PDBi (Protein Data Bank in India)

All in One Protein Databank
Home About Help Resources External Links Contact Us
Advanced Search
FASTA Sequence PDB Format mmCIF Format
FASTA Sequence PDB Format PDB Format(gz) PDBx/mmCIF Format PDBx/mmCIF Format(gz) PDBML/XML Format Validation Full PDF Validation CIF

7W1D

Crystal structure of klebsiella pneumoniae k1 capsule-specific polysaccharide lyase in a c2 crystal form

PDB DOI: 10.2210/pdb7w1d/pdb

Classification: VIRAL PROTEIN
Organism(s): Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1

Deposited: 2021-11-19
Deposition Author(s): Huang, K.F. , Ko, T.P. , Tu, I.F. , Wu, S.H.

Experimental Data Snapshot

Method: X-RAY DIFFRACTION
Resolution: 2.78 Å

Literature

Crystal structure of klebsiella pneumoniae k1 capsule-specific polysaccharide lyase in a c2 crystal form

Huang, K.F. , Ko, T.P. , Tu, I.F. , Wu, S.H.

Primary Citation of Related Structures: 7W1D


Proteins
Molecule Chains Sequence Length Organism Sequence
K1 LYASE A 671 Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMALIRLVAPERVFSDLASMVAYPNFQVQDKITLLGSAGGDFTFTTTASVVDNGTVFAVPGGYLLRKFVGPAYSSWFSNWTGIVTFMSAPNRHLVVDTVLQATSVLNIKSNSTLEFTDTGRILPDAAVARQVLNITGSAPSVFVPLAADAAAGSKVITVAAGALSAVKGTYLYLRSNKLCDGGPNTYGVKISQIRKVVGVSTSGGVTSIRLDKTLHYNYYLSDAAEVGIPTMVENVTLVSPYINEFGYDDLNRFFTIGISANFAADLHIQDGVIIGNKRPGASDIEGRSAIKFNNCVDSTVKGTCFYNIGWYGVEVLGCSEDTEVHDIHAMDVRHAISLNWQSTADGDKWGEPIEFLGVNCEAYSTTQAGFDTHDIGKRVKFVRCVSYDSAAAGFQARTNGVEYLNCRAYRAAMDGFASNTGVAFPIYRECLAYDNVRSGFNCSYGGGYVYDCEAHGSQNGVRINGGRVKGGRYTRNSSSHIFVTKDVAETAQTSLEIDGVSMRYDGTGRAVYFHGTVGIDPTLVSMSNNDMTGHGLFWALLSGYTVQPTPPRMSRNLLDDTGIRGVATLVAGEATVNARVRGNFGSVANSFKWVSEVKLTRLTFPSSAGALTVTSVAQNQDVPTPNPDLNSFVIRSSNAADVSQVAWEVYL
K1 LYASE B 671 Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMALIRLVAPERVFSDLASMVAYPNFQVQDKITLLGSAGGDFTFTTTASVVDNGTVFAVPGGYLLRKFVGPAYSSWFSNWTGIVTFMSAPNRHLVVDTVLQATSVLNIKSNSTLEFTDTGRILPDAAVARQVLNITGSAPSVFVPLAADAAAGSKVITVAAGALSAVKGTYLYLRSNKLCDGGPNTYGVKISQIRKVVGVSTSGGVTSIRLDKTLHYNYYLSDAAEVGIPTMVENVTLVSPYINEFGYDDLNRFFTIGISANFAADLHIQDGVIIGNKRPGASDIEGRSAIKFNNCVDSTVKGTCFYNIGWYGVEVLGCSEDTEVHDIHAMDVRHAISLNWQSTADGDKWGEPIEFLGVNCEAYSTTQAGFDTHDIGKRVKFVRCVSYDSAAAGFQARTNGVEYLNCRAYRAAMDGFASNTGVAFPIYRECLAYDNVRSGFNCSYGGGYVYDCEAHGSQNGVRINGGRVKGGRYTRNSSSHIFVTKDVAETAQTSLEIDGVSMRYDGTGRAVYFHGTVGIDPTLVSMSNNDMTGHGLFWALLSGYTVQPTPPRMSRNLLDDTGIRGVATLVAGEATVNARVRGNFGSVANSFKWVSEVKLTRLTFPSSAGALTVTSVAQNQDVPTPNPDLNSFVIRSSNAADVSQVAWEVYL
K1 LYASE C 671 Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMALIRLVAPERVFSDLASMVAYPNFQVQDKITLLGSAGGDFTFTTTASVVDNGTVFAVPGGYLLRKFVGPAYSSWFSNWTGIVTFMSAPNRHLVVDTVLQATSVLNIKSNSTLEFTDTGRILPDAAVARQVLNITGSAPSVFVPLAADAAAGSKVITVAAGALSAVKGTYLYLRSNKLCDGGPNTYGVKISQIRKVVGVSTSGGVTSIRLDKTLHYNYYLSDAAEVGIPTMVENVTLVSPYINEFGYDDLNRFFTIGISANFAADLHIQDGVIIGNKRPGASDIEGRSAIKFNNCVDSTVKGTCFYNIGWYGVEVLGCSEDTEVHDIHAMDVRHAISLNWQSTADGDKWGEPIEFLGVNCEAYSTTQAGFDTHDIGKRVKFVRCVSYDSAAAGFQARTNGVEYLNCRAYRAAMDGFASNTGVAFPIYRECLAYDNVRSGFNCSYGGGYVYDCEAHGSQNGVRINGGRVKGGRYTRNSSSHIFVTKDVAETAQTSLEIDGVSMRYDGTGRAVYFHGTVGIDPTLVSMSNNDMTGHGLFWALLSGYTVQPTPPRMSRNLLDDTGIRGVATLVAGEATVNARVRGNFGSVANSFKWVSEVKLTRLTFPSSAGALTVTSVAQNQDVPTPNPDLNSFVIRSSNAADVSQVAWEVYL
K1 LYASE D 671 Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMALIRLVAPERVFSDLASMVAYPNFQVQDKITLLGSAGGDFTFTTTASVVDNGTVFAVPGGYLLRKFVGPAYSSWFSNWTGIVTFMSAPNRHLVVDTVLQATSVLNIKSNSTLEFTDTGRILPDAAVARQVLNITGSAPSVFVPLAADAAAGSKVITVAAGALSAVKGTYLYLRSNKLCDGGPNTYGVKISQIRKVVGVSTSGGVTSIRLDKTLHYNYYLSDAAEVGIPTMVENVTLVSPYINEFGYDDLNRFFTIGISANFAADLHIQDGVIIGNKRPGASDIEGRSAIKFNNCVDSTVKGTCFYNIGWYGVEVLGCSEDTEVHDIHAMDVRHAISLNWQSTADGDKWGEPIEFLGVNCEAYSTTQAGFDTHDIGKRVKFVRCVSYDSAAAGFQARTNGVEYLNCRAYRAAMDGFASNTGVAFPIYRECLAYDNVRSGFNCSYGGGYVYDCEAHGSQNGVRINGGRVKGGRYTRNSSSHIFVTKDVAETAQTSLEIDGVSMRYDGTGRAVYFHGTVGIDPTLVSMSNNDMTGHGLFWALLSGYTVQPTPPRMSRNLLDDTGIRGVATLVAGEATVNARVRGNFGSVANSFKWVSEVKLTRLTFPSSAGALTVTSVAQNQDVPTPNPDLNSFVIRSSNAADVSQVAWEVYL
K1 LYASE E 671 Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMALIRLVAPERVFSDLASMVAYPNFQVQDKITLLGSAGGDFTFTTTASVVDNGTVFAVPGGYLLRKFVGPAYSSWFSNWTGIVTFMSAPNRHLVVDTVLQATSVLNIKSNSTLEFTDTGRILPDAAVARQVLNITGSAPSVFVPLAADAAAGSKVITVAAGALSAVKGTYLYLRSNKLCDGGPNTYGVKISQIRKVVGVSTSGGVTSIRLDKTLHYNYYLSDAAEVGIPTMVENVTLVSPYINEFGYDDLNRFFTIGISANFAADLHIQDGVIIGNKRPGASDIEGRSAIKFNNCVDSTVKGTCFYNIGWYGVEVLGCSEDTEVHDIHAMDVRHAISLNWQSTADGDKWGEPIEFLGVNCEAYSTTQAGFDTHDIGKRVKFVRCVSYDSAAAGFQARTNGVEYLNCRAYRAAMDGFASNTGVAFPIYRECLAYDNVRSGFNCSYGGGYVYDCEAHGSQNGVRINGGRVKGGRYTRNSSSHIFVTKDVAETAQTSLEIDGVSMRYDGTGRAVYFHGTVGIDPTLVSMSNNDMTGHGLFWALLSGYTVQPTPPRMSRNLLDDTGIRGVATLVAGEATVNARVRGNFGSVANSFKWVSEVKLTRLTFPSSAGALTVTSVAQNQDVPTPNPDLNSFVIRSSNAADVSQVAWEVYL
K1 LYASE F 671 Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMALIRLVAPERVFSDLASMVAYPNFQVQDKITLLGSAGGDFTFTTTASVVDNGTVFAVPGGYLLRKFVGPAYSSWFSNWTGIVTFMSAPNRHLVVDTVLQATSVLNIKSNSTLEFTDTGRILPDAAVARQVLNITGSAPSVFVPLAADAAAGSKVITVAAGALSAVKGTYLYLRSNKLCDGGPNTYGVKISQIRKVVGVSTSGGVTSIRLDKTLHYNYYLSDAAEVGIPTMVENVTLVSPYINEFGYDDLNRFFTIGISANFAADLHIQDGVIIGNKRPGASDIEGRSAIKFNNCVDSTVKGTCFYNIGWYGVEVLGCSEDTEVHDIHAMDVRHAISLNWQSTADGDKWGEPIEFLGVNCEAYSTTQAGFDTHDIGKRVKFVRCVSYDSAAAGFQARTNGVEYLNCRAYRAAMDGFASNTGVAFPIYRECLAYDNVRSGFNCSYGGGYVYDCEAHGSQNGVRINGGRVKGGRYTRNSSSHIFVTKDVAETAQTSLEIDGVSMRYDGTGRAVYFHGTVGIDPTLVSMSNNDMTGHGLFWALLSGYTVQPTPPRMSRNLLDDTGIRGVATLVAGEATVNARVRGNFGSVANSFKWVSEVKLTRLTFPSSAGALTVTSVAQNQDVPTPNPDLNSFVIRSSNAADVSQVAWEVYL
K1 LYASE G 671 Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMALIRLVAPERVFSDLASMVAYPNFQVQDKITLLGSAGGDFTFTTTASVVDNGTVFAVPGGYLLRKFVGPAYSSWFSNWTGIVTFMSAPNRHLVVDTVLQATSVLNIKSNSTLEFTDTGRILPDAAVARQVLNITGSAPSVFVPLAADAAAGSKVITVAAGALSAVKGTYLYLRSNKLCDGGPNTYGVKISQIRKVVGVSTSGGVTSIRLDKTLHYNYYLSDAAEVGIPTMVENVTLVSPYINEFGYDDLNRFFTIGISANFAADLHIQDGVIIGNKRPGASDIEGRSAIKFNNCVDSTVKGTCFYNIGWYGVEVLGCSEDTEVHDIHAMDVRHAISLNWQSTADGDKWGEPIEFLGVNCEAYSTTQAGFDTHDIGKRVKFVRCVSYDSAAAGFQARTNGVEYLNCRAYRAAMDGFASNTGVAFPIYRECLAYDNVRSGFNCSYGGGYVYDCEAHGSQNGVRINGGRVKGGRYTRNSSSHIFVTKDVAETAQTSLEIDGVSMRYDGTGRAVYFHGTVGIDPTLVSMSNNDMTGHGLFWALLSGYTVQPTPPRMSRNLLDDTGIRGVATLVAGEATVNARVRGNFGSVANSFKWVSEVKLTRLTFPSSAGALTVTSVAQNQDVPTPNPDLNSFVIRSSNAADVSQVAWEVYL
K1 LYASE H 671 Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMALIRLVAPERVFSDLASMVAYPNFQVQDKITLLGSAGGDFTFTTTASVVDNGTVFAVPGGYLLRKFVGPAYSSWFSNWTGIVTFMSAPNRHLVVDTVLQATSVLNIKSNSTLEFTDTGRILPDAAVARQVLNITGSAPSVFVPLAADAAAGSKVITVAAGALSAVKGTYLYLRSNKLCDGGPNTYGVKISQIRKVVGVSTSGGVTSIRLDKTLHYNYYLSDAAEVGIPTMVENVTLVSPYINEFGYDDLNRFFTIGISANFAADLHIQDGVIIGNKRPGASDIEGRSAIKFNNCVDSTVKGTCFYNIGWYGVEVLGCSEDTEVHDIHAMDVRHAISLNWQSTADGDKWGEPIEFLGVNCEAYSTTQAGFDTHDIGKRVKFVRCVSYDSAAAGFQARTNGVEYLNCRAYRAAMDGFASNTGVAFPIYRECLAYDNVRSGFNCSYGGGYVYDCEAHGSQNGVRINGGRVKGGRYTRNSSSHIFVTKDVAETAQTSLEIDGVSMRYDGTGRAVYFHGTVGIDPTLVSMSNNDMTGHGLFWALLSGYTVQPTPPRMSRNLLDDTGIRGVATLVAGEATVNARVRGNFGSVANSFKWVSEVKLTRLTFPSSAGALTVTSVAQNQDVPTPNPDLNSFVIRSSNAADVSQVAWEVYL
K1 LYASE I 671 Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMALIRLVAPERVFSDLASMVAYPNFQVQDKITLLGSAGGDFTFTTTASVVDNGTVFAVPGGYLLRKFVGPAYSSWFSNWTGIVTFMSAPNRHLVVDTVLQATSVLNIKSNSTLEFTDTGRILPDAAVARQVLNITGSAPSVFVPLAADAAAGSKVITVAAGALSAVKGTYLYLRSNKLCDGGPNTYGVKISQIRKVVGVSTSGGVTSIRLDKTLHYNYYLSDAAEVGIPTMVENVTLVSPYINEFGYDDLNRFFTIGISANFAADLHIQDGVIIGNKRPGASDIEGRSAIKFNNCVDSTVKGTCFYNIGWYGVEVLGCSEDTEVHDIHAMDVRHAISLNWQSTADGDKWGEPIEFLGVNCEAYSTTQAGFDTHDIGKRVKFVRCVSYDSAAAGFQARTNGVEYLNCRAYRAAMDGFASNTGVAFPIYRECLAYDNVRSGFNCSYGGGYVYDCEAHGSQNGVRINGGRVKGGRYTRNSSSHIFVTKDVAETAQTSLEIDGVSMRYDGTGRAVYFHGTVGIDPTLVSMSNNDMTGHGLFWALLSGYTVQPTPPRMSRNLLDDTGIRGVATLVAGEATVNARVRGNFGSVANSFKWVSEVKLTRLTFPSSAGALTVTSVAQNQDVPTPNPDLNSFVIRSSNAADVSQVAWEVYL
K1 LYASE J 671 Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMALIRLVAPERVFSDLASMVAYPNFQVQDKITLLGSAGGDFTFTTTASVVDNGTVFAVPGGYLLRKFVGPAYSSWFSNWTGIVTFMSAPNRHLVVDTVLQATSVLNIKSNSTLEFTDTGRILPDAAVARQVLNITGSAPSVFVPLAADAAAGSKVITVAAGALSAVKGTYLYLRSNKLCDGGPNTYGVKISQIRKVVGVSTSGGVTSIRLDKTLHYNYYLSDAAEVGIPTMVENVTLVSPYINEFGYDDLNRFFTIGISANFAADLHIQDGVIIGNKRPGASDIEGRSAIKFNNCVDSTVKGTCFYNIGWYGVEVLGCSEDTEVHDIHAMDVRHAISLNWQSTADGDKWGEPIEFLGVNCEAYSTTQAGFDTHDIGKRVKFVRCVSYDSAAAGFQARTNGVEYLNCRAYRAAMDGFASNTGVAFPIYRECLAYDNVRSGFNCSYGGGYVYDCEAHGSQNGVRINGGRVKGGRYTRNSSSHIFVTKDVAETAQTSLEIDGVSMRYDGTGRAVYFHGTVGIDPTLVSMSNNDMTGHGLFWALLSGYTVQPTPPRMSRNLLDDTGIRGVATLVAGEATVNARVRGNFGSVANSFKWVSEVKLTRLTFPSSAGALTVTSVAQNQDVPTPNPDLNSFVIRSSNAADVSQVAWEVYL
K1 LYASE K 671 Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMALIRLVAPERVFSDLASMVAYPNFQVQDKITLLGSAGGDFTFTTTASVVDNGTVFAVPGGYLLRKFVGPAYSSWFSNWTGIVTFMSAPNRHLVVDTVLQATSVLNIKSNSTLEFTDTGRILPDAAVARQVLNITGSAPSVFVPLAADAAAGSKVITVAAGALSAVKGTYLYLRSNKLCDGGPNTYGVKISQIRKVVGVSTSGGVTSIRLDKTLHYNYYLSDAAEVGIPTMVENVTLVSPYINEFGYDDLNRFFTIGISANFAADLHIQDGVIIGNKRPGASDIEGRSAIKFNNCVDSTVKGTCFYNIGWYGVEVLGCSEDTEVHDIHAMDVRHAISLNWQSTADGDKWGEPIEFLGVNCEAYSTTQAGFDTHDIGKRVKFVRCVSYDSAAAGFQARTNGVEYLNCRAYRAAMDGFASNTGVAFPIYRECLAYDNVRSGFNCSYGGGYVYDCEAHGSQNGVRINGGRVKGGRYTRNSSSHIFVTKDVAETAQTSLEIDGVSMRYDGTGRAVYFHGTVGIDPTLVSMSNNDMTGHGLFWALLSGYTVQPTPPRMSRNLLDDTGIRGVATLVAGEATVNARVRGNFGSVANSFKWVSEVKLTRLTFPSSAGALTVTSVAQNQDVPTPNPDLNSFVIRSSNAADVSQVAWEVYL
K1 LYASE L 671 Klebsiella Phage Ntuh-K2044-K1-1 MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMALIRLVAPERVFSDLASMVAYPNFQVQDKITLLGSAGGDFTFTTTASVVDNGTVFAVPGGYLLRKFVGPAYSSWFSNWTGIVTFMSAPNRHLVVDTVLQATSVLNIKSNSTLEFTDTGRILPDAAVARQVLNITGSAPSVFVPLAADAAAGSKVITVAAGALSAVKGTYLYLRSNKLCDGGPNTYGVKISQIRKVVGVSTSGGVTSIRLDKTLHYNYYLSDAAEVGIPTMVENVTLVSPYINEFGYDDLNRFFTIGISANFAADLHIQDGVIIGNKRPGASDIEGRSAIKFNNCVDSTVKGTCFYNIGWYGVEVLGCSEDTEVHDIHAMDVRHAISLNWQSTADGDKWGEPIEFLGVNCEAYSTTQAGFDTHDIGKRVKFVRCVSYDSAAAGFQARTNGVEYLNCRAYRAAMDGFASNTGVAFPIYRECLAYDNVRSGFNCSYGGGYVYDCEAHGSQNGVRINGGRVKGGRYTRNSSSHIFVTKDVAETAQTSLEIDGVSMRYDGTGRAVYFHGTVGIDPTLVSMSNNDMTGHGLFWALLSGYTVQPTPPRMSRNLLDDTGIRGVATLVAGEATVNARVRGNFGSVANSFKWVSEVKLTRLTFPSSAGALTVTSVAQNQDVPTPNPDLNSFVIRSSNAADVSQVAWEVYL
Experimental Data

Method: X-RAY DIFFRACTION

Deposited Date: 2021-11-19
Deposition Author(s): Huang, K.F. , Ko, T.P. , Tu, I.F. , Wu, S.H.