PDBi (Protein Data Bank in India)

All in One Protein Databank
Home About Help Resources External Links Contact Us
Advanced Search
FASTA Sequence PDB Format mmCIF Format
FASTA Sequence PDB Format PDB Format(gz) PDBx/mmCIF Format PDBx/mmCIF Format(gz) PDBML/XML Format Validation Full PDF Validation CIF

8KEE

Cyanophage a-1(l) sheath-tube

PDB DOI: 10.2210/pdb8kee/pdb

Classification: VIRAL PROTEIN
Organism(s): Unclassified Caudoviricetes

Deposited: 2023-08-11
Deposition Author(s): Li, Q. , Yu, R.C. , Zhou, C.Z.

Experimental Data Snapshot

Method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3.26 Å

8kee
Literature

Cyanophage a-1(l) sheath-tube

Li, Q. , Yu, R.C. , Zhou, C.Z.

Primary Citation of Related Structures: 8KEE


Proteins
Molecule Chains Sequence Length Organism Sequence
tube A 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube B 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube C 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube D 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube E 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube F 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube G 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube H 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube I 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube J 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
sheath K 506 Unclassified Caudoviricetes MTNFLNGVNIGTPGAYAFYQTTQSRPINVEPFRTCYMVGFASNGVNKNVPTRISNLTDFTNVYGTSASTNSVDLFFKNSQGFGNLYFVNVAIPTRYQIVVTAATAGSYSVTVNGVTKAITVVGGATTTTIAADVISAINNDTVLNKEVLATVGGTSSTVVITSKKPTNTTTAAVTGVIFTLTTTTGTSPSVADYVYTINNTFDPALEAGFVIAPEAFSTFTKSDRLSIQVALENLCSAYRYQWAALIDSGAMSEISNTDRAIAEAATYNSVQGHCSYYYPYLINLDDQQVPPSAAVAGMALYRFVIDGFAEPPAGVNFPLKGVKNVAYKVTWEEQNVANPEGVNCILNKENYGIVVWGARTLSADPNIVFISTRIILNIVINTLNRGYDFDIFNSVGGTATVLDNIQRKTNTLLTTLYQAGLFYGQTTSEAFSVLGDASVQVPSLLQQGLVNMFIWVVPSTIIERLIINIKQTAIGDLEATVALDTAALQSSVEEGTATEGTAPVV
sheath L 506 Unclassified Caudoviricetes MTNFLNGVNIGTPGAYAFYQTTQSRPINVEPFRTCYMVGFASNGVNKNVPTRISNLTDFTNVYGTSASTNSVDLFFKNSQGFGNLYFVNVAIPTRYQIVVTAATAGSYSVTVNGVTKAITVVGGATTTTIAADVISAINNDTVLNKEVLATVGGTSSTVVITSKKPTNTTTAAVTGVIFTLTTTTGTSPSVADYVYTINNTFDPALEAGFVIAPEAFSTFTKSDRLSIQVALENLCSAYRYQWAALIDSGAMSEISNTDRAIAEAATYNSVQGHCSYYYPYLINLDDQQVPPSAAVAGMALYRFVIDGFAEPPAGVNFPLKGVKNVAYKVTWEEQNVANPEGVNCILNKENYGIVVWGARTLSADPNIVFISTRIILNIVINTLNRGYDFDIFNSVGGTATVLDNIQRKTNTLLTTLYQAGLFYGQTTSEAFSVLGDASVQVPSLLQQGLVNMFIWVVPSTIIERLIINIKQTAIGDLEATVALDTAALQSSVEEGTATEGTAPVV
sheath M 506 Unclassified Caudoviricetes MTNFLNGVNIGTPGAYAFYQTTQSRPINVEPFRTCYMVGFASNGVNKNVPTRISNLTDFTNVYGTSASTNSVDLFFKNSQGFGNLYFVNVAIPTRYQIVVTAATAGSYSVTVNGVTKAITVVGGATTTTIAADVISAINNDTVLNKEVLATVGGTSSTVVITSKKPTNTTTAAVTGVIFTLTTTTGTSPSVADYVYTINNTFDPALEAGFVIAPEAFSTFTKSDRLSIQVALENLCSAYRYQWAALIDSGAMSEISNTDRAIAEAATYNSVQGHCSYYYPYLINLDDQQVPPSAAVAGMALYRFVIDGFAEPPAGVNFPLKGVKNVAYKVTWEEQNVANPEGVNCILNKENYGIVVWGARTLSADPNIVFISTRIILNIVINTLNRGYDFDIFNSVGGTATVLDNIQRKTNTLLTTLYQAGLFYGQTTSEAFSVLGDASVQVPSLLQQGLVNMFIWVVPSTIIERLIINIKQTAIGDLEATVALDTAALQSSVEEGTATEGTAPVV
sheath N 506 Unclassified Caudoviricetes MTNFLNGVNIGTPGAYAFYQTTQSRPINVEPFRTCYMVGFASNGVNKNVPTRISNLTDFTNVYGTSASTNSVDLFFKNSQGFGNLYFVNVAIPTRYQIVVTAATAGSYSVTVNGVTKAITVVGGATTTTIAADVISAINNDTVLNKEVLATVGGTSSTVVITSKKPTNTTTAAVTGVIFTLTTTTGTSPSVADYVYTINNTFDPALEAGFVIAPEAFSTFTKSDRLSIQVALENLCSAYRYQWAALIDSGAMSEISNTDRAIAEAATYNSVQGHCSYYYPYLINLDDQQVPPSAAVAGMALYRFVIDGFAEPPAGVNFPLKGVKNVAYKVTWEEQNVANPEGVNCILNKENYGIVVWGARTLSADPNIVFISTRIILNIVINTLNRGYDFDIFNSVGGTATVLDNIQRKTNTLLTTLYQAGLFYGQTTSEAFSVLGDASVQVPSLLQQGLVNMFIWVVPSTIIERLIINIKQTAIGDLEATVALDTAALQSSVEEGTATEGTAPVV
sheath O 506 Unclassified Caudoviricetes MTNFLNGVNIGTPGAYAFYQTTQSRPINVEPFRTCYMVGFASNGVNKNVPTRISNLTDFTNVYGTSASTNSVDLFFKNSQGFGNLYFVNVAIPTRYQIVVTAATAGSYSVTVNGVTKAITVVGGATTTTIAADVISAINNDTVLNKEVLATVGGTSSTVVITSKKPTNTTTAAVTGVIFTLTTTTGTSPSVADYVYTINNTFDPALEAGFVIAPEAFSTFTKSDRLSIQVALENLCSAYRYQWAALIDSGAMSEISNTDRAIAEAATYNSVQGHCSYYYPYLINLDDQQVPPSAAVAGMALYRFVIDGFAEPPAGVNFPLKGVKNVAYKVTWEEQNVANPEGVNCILNKENYGIVVWGARTLSADPNIVFISTRIILNIVINTLNRGYDFDIFNSVGGTATVLDNIQRKTNTLLTTLYQAGLFYGQTTSEAFSVLGDASVQVPSLLQQGLVNMFIWVVPSTIIERLIINIKQTAIGDLEATVALDTAALQSSVEEGTATEGTAPVV
sheath P 506 Unclassified Caudoviricetes MTNFLNGVNIGTPGAYAFYQTTQSRPINVEPFRTCYMVGFASNGVNKNVPTRISNLTDFTNVYGTSASTNSVDLFFKNSQGFGNLYFVNVAIPTRYQIVVTAATAGSYSVTVNGVTKAITVVGGATTTTIAADVISAINNDTVLNKEVLATVGGTSSTVVITSKKPTNTTTAAVTGVIFTLTTTTGTSPSVADYVYTINNTFDPALEAGFVIAPEAFSTFTKSDRLSIQVALENLCSAYRYQWAALIDSGAMSEISNTDRAIAEAATYNSVQGHCSYYYPYLINLDDQQVPPSAAVAGMALYRFVIDGFAEPPAGVNFPLKGVKNVAYKVTWEEQNVANPEGVNCILNKENYGIVVWGARTLSADPNIVFISTRIILNIVINTLNRGYDFDIFNSVGGTATVLDNIQRKTNTLLTTLYQAGLFYGQTTSEAFSVLGDASVQVPSLLQQGLVNMFIWVVPSTIIERLIINIKQTAIGDLEATVALDTAALQSSVEEGTATEGTAPVV
sheath Q 506 Unclassified Caudoviricetes MTNFLNGVNIGTPGAYAFYQTTQSRPINVEPFRTCYMVGFASNGVNKNVPTRISNLTDFTNVYGTSASTNSVDLFFKNSQGFGNLYFVNVAIPTRYQIVVTAATAGSYSVTVNGVTKAITVVGGATTTTIAADVISAINNDTVLNKEVLATVGGTSSTVVITSKKPTNTTTAAVTGVIFTLTTTTGTSPSVADYVYTINNTFDPALEAGFVIAPEAFSTFTKSDRLSIQVALENLCSAYRYQWAALIDSGAMSEISNTDRAIAEAATYNSVQGHCSYYYPYLINLDDQQVPPSAAVAGMALYRFVIDGFAEPPAGVNFPLKGVKNVAYKVTWEEQNVANPEGVNCILNKENYGIVVWGARTLSADPNIVFISTRIILNIVINTLNRGYDFDIFNSVGGTATVLDNIQRKTNTLLTTLYQAGLFYGQTTSEAFSVLGDASVQVPSLLQQGLVNMFIWVVPSTIIERLIINIKQTAIGDLEATVALDTAALQSSVEEGTATEGTAPVV
sheath R 506 Unclassified Caudoviricetes MTNFLNGVNIGTPGAYAFYQTTQSRPINVEPFRTCYMVGFASNGVNKNVPTRISNLTDFTNVYGTSASTNSVDLFFKNSQGFGNLYFVNVAIPTRYQIVVTAATAGSYSVTVNGVTKAITVVGGATTTTIAADVISAINNDTVLNKEVLATVGGTSSTVVITSKKPTNTTTAAVTGVIFTLTTTTGTSPSVADYVYTINNTFDPALEAGFVIAPEAFSTFTKSDRLSIQVALENLCSAYRYQWAALIDSGAMSEISNTDRAIAEAATYNSVQGHCSYYYPYLINLDDQQVPPSAAVAGMALYRFVIDGFAEPPAGVNFPLKGVKNVAYKVTWEEQNVANPEGVNCILNKENYGIVVWGARTLSADPNIVFISTRIILNIVINTLNRGYDFDIFNSVGGTATVLDNIQRKTNTLLTTLYQAGLFYGQTTSEAFSVLGDASVQVPSLLQQGLVNMFIWVVPSTIIERLIINIKQTAIGDLEATVALDTAALQSSVEEGTATEGTAPVV
tube S 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube T 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube U 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube V 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube W 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube X 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube Y 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
tube Z 167 Unclassified Caudoviricetes MAVSKRPFSINSFAVNLNIGNFVDARYWSKCSKIEKTYNTGEYSDGQSNIIYTLPGAIKYPEVVLSKAFSPGDEELINRLIAVNSDPIAWVTVFIQPMYRDGYYNVPQGGKIILEFCTVARATPINEIDTIGSNAAMFECALNPSRIRSDGGNINWWSEPAAQVAEF
Experimental Data

Method: ELECTRON MICROSCOPY

Deposited Date: 2023-08-11
Deposition Author(s): Li, Q. , Yu, R.C. , Zhou, C.Z.