PDBi (Protein Data Bank in India)

All in One Protein Databank
Home About Help Resources External Links Contact Us
Advanced Search
FASTA Sequence PDB Format mmCIF Format
FASTA Sequence PDB Format PDB Format(gz) PDBx/mmCIF Format PDBx/mmCIF Format(gz) PDBML/XML Format Validation Full PDF Validation CIF

8C8K

In vitro structure of the nitrosopumilus maritimus s-layer - six-fold symmetry (c6)

PDB DOI: 10.2210/pdb8c8k/pdb

Classification: STRUCTURAL PROTEIN
Organism(s): Nitrosopumilus Maritimus Scm1

Deposited: 2023-01-20
Deposition Author(s): Bharat, T. , Von Kuegelgen, A.

Experimental Data Snapshot

Method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 2.87 Å

8c8k
Literature

In vitro structure of the nitrosopumilus maritimus s-layer - six-fold symmetry (c6)

Bharat, T. , Von Kuegelgen, A.

Primary Citation of Related Structures: 8C8K


Proteins
Molecule Chains Sequence Length Organism Sequence
Cell surface protein A 1734 Nitrosopumilus Maritimus Scm1 MNNEIGRKITSLTLMTIMVAGGLTFAIPGVMPEAMAANANLFVSAENSQFDNYMSGPQVIEVVVIDSDINDTDEAKGEPDVTVNGKVLRMVQAVDGNWYGYFADRDQAQIADSTATTADSGLDFGVFCASSSGTAALGFSTTETDGIAIPITIANATATGNGTQTGSSSGGAITTTCAANTLDASTANGTINVVREAKDPVAASGSVSVGQIGLKNGTANSGPNWPFIQLYELNPTGNVVVQYNKGGGVQSTTLTFDTVDQFAELSLDRTVFPRVSQVHATITDLWLNIDPTDEDSWTFATNTKNTTSSFNVDTFYQVFDENGASGGSALTLRTTLSSLMCEDNCVLTLDVDAQSSGTPVVTIQDNGDSILTQLNASSNTNANNASAFGISTETAKLGTGSIPVTITEQGPNSGVFGTYDESDKSVLKITDNAKRGTSASLDYNETPQTILVGFSFASIDIQPVTDEWTSGQEIPVVIVDADQNKNSRADEDLDLNNPDVTLIPALRTGDPFTIDEGGTPSLIFTNGTNGDDSIFDTGAINNTSAGQVGNFTLNINVTRFSSATNITSTESIDTFSKRLISAQTANSSANFDVDFAIIDLGSATLETLKETVVDEDNTAVGFNFFNYDVRSLGADTVSIALLNTTGNILPWVNNDTRNVDKNNAILLVSNSTNSQAYVDLTNAVSDAVYGSTNTDSNVNIGFAMYFTGVGDLAAKEVIVMDFFSFGFTDDGVQSSERFANQIIRIEAEETGDNTSTFEGSLEYVMVNQINIQDAGTFSGITPIADDPSFIVIEDLTDEDAPRVNYNDLGADGVTTPVSDQEEAPSHSGVVSLNADSYKIADTVVITVEDLDLNVDSDLIDIFTVVSDNSKATDDAVGSATTQSLSFGELGRLLDVTFDDVIWSTPDGANNTATGNDSDTCSTELSNAGITDTGLGATGFTLVETGAATGVFVGDFQIPSFWCRVSDTTTTPYTYAGDEETTTGLDIEVNYVDFRDASGEIVEVGDSAGVRANTGSVSLDRTVYPVPFGTIADSSKAANAAPNGRSVFPIHATGITSTIDSTEELPTGDLTIHVRINDPDFDENPAGEDAMDQDNALKISVIRGSDSVVLGYAGASERTGKIDVGGNNGTISNIRSFGEMDEIAPDAGIFELDVNIKFTDGPASAQCNSHDTLYTALDGTTGKADTNRFDDGAASGQEYCILQGDILQVEYTDPADASGDANTVTDSATFDLRNGVLQSDKSVYIIGSDMILTLIEPDFDLDNDSAETYDLDLIEWDSDAATTTMGNKGVTGAAAAFDPEPTDFRETGDSTGIFQIVIEIPESLSNDKLERGEEIILEYTDWGPSGSDYVGDEDEDVNLTIYTSNFGATVELDQKVYSWTDKVYITIVAPDHNFDSDLVDEIGETDSDPIKVSTRGFDLDNYKLVETGTDTGIFTGEVILTGFTAHDADGDGNTGDATGTTSGSGPTDGLLATDDDDGLTVSFEFSEDETIVGSALIRWNIGEVQWLEASYPASGTGVVRVIDPDMNLDPEAVDNFEVDVWSDSDAGGIDLTVTETNEATGIFEGTVFFTTLDESSGHRLRVSEGDTVTAEYEDNTLPDPYTTADELDITATSLIGTVVPPLERAPAANLRTVDAFGNSLDSVSVDQQVQISADLANGQDREQSFAYLVQIQDANGVTVSLAWITGSLSSGQSFSPALSWIPTEAGTYTATAFVWESVDNPTALSPPVSTTVNVS
Cell surface protein B 1734 Nitrosopumilus Maritimus Scm1 MNNEIGRKITSLTLMTIMVAGGLTFAIPGVMPEAMAANANLFVSAENSQFDNYMSGPQVIEVVVIDSDINDTDEAKGEPDVTVNGKVLRMVQAVDGNWYGYFADRDQAQIADSTATTADSGLDFGVFCASSSGTAALGFSTTETDGIAIPITIANATATGNGTQTGSSSGGAITTTCAANTLDASTANGTINVVREAKDPVAASGSVSVGQIGLKNGTANSGPNWPFIQLYELNPTGNVVVQYNKGGGVQSTTLTFDTVDQFAELSLDRTVFPRVSQVHATITDLWLNIDPTDEDSWTFATNTKNTTSSFNVDTFYQVFDENGASGGSALTLRTTLSSLMCEDNCVLTLDVDAQSSGTPVVTIQDNGDSILTQLNASSNTNANNASAFGISTETAKLGTGSIPVTITEQGPNSGVFGTYDESDKSVLKITDNAKRGTSASLDYNETPQTILVGFSFASIDIQPVTDEWTSGQEIPVVIVDADQNKNSRADEDLDLNNPDVTLIPALRTGDPFTIDEGGTPSLIFTNGTNGDDSIFDTGAINNTSAGQVGNFTLNINVTRFSSATNITSTESIDTFSKRLISAQTANSSANFDVDFAIIDLGSATLETLKETVVDEDNTAVGFNFFNYDVRSLGADTVSIALLNTTGNILPWVNNDTRNVDKNNAILLVSNSTNSQAYVDLTNAVSDAVYGSTNTDSNVNIGFAMYFTGVGDLAAKEVIVMDFFSFGFTDDGVQSSERFANQIIRIEAEETGDNTSTFEGSLEYVMVNQINIQDAGTFSGITPIADDPSFIVIEDLTDEDAPRVNYNDLGADGVTTPVSDQEEAPSHSGVVSLNADSYKIADTVVITVEDLDLNVDSDLIDIFTVVSDNSKATDDAVGSATTQSLSFGELGRLLDVTFDDVIWSTPDGANNTATGNDSDTCSTELSNAGITDTGLGATGFTLVETGAATGVFVGDFQIPSFWCRVSDTTTTPYTYAGDEETTTGLDIEVNYVDFRDASGEIVEVGDSAGVRANTGSVSLDRTVYPVPFGTIADSSKAANAAPNGRSVFPIHATGITSTIDSTEELPTGDLTIHVRINDPDFDENPAGEDAMDQDNALKISVIRGSDSVVLGYAGASERTGKIDVGGNNGTISNIRSFGEMDEIAPDAGIFELDVNIKFTDGPASAQCNSHDTLYTALDGTTGKADTNRFDDGAASGQEYCILQGDILQVEYTDPADASGDANTVTDSATFDLRNGVLQSDKSVYIIGSDMILTLIEPDFDLDNDSAETYDLDLIEWDSDAATTTMGNKGVTGAAAAFDPEPTDFRETGDSTGIFQIVIEIPESLSNDKLERGEEIILEYTDWGPSGSDYVGDEDEDVNLTIYTSNFGATVELDQKVYSWTDKVYITIVAPDHNFDSDLVDEIGETDSDPIKVSTRGFDLDNYKLVETGTDTGIFTGEVILTGFTAHDADGDGNTGDATGTTSGSGPTDGLLATDDDDGLTVSFEFSEDETIVGSALIRWNIGEVQWLEASYPASGTGVVRVIDPDMNLDPEAVDNFEVDVWSDSDAGGIDLTVTETNEATGIFEGTVFFTTLDESSGHRLRVSEGDTVTAEYEDNTLPDPYTTADELDITATSLIGTVVPPLERAPAANLRTVDAFGNSLDSVSVDQQVQISADLANGQDREQSFAYLVQIQDANGVTVSLAWITGSLSSGQSFSPALSWIPTEAGTYTATAFVWESVDNPTALSPPVSTTVNVS
Cell surface protein C 1734 Nitrosopumilus Maritimus Scm1 MNNEIGRKITSLTLMTIMVAGGLTFAIPGVMPEAMAANANLFVSAENSQFDNYMSGPQVIEVVVIDSDINDTDEAKGEPDVTVNGKVLRMVQAVDGNWYGYFADRDQAQIADSTATTADSGLDFGVFCASSSGTAALGFSTTETDGIAIPITIANATATGNGTQTGSSSGGAITTTCAANTLDASTANGTINVVREAKDPVAASGSVSVGQIGLKNGTANSGPNWPFIQLYELNPTGNVVVQYNKGGGVQSTTLTFDTVDQFAELSLDRTVFPRVSQVHATITDLWLNIDPTDEDSWTFATNTKNTTSSFNVDTFYQVFDENGASGGSALTLRTTLSSLMCEDNCVLTLDVDAQSSGTPVVTIQDNGDSILTQLNASSNTNANNASAFGISTETAKLGTGSIPVTITEQGPNSGVFGTYDESDKSVLKITDNAKRGTSASLDYNETPQTILVGFSFASIDIQPVTDEWTSGQEIPVVIVDADQNKNSRADEDLDLNNPDVTLIPALRTGDPFTIDEGGTPSLIFTNGTNGDDSIFDTGAINNTSAGQVGNFTLNINVTRFSSATNITSTESIDTFSKRLISAQTANSSANFDVDFAIIDLGSATLETLKETVVDEDNTAVGFNFFNYDVRSLGADTVSIALLNTTGNILPWVNNDTRNVDKNNAILLVSNSTNSQAYVDLTNAVSDAVYGSTNTDSNVNIGFAMYFTGVGDLAAKEVIVMDFFSFGFTDDGVQSSERFANQIIRIEAEETGDNTSTFEGSLEYVMVNQINIQDAGTFSGITPIADDPSFIVIEDLTDEDAPRVNYNDLGADGVTTPVSDQEEAPSHSGVVSLNADSYKIADTVVITVEDLDLNVDSDLIDIFTVVSDNSKATDDAVGSATTQSLSFGELGRLLDVTFDDVIWSTPDGANNTATGNDSDTCSTELSNAGITDTGLGATGFTLVETGAATGVFVGDFQIPSFWCRVSDTTTTPYTYAGDEETTTGLDIEVNYVDFRDASGEIVEVGDSAGVRANTGSVSLDRTVYPVPFGTIADSSKAANAAPNGRSVFPIHATGITSTIDSTEELPTGDLTIHVRINDPDFDENPAGEDAMDQDNALKISVIRGSDSVVLGYAGASERTGKIDVGGNNGTISNIRSFGEMDEIAPDAGIFELDVNIKFTDGPASAQCNSHDTLYTALDGTTGKADTNRFDDGAASGQEYCILQGDILQVEYTDPADASGDANTVTDSATFDLRNGVLQSDKSVYIIGSDMILTLIEPDFDLDNDSAETYDLDLIEWDSDAATTTMGNKGVTGAAAAFDPEPTDFRETGDSTGIFQIVIEIPESLSNDKLERGEEIILEYTDWGPSGSDYVGDEDEDVNLTIYTSNFGATVELDQKVYSWTDKVYITIVAPDHNFDSDLVDEIGETDSDPIKVSTRGFDLDNYKLVETGTDTGIFTGEVILTGFTAHDADGDGNTGDATGTTSGSGPTDGLLATDDDDGLTVSFEFSEDETIVGSALIRWNIGEVQWLEASYPASGTGVVRVIDPDMNLDPEAVDNFEVDVWSDSDAGGIDLTVTETNEATGIFEGTVFFTTLDESSGHRLRVSEGDTVTAEYEDNTLPDPYTTADELDITATSLIGTVVPPLERAPAANLRTVDAFGNSLDSVSVDQQVQISADLANGQDREQSFAYLVQIQDANGVTVSLAWITGSLSSGQSFSPALSWIPTEAGTYTATAFVWESVDNPTALSPPVSTTVNVS
Cell surface protein D 1734 Nitrosopumilus Maritimus Scm1 MNNEIGRKITSLTLMTIMVAGGLTFAIPGVMPEAMAANANLFVSAENSQFDNYMSGPQVIEVVVIDSDINDTDEAKGEPDVTVNGKVLRMVQAVDGNWYGYFADRDQAQIADSTATTADSGLDFGVFCASSSGTAALGFSTTETDGIAIPITIANATATGNGTQTGSSSGGAITTTCAANTLDASTANGTINVVREAKDPVAASGSVSVGQIGLKNGTANSGPNWPFIQLYELNPTGNVVVQYNKGGGVQSTTLTFDTVDQFAELSLDRTVFPRVSQVHATITDLWLNIDPTDEDSWTFATNTKNTTSSFNVDTFYQVFDENGASGGSALTLRTTLSSLMCEDNCVLTLDVDAQSSGTPVVTIQDNGDSILTQLNASSNTNANNASAFGISTETAKLGTGSIPVTITEQGPNSGVFGTYDESDKSVLKITDNAKRGTSASLDYNETPQTILVGFSFASIDIQPVTDEWTSGQEIPVVIVDADQNKNSRADEDLDLNNPDVTLIPALRTGDPFTIDEGGTPSLIFTNGTNGDDSIFDTGAINNTSAGQVGNFTLNINVTRFSSATNITSTESIDTFSKRLISAQTANSSANFDVDFAIIDLGSATLETLKETVVDEDNTAVGFNFFNYDVRSLGADTVSIALLNTTGNILPWVNNDTRNVDKNNAILLVSNSTNSQAYVDLTNAVSDAVYGSTNTDSNVNIGFAMYFTGVGDLAAKEVIVMDFFSFGFTDDGVQSSERFANQIIRIEAEETGDNTSTFEGSLEYVMVNQINIQDAGTFSGITPIADDPSFIVIEDLTDEDAPRVNYNDLGADGVTTPVSDQEEAPSHSGVVSLNADSYKIADTVVITVEDLDLNVDSDLIDIFTVVSDNSKATDDAVGSATTQSLSFGELGRLLDVTFDDVIWSTPDGANNTATGNDSDTCSTELSNAGITDTGLGATGFTLVETGAATGVFVGDFQIPSFWCRVSDTTTTPYTYAGDEETTTGLDIEVNYVDFRDASGEIVEVGDSAGVRANTGSVSLDRTVYPVPFGTIADSSKAANAAPNGRSVFPIHATGITSTIDSTEELPTGDLTIHVRINDPDFDENPAGEDAMDQDNALKISVIRGSDSVVLGYAGASERTGKIDVGGNNGTISNIRSFGEMDEIAPDAGIFELDVNIKFTDGPASAQCNSHDTLYTALDGTTGKADTNRFDDGAASGQEYCILQGDILQVEYTDPADASGDANTVTDSATFDLRNGVLQSDKSVYIIGSDMILTLIEPDFDLDNDSAETYDLDLIEWDSDAATTTMGNKGVTGAAAAFDPEPTDFRETGDSTGIFQIVIEIPESLSNDKLERGEEIILEYTDWGPSGSDYVGDEDEDVNLTIYTSNFGATVELDQKVYSWTDKVYITIVAPDHNFDSDLVDEIGETDSDPIKVSTRGFDLDNYKLVETGTDTGIFTGEVILTGFTAHDADGDGNTGDATGTTSGSGPTDGLLATDDDDGLTVSFEFSEDETIVGSALIRWNIGEVQWLEASYPASGTGVVRVIDPDMNLDPEAVDNFEVDVWSDSDAGGIDLTVTETNEATGIFEGTVFFTTLDESSGHRLRVSEGDTVTAEYEDNTLPDPYTTADELDITATSLIGTVVPPLERAPAANLRTVDAFGNSLDSVSVDQQVQISADLANGQDREQSFAYLVQIQDANGVTVSLAWITGSLSSGQSFSPALSWIPTEAGTYTATAFVWESVDNPTALSPPVSTTVNVS
Cell surface protein E 1734 Nitrosopumilus Maritimus Scm1 MNNEIGRKITSLTLMTIMVAGGLTFAIPGVMPEAMAANANLFVSAENSQFDNYMSGPQVIEVVVIDSDINDTDEAKGEPDVTVNGKVLRMVQAVDGNWYGYFADRDQAQIADSTATTADSGLDFGVFCASSSGTAALGFSTTETDGIAIPITIANATATGNGTQTGSSSGGAITTTCAANTLDASTANGTINVVREAKDPVAASGSVSVGQIGLKNGTANSGPNWPFIQLYELNPTGNVVVQYNKGGGVQSTTLTFDTVDQFAELSLDRTVFPRVSQVHATITDLWLNIDPTDEDSWTFATNTKNTTSSFNVDTFYQVFDENGASGGSALTLRTTLSSLMCEDNCVLTLDVDAQSSGTPVVTIQDNGDSILTQLNASSNTNANNASAFGISTETAKLGTGSIPVTITEQGPNSGVFGTYDESDKSVLKITDNAKRGTSASLDYNETPQTILVGFSFASIDIQPVTDEWTSGQEIPVVIVDADQNKNSRADEDLDLNNPDVTLIPALRTGDPFTIDEGGTPSLIFTNGTNGDDSIFDTGAINNTSAGQVGNFTLNINVTRFSSATNITSTESIDTFSKRLISAQTANSSANFDVDFAIIDLGSATLETLKETVVDEDNTAVGFNFFNYDVRSLGADTVSIALLNTTGNILPWVNNDTRNVDKNNAILLVSNSTNSQAYVDLTNAVSDAVYGSTNTDSNVNIGFAMYFTGVGDLAAKEVIVMDFFSFGFTDDGVQSSERFANQIIRIEAEETGDNTSTFEGSLEYVMVNQINIQDAGTFSGITPIADDPSFIVIEDLTDEDAPRVNYNDLGADGVTTPVSDQEEAPSHSGVVSLNADSYKIADTVVITVEDLDLNVDSDLIDIFTVVSDNSKATDDAVGSATTQSLSFGELGRLLDVTFDDVIWSTPDGANNTATGNDSDTCSTELSNAGITDTGLGATGFTLVETGAATGVFVGDFQIPSFWCRVSDTTTTPYTYAGDEETTTGLDIEVNYVDFRDASGEIVEVGDSAGVRANTGSVSLDRTVYPVPFGTIADSSKAANAAPNGRSVFPIHATGITSTIDSTEELPTGDLTIHVRINDPDFDENPAGEDAMDQDNALKISVIRGSDSVVLGYAGASERTGKIDVGGNNGTISNIRSFGEMDEIAPDAGIFELDVNIKFTDGPASAQCNSHDTLYTALDGTTGKADTNRFDDGAASGQEYCILQGDILQVEYTDPADASGDANTVTDSATFDLRNGVLQSDKSVYIIGSDMILTLIEPDFDLDNDSAETYDLDLIEWDSDAATTTMGNKGVTGAAAAFDPEPTDFRETGDSTGIFQIVIEIPESLSNDKLERGEEIILEYTDWGPSGSDYVGDEDEDVNLTIYTSNFGATVELDQKVYSWTDKVYITIVAPDHNFDSDLVDEIGETDSDPIKVSTRGFDLDNYKLVETGTDTGIFTGEVILTGFTAHDADGDGNTGDATGTTSGSGPTDGLLATDDDDGLTVSFEFSEDETIVGSALIRWNIGEVQWLEASYPASGTGVVRVIDPDMNLDPEAVDNFEVDVWSDSDAGGIDLTVTETNEATGIFEGTVFFTTLDESSGHRLRVSEGDTVTAEYEDNTLPDPYTTADELDITATSLIGTVVPPLERAPAANLRTVDAFGNSLDSVSVDQQVQISADLANGQDREQSFAYLVQIQDANGVTVSLAWITGSLSSGQSFSPALSWIPTEAGTYTATAFVWESVDNPTALSPPVSTTVNVS
Cell surface protein F 1734 Nitrosopumilus Maritimus Scm1 MNNEIGRKITSLTLMTIMVAGGLTFAIPGVMPEAMAANANLFVSAENSQFDNYMSGPQVIEVVVIDSDINDTDEAKGEPDVTVNGKVLRMVQAVDGNWYGYFADRDQAQIADSTATTADSGLDFGVFCASSSGTAALGFSTTETDGIAIPITIANATATGNGTQTGSSSGGAITTTCAANTLDASTANGTINVVREAKDPVAASGSVSVGQIGLKNGTANSGPNWPFIQLYELNPTGNVVVQYNKGGGVQSTTLTFDTVDQFAELSLDRTVFPRVSQVHATITDLWLNIDPTDEDSWTFATNTKNTTSSFNVDTFYQVFDENGASGGSALTLRTTLSSLMCEDNCVLTLDVDAQSSGTPVVTIQDNGDSILTQLNASSNTNANNASAFGISTETAKLGTGSIPVTITEQGPNSGVFGTYDESDKSVLKITDNAKRGTSASLDYNETPQTILVGFSFASIDIQPVTDEWTSGQEIPVVIVDADQNKNSRADEDLDLNNPDVTLIPALRTGDPFTIDEGGTPSLIFTNGTNGDDSIFDTGAINNTSAGQVGNFTLNINVTRFSSATNITSTESIDTFSKRLISAQTANSSANFDVDFAIIDLGSATLETLKETVVDEDNTAVGFNFFNYDVRSLGADTVSIALLNTTGNILPWVNNDTRNVDKNNAILLVSNSTNSQAYVDLTNAVSDAVYGSTNTDSNVNIGFAMYFTGVGDLAAKEVIVMDFFSFGFTDDGVQSSERFANQIIRIEAEETGDNTSTFEGSLEYVMVNQINIQDAGTFSGITPIADDPSFIVIEDLTDEDAPRVNYNDLGADGVTTPVSDQEEAPSHSGVVSLNADSYKIADTVVITVEDLDLNVDSDLIDIFTVVSDNSKATDDAVGSATTQSLSFGELGRLLDVTFDDVIWSTPDGANNTATGNDSDTCSTELSNAGITDTGLGATGFTLVETGAATGVFVGDFQIPSFWCRVSDTTTTPYTYAGDEETTTGLDIEVNYVDFRDASGEIVEVGDSAGVRANTGSVSLDRTVYPVPFGTIADSSKAANAAPNGRSVFPIHATGITSTIDSTEELPTGDLTIHVRINDPDFDENPAGEDAMDQDNALKISVIRGSDSVVLGYAGASERTGKIDVGGNNGTISNIRSFGEMDEIAPDAGIFELDVNIKFTDGPASAQCNSHDTLYTALDGTTGKADTNRFDDGAASGQEYCILQGDILQVEYTDPADASGDANTVTDSATFDLRNGVLQSDKSVYIIGSDMILTLIEPDFDLDNDSAETYDLDLIEWDSDAATTTMGNKGVTGAAAAFDPEPTDFRETGDSTGIFQIVIEIPESLSNDKLERGEEIILEYTDWGPSGSDYVGDEDEDVNLTIYTSNFGATVELDQKVYSWTDKVYITIVAPDHNFDSDLVDEIGETDSDPIKVSTRGFDLDNYKLVETGTDTGIFTGEVILTGFTAHDADGDGNTGDATGTTSGSGPTDGLLATDDDDGLTVSFEFSEDETIVGSALIRWNIGEVQWLEASYPASGTGVVRVIDPDMNLDPEAVDNFEVDVWSDSDAGGIDLTVTETNEATGIFEGTVFFTTLDESSGHRLRVSEGDTVTAEYEDNTLPDPYTTADELDITATSLIGTVVPPLERAPAANLRTVDAFGNSLDSVSVDQQVQISADLANGQDREQSFAYLVQIQDANGVTVSLAWITGSLSSGQSFSPALSWIPTEAGTYTATAFVWESVDNPTALSPPVSTTVNVS
Experimental Data

Method: ELECTRON MICROSCOPY

Deposited Date: 2023-01-20
Deposition Author(s): Bharat, T. , Von Kuegelgen, A.