVSGIEHIDNPEELEKIVKKTEEAVERIVEALEKKDVEPELKEEVEELGKKLVEIVRKLAERKGGSGGSWGHHHHHHG |
Computationally designed protein | B | 710 | Synthetic Construct | MEELREIAERAEADMREISELAEELVEDPVYAVAVRGMALVGAAGVFALGVGGPPEVLEEARRRVEEAAREALRKYEEGADVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKKGEDVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKEGADESELVAEVMTATAEAVGEIAEATIEATDDPEKRRKIAEFAREKMRRIRELARKLVEDPVLAAAVAARALVLSAAVFAKAYGGPEEYSRLMRRWVEKAAELARRARRLGADESVLVAALMRVAAIAVTAIAMMTVMGVQNAPPEERERILAEATEMIARVLAEATRRVMKRLEDPEAAAELALATIEAITELFVDALEIIRSGEVASRLAKSGIEVIAELAEAAIEHIDDPEQLKKIVKKAAEAIKKIVEELIKKDVEDELLAEVTSEGNRKLSRITSKALTKIKDEKAAAELTIEAIEAITENFLLALERIKDGEVAAKLAEDGLLEIYRLAVSGIEHIDNPEELEKIVKKTEEAVERIVEALEKKDVEPELKEEVEELGKKLVEIVRKLAERKGGSGGSWGHHHHHHG |
Computationally designed protein | C | 710 | Synthetic Construct | MEELREIAERAEADMREISELAEELVEDPVYAVAVRGMALVGAAGVFALGVGGPPEVLEEARRRVEEAAREALRKYEEGADVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKKGEDVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKEGADESELVAEVMTATAEAVGEIAEATIEATDDPEKRRKIAEFAREKMRRIRELARKLVEDPVLAAAVAARALVLSAAVFAKAYGGPEEYSRLMRRWVEKAAELARRARRLGADESVLVAALMRVAAIAVTAIAMMTVMGVQNAPPEERERILAEATEMIARVLAEATRRVMKRLEDPEAAAELALATIEAITELFVDALEIIRSGEVASRLAKSGIEVIAELAEAAIEHIDDPEQLKKIVKKAAEAIKKIVEELIKKDVEDELLAEVTSEGNRKLSRITSKALTKIKDEKAAAELTIEAIEAITENFLLALERIKDGEVAAKLAEDGLLEIYRLAVSGIEHIDNPEELEKIVKKTEEAVERIVEALEKKDVEPELKEEVEELGKKLVEIVRKLAERKGGSGGSWGHHHHHHG |
Computationally designed protein | I | 710 | Synthetic Construct | MEELREIAERAEADMREISELAEELVEDPVYAVAVRGMALVGAAGVFALGVGGPPEVLEEARRRVEEAAREALRKYEEGADVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKKGEDVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKEGADESELVAEVMTATAEAVGEIAEATIEATDDPEKRRKIAEFAREKMRRIRELARKLVEDPVLAAAVAARALVLSAAVFAKAYGGPEEYSRLMRRWVEKAAELARRARRLGADESVLVAALMRVAAIAVTAIAMMTVMGVQNAPPEERERILAEATEMIARVLAEATRRVMKRLEDPEAAAELALATIEAITELFVDALEIIRSGEVASRLAKSGIEVIAELAEAAIEHIDDPEQLKKIVKKAAEAIKKIVEELIKKDVEDELLAEVTSEGNRKLSRITSKALTKIKDEKAAAELTIEAIEAITENFLLALERIKDGEVAAKLAEDGLLEIYRLAVSGIEHIDNPEELEKIVKKTEEAVERIVEALEKKDVEPELKEEVEELGKKLVEIVRKLAERKGGSGGSWGHHHHHHG |
Computationally designed protein | R | 710 | Synthetic Construct | MEELREIAERAEADMREISELAEELVEDPVYAVAVRGMALVGAAGVFALGVGGPPEVLEEARRRVEEAAREALRKYEEGADVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKKGEDVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKEGADESELVAEVMTATAEAVGEIAEATIEATDDPEKRRKIAEFAREKMRRIRELARKLVEDPVLAAAVAARALVLSAAVFAKAYGGPEEYSRLMRRWVEKAAELARRARRLGADESVLVAALMRVAAIAVTAIAMMTVMGVQNAPPEERERILAEATEMIARVLAEATRRVMKRLEDPEAAAELALATIEAITELFVDALEIIRSGEVASRLAKSGIEVIAELAEAAIEHIDDPEQLKKIVKKAAEAIKKIVEELIKKDVEDELLAEVTSEGNRKLSRITSKALTKIKDEKAAAELTIEAIEAITENFLLALERIKDGEVAAKLAEDGLLEIYRLAVSGIEHIDNPEELEKIVKKTEEAVERIVEALEKKDVEPELKEEVEELGKKLVEIVRKLAERKGGSGGSWGHHHHHHG |
Computationally designed protein | S | 710 | Synthetic Construct | MEELREIAERAEADMREISELAEELVEDPVYAVAVRGMALVGAAGVFALGVGGPPEVLEEARRRVEEAAREALRKYEEGADVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKKGEDVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKEGADESELVAEVMTATAEAVGEIAEATIEATDDPEKRRKIAEFAREKMRRIRELARKLVEDPVLAAAVAARALVLSAAVFAKAYGGPEEYSRLMRRWVEKAAELARRARRLGADESVLVAALMRVAAIAVTAIAMMTVMGVQNAPPEERERILAEATEMIARVLAEATRRVMKRLEDPEAAAELALATIEAITELFVDALEIIRSGEVASRLAKSGIEVIAELAEAAIEHIDDPEQLKKIVKKAAEAIKKIVEELIKKDVEDELLAEVTSEGNRKLSRITSKALTKIKDEKAAAELTIEAIEAITENFLLALERIKDGEVAAKLAEDGLLEIYRLAVSGIEHIDNPEELEKIVKKTEEAVERIVEALEKKDVEPELKEEVEELGKKLVEIVRKLAERKGGSGGSWGHHHHHHG |
Computationally designed protein | T | 710 | Synthetic Construct | MEELREIAERAEADMREISELAEELVEDPVYAVAVRGMALVGAAGVFALGVGGPPEVLEEARRRVEEAAREALRKYEEGADVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKKGEDVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKEGADESELVAEVMTATAEAVGEIAEATIEATDDPEKRRKIAEFAREKMRRIRELARKLVEDPVLAAAVAARALVLSAAVFAKAYGGPEEYSRLMRRWVEKAAELARRARRLGADESVLVAALMRVAAIAVTAIAMMTVMGVQNAPPEERERILAEATEMIARVLAEATRRVMKRLEDPEAAAELALATIEAITELFVDALEIIRSGEVASRLAKSGIEVIAELAEAAIEHIDDPEQLKKIVKKAAEAIKKIVEELIKKDVEDELLAEVTSEGNRKLSRITSKALTKIKDEKAAAELTIEAIEAITENFLLALERIKDGEVAAKLAEDGLLEIYRLAVSGIEHIDNPEELEKIVKKTEEAVERIVEALEKKDVEPELKEEVEELGKKLVEIVRKLAERKGGSGGSWGHHHHHHG |
Computationally designed protein | U | 710 | Synthetic Construct | MEELREIAERAEADMREISELAEELVEDPVYAVAVRGMALVGAAGVFALGVGGPPEVLEEARRRVEEAAREALRKYEEGADVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKKGEDVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKEGADESELVAEVMTATAEAVGEIAEATIEATDDPEKRRKIAEFAREKMRRIRELARKLVEDPVLAAAVAARALVLSAAVFAKAYGGPEEYSRLMRRWVEKAAELARRARRLGADESVLVAALMRVAAIAVTAIAMMTVMGVQNAPPEERERILAEATEMIARVLAEATRRVMKRLEDPEAAAELALATIEAITELFVDALEIIRSGEVASRLAKSGIEVIAELAEAAIEHIDDPEQLKKIVKKAAEAIKKIVEELIKKDVEDELLAEVTSEGNRKLSRITSKALTKIKDEKAAAELTIEAIEAITENFLLALERIKDGEVAAKLAEDGLLEIYRLAVSGIEHIDNPEELEKIVKKTEEAVERIVEALEKKDVEPELKEEVEELGKKLVEIVRKLAERKGGSGGSWGHHHHHHG |
Computationally designed protein | V | 710 | Synthetic Construct | MEELREIAERAEADMREISELAEELVEDPVYAVAVRGMALVGAAGVFALGVGGPPEVLEEARRRVEEAAREALRKYEEGADVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKKGEDVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKEGADESELVAEVMTATAEAVGEIAEATIEATDDPEKRRKIAEFAREKMRRIRELARKLVEDPVLAAAVAARALVLSAAVFAKAYGGPEEYSRLMRRWVEKAAELARRARRLGADESVLVAALMRVAAIAVTAIAMMTVMGVQNAPPEERERILAEATEMIARVLAEATRRVMKRLEDPEAAAELALATIEAITELFVDALEIIRSGEVASRLAKSGIEVIAELAEAAIEHIDDPEQLKKIVKKAAEAIKKIVEELIKKDVEDELLAEVTSEGNRKLSRITSKALTKIKDEKAAAELTIEAIEAITENFLLALERIKDGEVAAKLAEDGLLEIYRLAVSGIEHIDNPEELEKIVKKTEEAVERIVEALEKKDVEPELKEEVEELGKKLVEIVRKLAERKGGSGGSWGHHHHHHG |
Computationally designed protein | X | 710 | Synthetic Construct | MEELREIAERAEADMREISELAEELVEDPVYAVAVRGMALVGAAGVFALGVGGPPEVLEEARRRVEEAAREALRKYEEGADVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKKGEDVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKEGADESELVAEVMTATAEAVGEIAEATIEATDDPEKRRKIAEFAREKMRRIRELARKLVEDPVLAAAVAARALVLSAAVFAKAYGGPEEYSRLMRRWVEKAAELARRARRLGADESVLVAALMRVAAIAVTAIAMMTVMGVQNAPPEERERILAEATEMIARVLAEATRRVMKRLEDPEAAAELALATIEAITELFVDALEIIRSGEVASRLAKSGIEVIAELAEAAIEHIDDPEQLKKIVKKAAEAIKKIVEELIKKDVEDELLAEVTSEGNRKLSRITSKALTKIKDEKAAAELTIEAIEAITENFLLALERIKDGEVAAKLAEDGLLEIYRLAVSGIEHIDNPEELEKIVKKTEEAVERIVEALEKKDVEPELKEEVEELGKKLVEIVRKLAERKGGSGGSWGHHHHHHG |
Computationally designed protein | Y | 710 | Synthetic Construct | MEELREIAERAEADMREISELAEELVEDPVYAVAVRGMALVGAAGVFALGVGGPPEVLEEARRRVEEAAREALRKYEEGADVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKKGEDVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKEGADESELVAEVMTATAEAVGEIAEATIEATDDPEKRRKIAEFAREKMRRIRELARKLVEDPVLAAAVAARALVLSAAVFAKAYGGPEEYSRLMRRWVEKAAELARRARRLGADESVLVAALMRVAAIAVTAIAMMTVMGVQNAPPEERERILAEATEMIARVLAEATRRVMKRLEDPEAAAELALATIEAITELFVDALEIIRSGEVASRLAKSGIEVIAELAEAAIEHIDDPEQLKKIVKKAAEAIKKIVEELIKKDVEDELLAEVTSEGNRKLSRITSKALTKIKDEKAAAELTIEAIEAITENFLLALERIKDGEVAAKLAEDGLLEIYRLAVSGIEHIDNPEELEKIVKKTEEAVERIVEALEKKDVEPELKEEVEELGKKLVEIVRKLAERKGGSGGSWGHHHHHHG |
Computationally designed protein | Z | 710 | Synthetic Construct | MEELREIAERAEADMREISELAEELVEDPVYAVAVRGMALVGAAGVFALGVGGPPEVLEEARRRVEEAAREALRKYEEGADVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKKGEDVSELVAELIRETSRQIAEIAEATIKATDDPEVLEEISEFAEERSRRLSEYAERHVTNPILAATVVALAEVLSAVVRARSYGAPEEVGEKAVKEVREASEEALERYKEGADESELVAEVMTATAEAVGEIAEATIEATDDPEKRRKIAEFAREKMRRIRELARKLVEDPVLAAAVAARALVLSAAVFAKAYGGPEEYSRLMRRWVEKAAELARRARRLGADESVLVAALMRVAAIAVTAIAMMTVMGVQNAPPEERERILAEATEMIARVLAEATRRVMKRLEDPEAAAELALATIEAITELFVDALEIIRSGEVASRLAKSGIEVIAELAEAAIEHIDDPEQLKKIVKKAAEAIKKIVEELIKKDVEDELLAEVTSEGNRKLSRITSKALTKIKDEKAAAELTIEAIEAITENFLLALERIKDGEVAAKLAEDGLLEIYRLAVSGIEHIDNPEELEKIVKKTEEAVERIVEALEKKDVEPELKEEVEELGKKLVEIVRKLAERKGGSGGSWGHHHHHHG |
Method: ELECTRON MICROSCOPY
Deposited Date: 2023-07-26 Deposition Author(s): Borst, A.J. , Weidle, C.