8IMJ
A'1-a'2, a'3-a'4, b1-b2, c1-c2 cylinder in cyanobacterial phycobilisome from anthocerotibacter panamensis (cluster b)
PDB DOI: 10.2210/pdb8imj/pdb
Classification: PHOTOSYNTHESIS Organism(s): Anthocerotibacter Panamensis
Deposited: 2023-03-07 Deposition Author(s): Ho, M.C. , Ho, M.Y. , Jiang, H.W. , Wang, C.H. , Wu, H.Y. , Yang, C.H.
Experimental Data Snapshot
Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 2.59 Å
A'1-a'2, a'3-a'4, b1-b2, c1-c2 cylinder in cyanobacterial phycobilisome from anthocerotibacter panamensis (cluster b)
Ho, M.C. , Ho, M.Y. , Jiang, H.W. , Wang, C.H. , Wu, H.Y. , Yang, C.H.
Primary Citation of Related Structures: 8IMJ
| Proteins | ||||
|---|---|---|---|---|
| Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Sequence |
| ApcE | 0 | 1136 | Anthocerotibacter Panamensis | MPIKGTSGSNIARPRFYNTVMVETIEGANAEERYFNPGELSSMAGFFNDAQRRLAIVQILTTNAEAIVSRAAGRIFTGGSPMAFSVQQANRQKDAEKERVSARVVQAESEQPIGNEVVIEDKGGFLERLKSFFSYGGAEVETPGFRPIPIAVYGPERMQKSLRDLDWFLRYVNYSLVAGDSNMILLNCLGLREILEKACSIDATIVAVQEMRRAATGYLKSNDDKELVGSYFDVIIRSLNADKSDTPADVVRPSSPDRAGLVLPAIYALAGQSRPAFKMSRTLTSAEKERVVRAAYRQVFERDILAYGQSISYLDSKVKNGEISVKEFIRLLGKSELYRKQFFEPFINSRVLELAFKHFLGRAPESRTEVQNYYSIVAAQGLGGLVDALVDGEEYGRIFGEDTVPFIRDLGQEAQPSWNWGAAYSLYNYAAPRRKVPQFITLYADYVKPLPNQHPYGSGNDPLEIQFGAIFKSETKAPSARPAPIGKDVQRILIRSGNPITNERGNPAGGISDKTSLSPQIFKLTQDNRRIRGKSGKGSLITNAGAGSVEVNVQAVIRAAYQQVFGRQLYEGQHLSVSEIKLENGEISVKEFVRDLATSEIFRKLYWQNFYVCKSIEYIHRRLLGRPTYGRDETNRYYDLAFKKGFAGVVNAILDTMEYAEVFGDDVVPYERYVTPAGLNLRKLRAGTVPTLPSFEETPKFIEKGTAPDRALPQIRSAINQGVSKKRDQRKIFSTVGIQTSLASRTEFDALIRAAYRQVFERDMDSYRITEVFSVLETKLRNREITTKEFIQALASSDLYRKQFFEPYPPTKNVELSLKHLLGRATKDQAELRKYNQIIATQGFKPFINAILDSKEYGEVFGDGTVPYNRYPTLPAANFPNTEILYNQLTKQSAEVVVPSFKPVTSPRGMDMSQTPLMLQAMGDIAEAEQEVALQKPLFIQKGKALRGAEGDPYTIGTRRSPKPIFWVPQGGTNPTEFQNVIRAAYRQVFERDVPDYQRLSYPESRLKNGEISMREFIRQLAESDLYRKQFYEPYPNTKVIELLTKHFLGRAPQDQAEIQRYNRILAGKGLKVAIEEVLNSDEYTQLFGEDVVPFKRYPTLPTGTYLASVATNDEMIQQSGSSYSPSYAGYSYPFS |
| ApcA2 | A | 161 | Anthocerotibacter Panamensis | MSVVTKAIVSADAEARYLSPGELDRIRGFVSSGERRLRVAQTLTESRERIIKQAGDQLFQKRPDLVSPGGNAYGAERTASCLRDLDYYLRLVTFGIVAGDVTPIEEIGVIGVKEMYRNLEVPLPGMVEAVKAMKSVATGLLSGDDSAEVGYYFDYLAGALA |
| ApcA2 | B | 161 | Anthocerotibacter Panamensis | MSVVTKAIVSADAEARYLSPGELDRIRGFVSSGERRLRVAQTLTESRERIIKQAGDQLFQKRPDLVSPGGNAYGAERTASCLRDLDYYLRLVTFGIVAGDVTPIEEIGVIGVKEMYRNLEVPLPGMVEAVKAMKSVATGLLSGDDSAEVGYYFDYLAGALA |
| ApcA2 | C | 161 | Anthocerotibacter Panamensis | MSVVTKAIVSADAEARYLSPGELDRIRGFVSSGERRLRVAQTLTESRERIIKQAGDQLFQKRPDLVSPGGNAYGAERTASCLRDLDYYLRLVTFGIVAGDVTPIEEIGVIGVKEMYRNLEVPLPGMVEAVKAMKSVATGLLSGDDSAEVGYYFDYLAGALA |
| ApcA2 | D | 161 | Anthocerotibacter Panamensis | MSVVTKAIVSADAEARYLSPGELDRIRGFVSSGERRLRVAQTLTESRERIIKQAGDQLFQKRPDLVSPGGNAYGAERTASCLRDLDYYLRLVTFGIVAGDVTPIEEIGVIGVKEMYRNLEVPLPGMVEAVKAMKSVATGLLSGDDSAEVGYYFDYLAGALA |
| ApcA2 | E | 161 | Anthocerotibacter Panamensis | MSVVTKAIVSADAEARYLSPGELDRIRGFVSSGERRLRVAQTLTESRERIIKQAGDQLFQKRPDLVSPGGNAYGAERTASCLRDLDYYLRLVTFGIVAGDVTPIEEIGVIGVKEMYRNLEVPLPGMVEAVKAMKSVATGLLSGDDSAEVGYYFDYLAGALA |
| ApcA2 | N | 161 | Anthocerotibacter Panamensis | MSVVTKAIVSADAEARYLSPGELDRIRGFVSSGERRLRVAQTLTESRERIIKQAGDQLFQKRPDLVSPGGNAYGAERTASCLRDLDYYLRLVTFGIVAGDVTPIEEIGVIGVKEMYRNLEVPLPGMVEAVKAMKSVATGLLSGDDSAEVGYYFDYLAGALA |
| ApcA2 | O | 161 | Anthocerotibacter Panamensis | MSVVTKAIVSADAEARYLSPGELDRIRGFVSSGERRLRVAQTLTESRERIIKQAGDQLFQKRPDLVSPGGNAYGAERTASCLRDLDYYLRLVTFGIVAGDVTPIEEIGVIGVKEMYRNLEVPLPGMVEAVKAMKSVATGLLSGDDSAEVGYYFDYLAGALA |
| ApcA2 | P | 161 | Anthocerotibacter Panamensis | MSVVTKAIVSADAEARYLSPGELDRIRGFVSSGERRLRVAQTLTESRERIIKQAGDQLFQKRPDLVSPGGNAYGAERTASCLRDLDYYLRLVTFGIVAGDVTPIEEIGVIGVKEMYRNLEVPLPGMVEAVKAMKSVATGLLSGDDSAEVGYYFDYLAGALA |
| ApcA2 | Q | 161 | Anthocerotibacter Panamensis | MSVVTKAIVSADAEARYLSPGELDRIRGFVSSGERRLRVAQTLTESRERIIKQAGDQLFQKRPDLVSPGGNAYGAERTASCLRDLDYYLRLVTFGIVAGDVTPIEEIGVIGVKEMYRNLEVPLPGMVEAVKAMKSVATGLLSGDDSAEVGYYFDYLAGALA |
| ApcA2 | R | 161 | Anthocerotibacter Panamensis | MSVVTKAIVSADAEARYLSPGELDRIRGFVSSGERRLRVAQTLTESRERIIKQAGDQLFQKRPDLVSPGGNAYGAERTASCLRDLDYYLRLVTFGIVAGDVTPIEEIGVIGVKEMYRNLEVPLPGMVEAVKAMKSVATGLLSGDDSAEVGYYFDYLAGALA |
| ApcA2 | S | 161 | Anthocerotibacter Panamensis | MSVVTKAIVSADAEARYLSPGELDRIRGFVSSGERRLRVAQTLTESRERIIKQAGDQLFQKRPDLVSPGGNAYGAERTASCLRDLDYYLRLVTFGIVAGDVTPIEEIGVIGVKEMYRNLEVPLPGMVEAVKAMKSVATGLLSGDDSAEVGYYFDYLAGALA |
| ApcA2 | F | 161 | Anthocerotibacter Panamensis | MSVVTKAIVSADAEARYLSPGELDRIRGFVSSGERRLRVAQTLTESRERIIKQAGDQLFQKRPDLVSPGGNAYGAERTASCLRDLDYYLRLVTFGIVAGDVTPIEEIGVIGVKEMYRNLEVPLPGMVEAVKAMKSVATGLLSGDDSAEVGYYFDYLAGALA |
| ApcB2 | G | 162 | Anthocerotibacter Panamensis | MQDAITSVINTYDVQGKYFDTSAFDKLKAYYATGELRVRAAGTISANAATIIKEASAKLFSNQPDLVRPGGNAYTTRRYAACVRDMDYFLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQGIQAMKEVTGSLVGSGAAKEMGVYFDYLSSGLS |
| ApcB2 | H | 162 | Anthocerotibacter Panamensis | MQDAITSVINTYDVQGKYFDTSAFDKLKAYYATGELRVRAAGTISANAATIIKEASAKLFSNQPDLVRPGGNAYTTRRYAACVRDMDYFLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQGIQAMKEVTGSLVGSGAAKEMGVYFDYLSSGLS |
| ApcB2 | I | 162 | Anthocerotibacter Panamensis | MQDAITSVINTYDVQGKYFDTSAFDKLKAYYATGELRVRAAGTISANAATIIKEASAKLFSNQPDLVRPGGNAYTTRRYAACVRDMDYFLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQGIQAMKEVTGSLVGSGAAKEMGVYFDYLSSGLS |
| ApcB2 | J | 162 | Anthocerotibacter Panamensis | MQDAITSVINTYDVQGKYFDTSAFDKLKAYYATGELRVRAAGTISANAATIIKEASAKLFSNQPDLVRPGGNAYTTRRYAACVRDMDYFLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQGIQAMKEVTGSLVGSGAAKEMGVYFDYLSSGLS |
| ApcB2 | K | 162 | Anthocerotibacter Panamensis | MQDAITSVINTYDVQGKYFDTSAFDKLKAYYATGELRVRAAGTISANAATIIKEASAKLFSNQPDLVRPGGNAYTTRRYAACVRDMDYFLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQGIQAMKEVTGSLVGSGAAKEMGVYFDYLSSGLS |
| ApcB2 | L | 162 | Anthocerotibacter Panamensis | MQDAITSVINTYDVQGKYFDTSAFDKLKAYYATGELRVRAAGTISANAATIIKEASAKLFSNQPDLVRPGGNAYTTRRYAACVRDMDYFLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQGIQAMKEVTGSLVGSGAAKEMGVYFDYLSSGLS |
| ApcB2 | T | 162 | Anthocerotibacter Panamensis | MQDAITSVINTYDVQGKYFDTSAFDKLKAYYATGELRVRAAGTISANAATIIKEASAKLFSNQPDLVRPGGNAYTTRRYAACVRDMDYFLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQGIQAMKEVTGSLVGSGAAKEMGVYFDYLSSGLS |
| ApcB2 | U | 162 | Anthocerotibacter Panamensis | MQDAITSVINTYDVQGKYFDTSAFDKLKAYYATGELRVRAAGTISANAATIIKEASAKLFSNQPDLVRPGGNAYTTRRYAACVRDMDYFLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQGIQAMKEVTGSLVGSGAAKEMGVYFDYLSSGLS |
| ApcB2 | V | 162 | Anthocerotibacter Panamensis | MQDAITSVINTYDVQGKYFDTSAFDKLKAYYATGELRVRAAGTISANAATIIKEASAKLFSNQPDLVRPGGNAYTTRRYAACVRDMDYFLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQGIQAMKEVTGSLVGSGAAKEMGVYFDYLSSGLS |
| ApcB2 | W | 162 | Anthocerotibacter Panamensis | MQDAITSVINTYDVQGKYFDTSAFDKLKAYYATGELRVRAAGTISANAATIIKEASAKLFSNQPDLVRPGGNAYTTRRYAACVRDMDYFLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQGIQAMKEVTGSLVGSGAAKEMGVYFDYLSSGLS |
| ApcB2 | X | 162 | Anthocerotibacter Panamensis | MQDAITSVINTYDVQGKYFDTSAFDKLKAYYATGELRVRAAGTISANAATIIKEASAKLFSNQPDLVRPGGNAYTTRRYAACVRDMDYFLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQGIQAMKEVTGSLVGSGAAKEMGVYFDYLSSGLS |
| ApcB2 | Y | 162 | Anthocerotibacter Panamensis | MQDAITSVINTYDVQGKYFDTSAFDKLKAYYATGELRVRAAGTISANAATIIKEASAKLFSNQPDLVRPGGNAYTTRRYAACVRDMDYFLRYATYAMLAGDTSILDERVLNGLKETYNSLGVPISSTVQGIQAMKEVTGSLVGSGAAKEMGVYFDYLSSGLS |
| ApcC2 | M | 68 | Anthocerotibacter Panamensis | MTRLFKVTALIPSYKKVRGGRELQNTYFTKLVEYDRWFAEQQRIQKQGGKILSVKMVAGKPGLNTGVL |
| ApcC2 | Z | 68 | Anthocerotibacter Panamensis | MTRLFKVTALIPSYKKVRGGRELQNTYFTKLVEYDRWFAEQQRIQKQGGKILSVKMVAGKPGLNTGVL |
Experimental Data
Method: ELECTRON MICROSCOPY
Deposited Date: 2023-03-07 Deposition Author(s): Ho, M.C. , Ho, M.Y. , Jiang, H.W. , Wang, C.H. , Wu, H.Y. , Yang, C.H.