PDBi (Protein Data Bank in India)

All in One Protein Databank
Home About Help Resources External Links Contact Us
Advanced Search
FASTA Sequence PDB Format mmCIF Format
FASTA Sequence PDB Format PDB Format(gz) PDBx/mmCIF Format PDBx/mmCIF Format(gz) PDBML/XML Format Validation Full PDF Validation CIF

8AFY

Subtomogram average of membrane-bound atg18 oligomers

PDB DOI: 10.2210/pdb8afy/pdb

Classification: MEMBRANE PROTEIN
Organism(s): Saccharomyces Cerevisiae

Deposited: 2022-07-18
Deposition Author(s): Fromm, S. , Gopaldass, N. , Mann, D. , Martinez-Sanchez, A. , Mayer, A. , Sachse, C.

Experimental Data Snapshot

Method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 26.0 Å

8afy
Literature

Subtomogram average of membrane-bound atg18 oligomers

Fromm, S. , Gopaldass, N. , Mann, D. , Martinez-Sanchez, A. , Mayer, A. , Sachse, C.

Primary Citation of Related Structures: 8AFY


Proteins
Molecule Chains Sequence Length Organism Sequence
Autophagy-related protein 18 A 500 Saccharomyces Cerevisiae MSDSSPTINFINFNQTGTCISLGTSKGFKIFNCEPFGKFYSEDSGGYAIVEMLFSTSLLALVGIGDQPALSAARLRIINTKKHSIICEVTFPTSILSVKMNKSRLVVLLQEQIYIYDINTMRLLHTIETNPNPRGLMAMSPSVANSYLVYPSPPKVINSEIKAHATTNNITLSVGGNTETSFKRDQQDAGHSDISDLDQYSSFTKRDDADPTSSNGGNSSIIKNGDVIVFNLETLQPTMVIEAHKGEIAAMAISFDGTLMATASDKGTIIRVFDIETGDKIYQFRRGTYATRIYSISFSEDSQYLAVTGSSKTVHIFKLGHSMSNNKLDSDDSNMEEAAADDSSLDTTSIDALSDEENPTRLAREPYVDASRKTMGRMIRYSSQKLSRRAARTLGQIFPIKVTSLLESSRHFASLKLPVETNSHVMTISSIGSPIDIDTSEYPELFETGNSASTESYHEPVMKMVPIRVVSSDGYLYNFVMDPERGGDCLILSQYSILMD
Autophagy-related protein 18 B 500 Saccharomyces Cerevisiae MSDSSPTINFINFNQTGTCISLGTSKGFKIFNCEPFGKFYSEDSGGYAIVEMLFSTSLLALVGIGDQPALSAARLRIINTKKHSIICEVTFPTSILSVKMNKSRLVVLLQEQIYIYDINTMRLLHTIETNPNPRGLMAMSPSVANSYLVYPSPPKVINSEIKAHATTNNITLSVGGNTETSFKRDQQDAGHSDISDLDQYSSFTKRDDADPTSSNGGNSSIIKNGDVIVFNLETLQPTMVIEAHKGEIAAMAISFDGTLMATASDKGTIIRVFDIETGDKIYQFRRGTYATRIYSISFSEDSQYLAVTGSSKTVHIFKLGHSMSNNKLDSDDSNMEEAAADDSSLDTTSIDALSDEENPTRLAREPYVDASRKTMGRMIRYSSQKLSRRAARTLGQIFPIKVTSLLESSRHFASLKLPVETNSHVMTISSIGSPIDIDTSEYPELFETGNSASTESYHEPVMKMVPIRVVSSDGYLYNFVMDPERGGDCLILSQYSILMD
Autophagy-related protein 18 C 500 Saccharomyces Cerevisiae MSDSSPTINFINFNQTGTCISLGTSKGFKIFNCEPFGKFYSEDSGGYAIVEMLFSTSLLALVGIGDQPALSAARLRIINTKKHSIICEVTFPTSILSVKMNKSRLVVLLQEQIYIYDINTMRLLHTIETNPNPRGLMAMSPSVANSYLVYPSPPKVINSEIKAHATTNNITLSVGGNTETSFKRDQQDAGHSDISDLDQYSSFTKRDDADPTSSNGGNSSIIKNGDVIVFNLETLQPTMVIEAHKGEIAAMAISFDGTLMATASDKGTIIRVFDIETGDKIYQFRRGTYATRIYSISFSEDSQYLAVTGSSKTVHIFKLGHSMSNNKLDSDDSNMEEAAADDSSLDTTSIDALSDEENPTRLAREPYVDASRKTMGRMIRYSSQKLSRRAARTLGQIFPIKVTSLLESSRHFASLKLPVETNSHVMTISSIGSPIDIDTSEYPELFETGNSASTESYHEPVMKMVPIRVVSSDGYLYNFVMDPERGGDCLILSQYSILMD
Autophagy-related protein 18 D 500 Saccharomyces Cerevisiae MSDSSPTINFINFNQTGTCISLGTSKGFKIFNCEPFGKFYSEDSGGYAIVEMLFSTSLLALVGIGDQPALSAARLRIINTKKHSIICEVTFPTSILSVKMNKSRLVVLLQEQIYIYDINTMRLLHTIETNPNPRGLMAMSPSVANSYLVYPSPPKVINSEIKAHATTNNITLSVGGNTETSFKRDQQDAGHSDISDLDQYSSFTKRDDADPTSSNGGNSSIIKNGDVIVFNLETLQPTMVIEAHKGEIAAMAISFDGTLMATASDKGTIIRVFDIETGDKIYQFRRGTYATRIYSISFSEDSQYLAVTGSSKTVHIFKLGHSMSNNKLDSDDSNMEEAAADDSSLDTTSIDALSDEENPTRLAREPYVDASRKTMGRMIRYSSQKLSRRAARTLGQIFPIKVTSLLESSRHFASLKLPVETNSHVMTISSIGSPIDIDTSEYPELFETGNSASTESYHEPVMKMVPIRVVSSDGYLYNFVMDPERGGDCLILSQYSILMD
Autophagy-related protein 18 E 500 Saccharomyces Cerevisiae MSDSSPTINFINFNQTGTCISLGTSKGFKIFNCEPFGKFYSEDSGGYAIVEMLFSTSLLALVGIGDQPALSAARLRIINTKKHSIICEVTFPTSILSVKMNKSRLVVLLQEQIYIYDINTMRLLHTIETNPNPRGLMAMSPSVANSYLVYPSPPKVINSEIKAHATTNNITLSVGGNTETSFKRDQQDAGHSDISDLDQYSSFTKRDDADPTSSNGGNSSIIKNGDVIVFNLETLQPTMVIEAHKGEIAAMAISFDGTLMATASDKGTIIRVFDIETGDKIYQFRRGTYATRIYSISFSEDSQYLAVTGSSKTVHIFKLGHSMSNNKLDSDDSNMEEAAADDSSLDTTSIDALSDEENPTRLAREPYVDASRKTMGRMIRYSSQKLSRRAARTLGQIFPIKVTSLLESSRHFASLKLPVETNSHVMTISSIGSPIDIDTSEYPELFETGNSASTESYHEPVMKMVPIRVVSSDGYLYNFVMDPERGGDCLILSQYSILMD
Autophagy-related protein 18 F 500 Saccharomyces Cerevisiae MSDSSPTINFINFNQTGTCISLGTSKGFKIFNCEPFGKFYSEDSGGYAIVEMLFSTSLLALVGIGDQPALSAARLRIINTKKHSIICEVTFPTSILSVKMNKSRLVVLLQEQIYIYDINTMRLLHTIETNPNPRGLMAMSPSVANSYLVYPSPPKVINSEIKAHATTNNITLSVGGNTETSFKRDQQDAGHSDISDLDQYSSFTKRDDADPTSSNGGNSSIIKNGDVIVFNLETLQPTMVIEAHKGEIAAMAISFDGTLMATASDKGTIIRVFDIETGDKIYQFRRGTYATRIYSISFSEDSQYLAVTGSSKTVHIFKLGHSMSNNKLDSDDSNMEEAAADDSSLDTTSIDALSDEENPTRLAREPYVDASRKTMGRMIRYSSQKLSRRAARTLGQIFPIKVTSLLESSRHFASLKLPVETNSHVMTISSIGSPIDIDTSEYPELFETGNSASTESYHEPVMKMVPIRVVSSDGYLYNFVMDPERGGDCLILSQYSILMD
Autophagy-related protein 18 G 500 Saccharomyces Cerevisiae MSDSSPTINFINFNQTGTCISLGTSKGFKIFNCEPFGKFYSEDSGGYAIVEMLFSTSLLALVGIGDQPALSAARLRIINTKKHSIICEVTFPTSILSVKMNKSRLVVLLQEQIYIYDINTMRLLHTIETNPNPRGLMAMSPSVANSYLVYPSPPKVINSEIKAHATTNNITLSVGGNTETSFKRDQQDAGHSDISDLDQYSSFTKRDDADPTSSNGGNSSIIKNGDVIVFNLETLQPTMVIEAHKGEIAAMAISFDGTLMATASDKGTIIRVFDIETGDKIYQFRRGTYATRIYSISFSEDSQYLAVTGSSKTVHIFKLGHSMSNNKLDSDDSNMEEAAADDSSLDTTSIDALSDEENPTRLAREPYVDASRKTMGRMIRYSSQKLSRRAARTLGQIFPIKVTSLLESSRHFASLKLPVETNSHVMTISSIGSPIDIDTSEYPELFETGNSASTESYHEPVMKMVPIRVVSSDGYLYNFVMDPERGGDCLILSQYSILMD
Autophagy-related protein 18 H 500 Saccharomyces Cerevisiae MSDSSPTINFINFNQTGTCISLGTSKGFKIFNCEPFGKFYSEDSGGYAIVEMLFSTSLLALVGIGDQPALSAARLRIINTKKHSIICEVTFPTSILSVKMNKSRLVVLLQEQIYIYDINTMRLLHTIETNPNPRGLMAMSPSVANSYLVYPSPPKVINSEIKAHATTNNITLSVGGNTETSFKRDQQDAGHSDISDLDQYSSFTKRDDADPTSSNGGNSSIIKNGDVIVFNLETLQPTMVIEAHKGEIAAMAISFDGTLMATASDKGTIIRVFDIETGDKIYQFRRGTYATRIYSISFSEDSQYLAVTGSSKTVHIFKLGHSMSNNKLDSDDSNMEEAAADDSSLDTTSIDALSDEENPTRLAREPYVDASRKTMGRMIRYSSQKLSRRAARTLGQIFPIKVTSLLESSRHFASLKLPVETNSHVMTISSIGSPIDIDTSEYPELFETGNSASTESYHEPVMKMVPIRVVSSDGYLYNFVMDPERGGDCLILSQYSILMD
Experimental Data

Method: ELECTRON MICROSCOPY

Deposited Date: 2022-07-18
Deposition Author(s): Fromm, S. , Gopaldass, N. , Mann, D. , Martinez-Sanchez, A. , Mayer, A. , Sachse, C.