3.4 angstrom cryoem d5 reconstruction of mud crab reovirus
PDB DOI: 10.2210/pdb7xr3/pdb
Classification: VIRUS Organism(s): Scylla Serrata Reovirus Sz-2007
Deposited: 2022-05-09 Deposition Author(s): Gao, Y.Z. , Zhang, Q.F.
3.4 angstrom cryoem d5 reconstruction of mud crab reovirus
Primary Citation of Related Structures: 7XR3
Proteins | ||||
---|---|---|---|---|
Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Sequence |
VP3 | A | 854 | Scylla Serrata Reovirus Sz-2007 | MASTTRLVNDRKQLEQQVKDDARILADARGLNITTVANDSATGGQAIRNVGPNDEATIKALDNVIKQIEALSVIVNRSEKADDAQILGPNTYKQLLEHLFSPEENVYILLPIQAYTGGVIDRRDASFSNFAYSIASKLMMELSAATHNKIFTDYTRIAASALGPEISTEGMPLFSLIESLELTEAETSRLPVIQDSMVIQKSTATVGNAQQGISTINIKRVPFVGSAFQQVIDQLLWEYSTTSLTTKEQRRQRITEMVNDRRIMIQKLTLAEKPQVMRHVTTEINNDLFFKMSPVAQLYIYHLDRAFLDGVGFTPLAEKQQQLQLQLKTNILTANLIRSAINGMNTESNLEVAIKMMQAAQLHRASIEIAFPMNVSLSPEIIVQCFIVWMSIPEQLLSDRSNFIIAAVIWAGFSADDSYADIMRRSARASDRQNYDIIKAALSSRKFKLPRASTTLFDENEPVVRRYQIGRVYAPFPVDRYGSPVYSNCTKVELASDYNAEGFTIRKDDFRALQAVLRIDEDRAADMFTTLRIMISSIPAVWYDAEVVHYPHTAVELEQLAAYGLTGAYPRTNHSVDTIVKTVNNISATYSTIAQMLSTIDLDPTRYGTSESIDKFKIAWENVESVLNMEGNDFVKTIMYAYEDNFPKKDFYMMLKQIASDGQGAHPIAAAIDQLRTIVYREPERFGYIDSVILTHNPDVDTAYNRFFHLHPIVTNQPSNTIKNAQLWNEMRLEQQVEHIKAGPVRIIGPFHVTYNYLSEEEDMPATSHIIMKDNMILNDHLTFNFVKRERRNNKKRVSSFRYKAVEMYVAVRISRFQLEVLRDLHDLVRSRTYLDVSKSPLATTPIRVVEYVR |
VP3 | B | 854 | Scylla Serrata Reovirus Sz-2007 | MASTTRLVNDRKQLEQQVKDDARILADARGLNITTVANDSATGGQAIRNVGPNDEATIKALDNVIKQIEALSVIVNRSEKADDAQILGPNTYKQLLEHLFSPEENVYILLPIQAYTGGVIDRRDASFSNFAYSIASKLMMELSAATHNKIFTDYTRIAASALGPEISTEGMPLFSLIESLELTEAETSRLPVIQDSMVIQKSTATVGNAQQGISTINIKRVPFVGSAFQQVIDQLLWEYSTTSLTTKEQRRQRITEMVNDRRIMIQKLTLAEKPQVMRHVTTEINNDLFFKMSPVAQLYIYHLDRAFLDGVGFTPLAEKQQQLQLQLKTNILTANLIRSAINGMNTESNLEVAIKMMQAAQLHRASIEIAFPMNVSLSPEIIVQCFIVWMSIPEQLLSDRSNFIIAAVIWAGFSADDSYADIMRRSARASDRQNYDIIKAALSSRKFKLPRASTTLFDENEPVVRRYQIGRVYAPFPVDRYGSPVYSNCTKVELASDYNAEGFTIRKDDFRALQAVLRIDEDRAADMFTTLRIMISSIPAVWYDAEVVHYPHTAVELEQLAAYGLTGAYPRTNHSVDTIVKTVNNISATYSTIAQMLSTIDLDPTRYGTSESIDKFKIAWENVESVLNMEGNDFVKTIMYAYEDNFPKKDFYMMLKQIASDGQGAHPIAAAIDQLRTIVYREPERFGYIDSVILTHNPDVDTAYNRFFHLHPIVTNQPSNTIKNAQLWNEMRLEQQVEHIKAGPVRIIGPFHVTYNYLSEEEDMPATSHIIMKDNMILNDHLTFNFVKRERRNNKKRVSSFRYKAVEMYVAVRISRFQLEVLRDLHDLVRSRTYLDVSKSPLATTPIRVVEYVR |
VP3 | C | 854 | Scylla Serrata Reovirus Sz-2007 | MASTTRLVNDRKQLEQQVKDDARILADARGLNITTVANDSATGGQAIRNVGPNDEATIKALDNVIKQIEALSVIVNRSEKADDAQILGPNTYKQLLEHLFSPEENVYILLPIQAYTGGVIDRRDASFSNFAYSIASKLMMELSAATHNKIFTDYTRIAASALGPEISTEGMPLFSLIESLELTEAETSRLPVIQDSMVIQKSTATVGNAQQGISTINIKRVPFVGSAFQQVIDQLLWEYSTTSLTTKEQRRQRITEMVNDRRIMIQKLTLAEKPQVMRHVTTEINNDLFFKMSPVAQLYIYHLDRAFLDGVGFTPLAEKQQQLQLQLKTNILTANLIRSAINGMNTESNLEVAIKMMQAAQLHRASIEIAFPMNVSLSPEIIVQCFIVWMSIPEQLLSDRSNFIIAAVIWAGFSADDSYADIMRRSARASDRQNYDIIKAALSSRKFKLPRASTTLFDENEPVVRRYQIGRVYAPFPVDRYGSPVYSNCTKVELASDYNAEGFTIRKDDFRALQAVLRIDEDRAADMFTTLRIMISSIPAVWYDAEVVHYPHTAVELEQLAAYGLTGAYPRTNHSVDTIVKTVNNISATYSTIAQMLSTIDLDPTRYGTSESIDKFKIAWENVESVLNMEGNDFVKTIMYAYEDNFPKKDFYMMLKQIASDGQGAHPIAAAIDQLRTIVYREPERFGYIDSVILTHNPDVDTAYNRFFHLHPIVTNQPSNTIKNAQLWNEMRLEQQVEHIKAGPVRIIGPFHVTYNYLSEEEDMPATSHIIMKDNMILNDHLTFNFVKRERRNNKKRVSSFRYKAVEMYVAVRISRFQLEVLRDLHDLVRSRTYLDVSKSPLATTPIRVVEYVR |
VP3 | D | 854 | Scylla Serrata Reovirus Sz-2007 | MASTTRLVNDRKQLEQQVKDDARILADARGLNITTVANDSATGGQAIRNVGPNDEATIKALDNVIKQIEALSVIVNRSEKADDAQILGPNTYKQLLEHLFSPEENVYILLPIQAYTGGVIDRRDASFSNFAYSIASKLMMELSAATHNKIFTDYTRIAASALGPEISTEGMPLFSLIESLELTEAETSRLPVIQDSMVIQKSTATVGNAQQGISTINIKRVPFVGSAFQQVIDQLLWEYSTTSLTTKEQRRQRITEMVNDRRIMIQKLTLAEKPQVMRHVTTEINNDLFFKMSPVAQLYIYHLDRAFLDGVGFTPLAEKQQQLQLQLKTNILTANLIRSAINGMNTESNLEVAIKMMQAAQLHRASIEIAFPMNVSLSPEIIVQCFIVWMSIPEQLLSDRSNFIIAAVIWAGFSADDSYADIMRRSARASDRQNYDIIKAALSSRKFKLPRASTTLFDENEPVVRRYQIGRVYAPFPVDRYGSPVYSNCTKVELASDYNAEGFTIRKDDFRALQAVLRIDEDRAADMFTTLRIMISSIPAVWYDAEVVHYPHTAVELEQLAAYGLTGAYPRTNHSVDTIVKTVNNISATYSTIAQMLSTIDLDPTRYGTSESIDKFKIAWENVESVLNMEGNDFVKTIMYAYEDNFPKKDFYMMLKQIASDGQGAHPIAAAIDQLRTIVYREPERFGYIDSVILTHNPDVDTAYNRFFHLHPIVTNQPSNTIKNAQLWNEMRLEQQVEHIKAGPVRIIGPFHVTYNYLSEEEDMPATSHIIMKDNMILNDHLTFNFVKRERRNNKKRVSSFRYKAVEMYVAVRISRFQLEVLRDLHDLVRSRTYLDVSKSPLATTPIRVVEYVR |
VP3 | E | 854 | Scylla Serrata Reovirus Sz-2007 | MASTTRLVNDRKQLEQQVKDDARILADARGLNITTVANDSATGGQAIRNVGPNDEATIKALDNVIKQIEALSVIVNRSEKADDAQILGPNTYKQLLEHLFSPEENVYILLPIQAYTGGVIDRRDASFSNFAYSIASKLMMELSAATHNKIFTDYTRIAASALGPEISTEGMPLFSLIESLELTEAETSRLPVIQDSMVIQKSTATVGNAQQGISTINIKRVPFVGSAFQQVIDQLLWEYSTTSLTTKEQRRQRITEMVNDRRIMIQKLTLAEKPQVMRHVTTEINNDLFFKMSPVAQLYIYHLDRAFLDGVGFTPLAEKQQQLQLQLKTNILTANLIRSAINGMNTESNLEVAIKMMQAAQLHRASIEIAFPMNVSLSPEIIVQCFIVWMSIPEQLLSDRSNFIIAAVIWAGFSADDSYADIMRRSARASDRQNYDIIKAALSSRKFKLPRASTTLFDENEPVVRRYQIGRVYAPFPVDRYGSPVYSNCTKVELASDYNAEGFTIRKDDFRALQAVLRIDEDRAADMFTTLRIMISSIPAVWYDAEVVHYPHTAVELEQLAAYGLTGAYPRTNHSVDTIVKTVNNISATYSTIAQMLSTIDLDPTRYGTSESIDKFKIAWENVESVLNMEGNDFVKTIMYAYEDNFPKKDFYMMLKQIASDGQGAHPIAAAIDQLRTIVYREPERFGYIDSVILTHNPDVDTAYNRFFHLHPIVTNQPSNTIKNAQLWNEMRLEQQVEHIKAGPVRIIGPFHVTYNYLSEEEDMPATSHIIMKDNMILNDHLTFNFVKRERRNNKKRVSSFRYKAVEMYVAVRISRFQLEVLRDLHDLVRSRTYLDVSKSPLATTPIRVVEYVR |
VP3 | F | 854 | Scylla Serrata Reovirus Sz-2007 | MASTTRLVNDRKQLEQQVKDDARILADARGLNITTVANDSATGGQAIRNVGPNDEATIKALDNVIKQIEALSVIVNRSEKADDAQILGPNTYKQLLEHLFSPEENVYILLPIQAYTGGVIDRRDASFSNFAYSIASKLMMELSAATHNKIFTDYTRIAASALGPEISTEGMPLFSLIESLELTEAETSRLPVIQDSMVIQKSTATVGNAQQGISTINIKRVPFVGSAFQQVIDQLLWEYSTTSLTTKEQRRQRITEMVNDRRIMIQKLTLAEKPQVMRHVTTEINNDLFFKMSPVAQLYIYHLDRAFLDGVGFTPLAEKQQQLQLQLKTNILTANLIRSAINGMNTESNLEVAIKMMQAAQLHRASIEIAFPMNVSLSPEIIVQCFIVWMSIPEQLLSDRSNFIIAAVIWAGFSADDSYADIMRRSARASDRQNYDIIKAALSSRKFKLPRASTTLFDENEPVVRRYQIGRVYAPFPVDRYGSPVYSNCTKVELASDYNAEGFTIRKDDFRALQAVLRIDEDRAADMFTTLRIMISSIPAVWYDAEVVHYPHTAVELEQLAAYGLTGAYPRTNHSVDTIVKTVNNISATYSTIAQMLSTIDLDPTRYGTSESIDKFKIAWENVESVLNMEGNDFVKTIMYAYEDNFPKKDFYMMLKQIASDGQGAHPIAAAIDQLRTIVYREPERFGYIDSVILTHNPDVDTAYNRFFHLHPIVTNQPSNTIKNAQLWNEMRLEQQVEHIKAGPVRIIGPFHVTYNYLSEEEDMPATSHIIMKDNMILNDHLTFNFVKRERRNNKKRVSSFRYKAVEMYVAVRISRFQLEVLRDLHDLVRSRTYLDVSKSPLATTPIRVVEYVR |
VP3 | G | 854 | Scylla Serrata Reovirus Sz-2007 | MASTTRLVNDRKQLEQQVKDDARILADARGLNITTVANDSATGGQAIRNVGPNDEATIKALDNVIKQIEALSVIVNRSEKADDAQILGPNTYKQLLEHLFSPEENVYILLPIQAYTGGVIDRRDASFSNFAYSIASKLMMELSAATHNKIFTDYTRIAASALGPEISTEGMPLFSLIESLELTEAETSRLPVIQDSMVIQKSTATVGNAQQGISTINIKRVPFVGSAFQQVIDQLLWEYSTTSLTTKEQRRQRITEMVNDRRIMIQKLTLAEKPQVMRHVTTEINNDLFFKMSPVAQLYIYHLDRAFLDGVGFTPLAEKQQQLQLQLKTNILTANLIRSAINGMNTESNLEVAIKMMQAAQLHRASIEIAFPMNVSLSPEIIVQCFIVWMSIPEQLLSDRSNFIIAAVIWAGFSADDSYADIMRRSARASDRQNYDIIKAALSSRKFKLPRASTTLFDENEPVVRRYQIGRVYAPFPVDRYGSPVYSNCTKVELASDYNAEGFTIRKDDFRALQAVLRIDEDRAADMFTTLRIMISSIPAVWYDAEVVHYPHTAVELEQLAAYGLTGAYPRTNHSVDTIVKTVNNISATYSTIAQMLSTIDLDPTRYGTSESIDKFKIAWENVESVLNMEGNDFVKTIMYAYEDNFPKKDFYMMLKQIASDGQGAHPIAAAIDQLRTIVYREPERFGYIDSVILTHNPDVDTAYNRFFHLHPIVTNQPSNTIKNAQLWNEMRLEQQVEHIKAGPVRIIGPFHVTYNYLSEEEDMPATSHIIMKDNMILNDHLTFNFVKRERRNNKKRVSSFRYKAVEMYVAVRISRFQLEVLRDLHDLVRSRTYLDVSKSPLATTPIRVVEYVR |
VP3 | H | 854 | Scylla Serrata Reovirus Sz-2007 | MASTTRLVNDRKQLEQQVKDDARILADARGLNITTVANDSATGGQAIRNVGPNDEATIKALDNVIKQIEALSVIVNRSEKADDAQILGPNTYKQLLEHLFSPEENVYILLPIQAYTGGVIDRRDASFSNFAYSIASKLMMELSAATHNKIFTDYTRIAASALGPEISTEGMPLFSLIESLELTEAETSRLPVIQDSMVIQKSTATVGNAQQGISTINIKRVPFVGSAFQQVIDQLLWEYSTTSLTTKEQRRQRITEMVNDRRIMIQKLTLAEKPQVMRHVTTEINNDLFFKMSPVAQLYIYHLDRAFLDGVGFTPLAEKQQQLQLQLKTNILTANLIRSAINGMNTESNLEVAIKMMQAAQLHRASIEIAFPMNVSLSPEIIVQCFIVWMSIPEQLLSDRSNFIIAAVIWAGFSADDSYADIMRRSARASDRQNYDIIKAALSSRKFKLPRASTTLFDENEPVVRRYQIGRVYAPFPVDRYGSPVYSNCTKVELASDYNAEGFTIRKDDFRALQAVLRIDEDRAADMFTTLRIMISSIPAVWYDAEVVHYPHTAVELEQLAAYGLTGAYPRTNHSVDTIVKTVNNISATYSTIAQMLSTIDLDPTRYGTSESIDKFKIAWENVESVLNMEGNDFVKTIMYAYEDNFPKKDFYMMLKQIASDGQGAHPIAAAIDQLRTIVYREPERFGYIDSVILTHNPDVDTAYNRFFHLHPIVTNQPSNTIKNAQLWNEMRLEQQVEHIKAGPVRIIGPFHVTYNYLSEEEDMPATSHIIMKDNMILNDHLTFNFVKRERRNNKKRVSSFRYKAVEMYVAVRISRFQLEVLRDLHDLVRSRTYLDVSKSPLATTPIRVVEYVR |
VP3 | I | 854 | Scylla Serrata Reovirus Sz-2007 | MASTTRLVNDRKQLEQQVKDDARILADARGLNITTVANDSATGGQAIRNVGPNDEATIKALDNVIKQIEALSVIVNRSEKADDAQILGPNTYKQLLEHLFSPEENVYILLPIQAYTGGVIDRRDASFSNFAYSIASKLMMELSAATHNKIFTDYTRIAASALGPEISTEGMPLFSLIESLELTEAETSRLPVIQDSMVIQKSTATVGNAQQGISTINIKRVPFVGSAFQQVIDQLLWEYSTTSLTTKEQRRQRITEMVNDRRIMIQKLTLAEKPQVMRHVTTEINNDLFFKMSPVAQLYIYHLDRAFLDGVGFTPLAEKQQQLQLQLKTNILTANLIRSAINGMNTESNLEVAIKMMQAAQLHRASIEIAFPMNVSLSPEIIVQCFIVWMSIPEQLLSDRSNFIIAAVIWAGFSADDSYADIMRRSARASDRQNYDIIKAALSSRKFKLPRASTTLFDENEPVVRRYQIGRVYAPFPVDRYGSPVYSNCTKVELASDYNAEGFTIRKDDFRALQAVLRIDEDRAADMFTTLRIMISSIPAVWYDAEVVHYPHTAVELEQLAAYGLTGAYPRTNHSVDTIVKTVNNISATYSTIAQMLSTIDLDPTRYGTSESIDKFKIAWENVESVLNMEGNDFVKTIMYAYEDNFPKKDFYMMLKQIASDGQGAHPIAAAIDQLRTIVYREPERFGYIDSVILTHNPDVDTAYNRFFHLHPIVTNQPSNTIKNAQLWNEMRLEQQVEHIKAGPVRIIGPFHVTYNYLSEEEDMPATSHIIMKDNMILNDHLTFNFVKRERRNNKKRVSSFRYKAVEMYVAVRISRFQLEVLRDLHDLVRSRTYLDVSKSPLATTPIRVVEYVR |
VP3 | J | 854 | Scylla Serrata Reovirus Sz-2007 | MASTTRLVNDRKQLEQQVKDDARILADARGLNITTVANDSATGGQAIRNVGPNDEATIKALDNVIKQIEALSVIVNRSEKADDAQILGPNTYKQLLEHLFSPEENVYILLPIQAYTGGVIDRRDASFSNFAYSIASKLMMELSAATHNKIFTDYTRIAASALGPEISTEGMPLFSLIESLELTEAETSRLPVIQDSMVIQKSTATVGNAQQGISTINIKRVPFVGSAFQQVIDQLLWEYSTTSLTTKEQRRQRITEMVNDRRIMIQKLTLAEKPQVMRHVTTEINNDLFFKMSPVAQLYIYHLDRAFLDGVGFTPLAEKQQQLQLQLKTNILTANLIRSAINGMNTESNLEVAIKMMQAAQLHRASIEIAFPMNVSLSPEIIVQCFIVWMSIPEQLLSDRSNFIIAAVIWAGFSADDSYADIMRRSARASDRQNYDIIKAALSSRKFKLPRASTTLFDENEPVVRRYQIGRVYAPFPVDRYGSPVYSNCTKVELASDYNAEGFTIRKDDFRALQAVLRIDEDRAADMFTTLRIMISSIPAVWYDAEVVHYPHTAVELEQLAAYGLTGAYPRTNHSVDTIVKTVNNISATYSTIAQMLSTIDLDPTRYGTSESIDKFKIAWENVESVLNMEGNDFVKTIMYAYEDNFPKKDFYMMLKQIASDGQGAHPIAAAIDQLRTIVYREPERFGYIDSVILTHNPDVDTAYNRFFHLHPIVTNQPSNTIKNAQLWNEMRLEQQVEHIKAGPVRIIGPFHVTYNYLSEEEDMPATSHIIMKDNMILNDHLTFNFVKRERRNNKKRVSSFRYKAVEMYVAVRISRFQLEVLRDLHDLVRSRTYLDVSKSPLATTPIRVVEYVR |
VP1 | Z | 1425 | Scylla Serrata Reovirus Sz-2007 | MRIMAQRLKELQREIDKKKKERIAEAYLSSVEVTNSSPSLSKQDDALTLPKVSPFLDSTPFTTLHNSLYGQQIHSIDDELAQICKLEYELQTQIADEQITALKHFLTIRTGSPQEIQYVDKEWMKSNQHVPSFLGDVKLMFGDTAGKFRSTSKSVDSIHSITSDVQVTRKKQTRSQIRNSYRVQKKHKVQQPLKPNTLYVYKYKGLPRVVLRFVPKVDTTSNSNSSSASDSKKDKDAFSCDDLSPTWKYILTEAKRAFPDRSYSDCIHPMTWEEWLEENQDHVKVLTQYAHQLDYVTLLQDFNLYVSGGASRVRNIDMSTLPTSINVLDHFELYGDASMKEYVRSGEWYGLLREIEQEGMTVNESEKVFANPDTYVLNVKKYFLRRFQQEIASTGMTPLTDELLNIMFVHWNIIVTAEPKLQVIKDDLLKYYSRYGVDATFDYNMKRSEMTVVTRGHLLAHKVLECALRIVETIYTYDIQDETFKDILIDLGRLIMRDPIYGTTTVRDATTVMKQLMYTQGTQFRRIMFKKYDYSNFNEKLVLKGEQMTNEPPTLLATTHYEEMDKKRIDALIKANQRAGNILSQSSIERCRYTDSLDLVGDANRYFSALTTLEAVAGFASSDLLSGFIDSNESIEFTGTAHLRKLLYHSVREQITTLNTSTVPRPSLPKVLLSSAKDTASASIEPLTFRIYKTTPEYDGESLNLVESTVEMSTRQKKPNLMKAAEILRSTVTTNQEMIISGGTRAVQGGKGARAVYPTKQPYHIAGSLLFHKVDTIVNANKKYRGVSNKYGQGISNAIPHIGVPEIIAVSSDGMAICLALDVSAFDVAQKYTEADIELAMRDGFLDSEISMISGETVLERMNPADLANNLLTNTPPRYKYQTALGDIIILQHDNRSGVPWTGTQNDLVNVSNHHMAYDEYKKRVAELQRQGKISIDVNDKHHIVRVFGDDSTFIMTYDEPPSAEEVHLMCATFVESYQDTAGTLGFAINARKGMIGRYGSEYLKNSAIYGNIKSVNQVKFRGSEKSASYHFGVSEKVSMIRDITDLTITRGCDETRKWKYNLMMLPVDLTTRAGAFRMHNLCSIMTGVGKMYLGGTLNNKLIASYHGSSFGWNFDDNLIKTANSIGAISDSSYDAISTKITNLADFKDSQQRITRDIITSGRLPQHLNRYGKSNILRHILASAAMGPLSQIEKNVNAYNVVMGILNGKLEAPTVLERLNMGFKYVVMSDLKQDDYSPYSCQGLQYRRMLVHWGLNDSRITSFDPKGKLQHLLAKNSQILPIHFDIEFVYRLYLQAGTMGFLQVMSYYQLPDTLTHEMLAAVVALELQLGNDKYAVDMGVYSSQAGQIRINDALMDSIIQHRRGPPLPIIDRTLNRLLLHTYMLMFGLMGKSIDSTKIDPTLSWRAILESNDQRIAQLSELLTAV |
Method: ELECTRON MICROSCOPY
Deposited Date: 2022-05-09 Deposition Author(s): Gao, Y.Z. , Zhang, Q.F.