PDBi (Protein Data Bank in India)

All in One Protein Databank
Home About Help Resources External Links Contact Us
Advanced Search
FASTA Sequence PDB Format mmCIF Format
FASTA Sequence PDB Format PDB Format(gz) PDBx/mmCIF Format PDBx/mmCIF Format(gz) PDBML/XML Format Validation Full PDF Validation CIF

7Q9Y

Cryo-em structure of the octameric pore of clostridium perfringens beta-toxin.

PDB DOI: 10.2210/pdb7q9y/pdb

Classification: TOXIN
Organism(s): Clostridium Perfringens Cpe

Deposited: 2021-11-15
Deposition Author(s): Iacovache, I. , Zuber, B.

Experimental Data Snapshot

Method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3.84 Å

7q9y
Literature

Cryo-em structure of the octameric pore of clostridium perfringens beta-toxin.

Iacovache, I. , Zuber, B.

Primary Citation of Related Structures: 7Q9Y


Proteins
Molecule Chains Sequence Length Organism Sequence
Clostridium perfringens beta toxin A 309 Clostridium Perfringens Cpe NDIGKTTTITRNKTSDGYTIITQNDKQIISYQSVDSSSKNEDGFTASIDARFIDDKYSSEMTTLINLTGFMSSKKEDVIKKYNLHDVTNSTAINFPVRYSISILNESINENVKIVDSIPKNTISQKTVSNTMGYKIGGSIEIEENKPKASIESEYAESSTIEYVQPDFSTIQTDHSTSKASWDTKFTETTRGNYNLKSNNPVYGNEMFMYGRYTNVPATENIIPDYQMSKLITGGLNPNMSVVLTAPNGTEESIIKVKMERERNCYYLNWNGANWVGQVYSRLAFDTPNVDSHIFTFKINWLTHKVTAI
Clostridium perfringens beta toxin B 309 Clostridium Perfringens Cpe NDIGKTTTITRNKTSDGYTIITQNDKQIISYQSVDSSSKNEDGFTASIDARFIDDKYSSEMTTLINLTGFMSSKKEDVIKKYNLHDVTNSTAINFPVRYSISILNESINENVKIVDSIPKNTISQKTVSNTMGYKIGGSIEIEENKPKASIESEYAESSTIEYVQPDFSTIQTDHSTSKASWDTKFTETTRGNYNLKSNNPVYGNEMFMYGRYTNVPATENIIPDYQMSKLITGGLNPNMSVVLTAPNGTEESIIKVKMERERNCYYLNWNGANWVGQVYSRLAFDTPNVDSHIFTFKINWLTHKVTAI
Clostridium perfringens beta toxin C 309 Clostridium Perfringens Cpe NDIGKTTTITRNKTSDGYTIITQNDKQIISYQSVDSSSKNEDGFTASIDARFIDDKYSSEMTTLINLTGFMSSKKEDVIKKYNLHDVTNSTAINFPVRYSISILNESINENVKIVDSIPKNTISQKTVSNTMGYKIGGSIEIEENKPKASIESEYAESSTIEYVQPDFSTIQTDHSTSKASWDTKFTETTRGNYNLKSNNPVYGNEMFMYGRYTNVPATENIIPDYQMSKLITGGLNPNMSVVLTAPNGTEESIIKVKMERERNCYYLNWNGANWVGQVYSRLAFDTPNVDSHIFTFKINWLTHKVTAI
Clostridium perfringens beta toxin D 309 Clostridium Perfringens Cpe NDIGKTTTITRNKTSDGYTIITQNDKQIISYQSVDSSSKNEDGFTASIDARFIDDKYSSEMTTLINLTGFMSSKKEDVIKKYNLHDVTNSTAINFPVRYSISILNESINENVKIVDSIPKNTISQKTVSNTMGYKIGGSIEIEENKPKASIESEYAESSTIEYVQPDFSTIQTDHSTSKASWDTKFTETTRGNYNLKSNNPVYGNEMFMYGRYTNVPATENIIPDYQMSKLITGGLNPNMSVVLTAPNGTEESIIKVKMERERNCYYLNWNGANWVGQVYSRLAFDTPNVDSHIFTFKINWLTHKVTAI
Clostridium perfringens beta toxin E 309 Clostridium Perfringens Cpe NDIGKTTTITRNKTSDGYTIITQNDKQIISYQSVDSSSKNEDGFTASIDARFIDDKYSSEMTTLINLTGFMSSKKEDVIKKYNLHDVTNSTAINFPVRYSISILNESINENVKIVDSIPKNTISQKTVSNTMGYKIGGSIEIEENKPKASIESEYAESSTIEYVQPDFSTIQTDHSTSKASWDTKFTETTRGNYNLKSNNPVYGNEMFMYGRYTNVPATENIIPDYQMSKLITGGLNPNMSVVLTAPNGTEESIIKVKMERERNCYYLNWNGANWVGQVYSRLAFDTPNVDSHIFTFKINWLTHKVTAI
Clostridium perfringens beta toxin F 309 Clostridium Perfringens Cpe NDIGKTTTITRNKTSDGYTIITQNDKQIISYQSVDSSSKNEDGFTASIDARFIDDKYSSEMTTLINLTGFMSSKKEDVIKKYNLHDVTNSTAINFPVRYSISILNESINENVKIVDSIPKNTISQKTVSNTMGYKIGGSIEIEENKPKASIESEYAESSTIEYVQPDFSTIQTDHSTSKASWDTKFTETTRGNYNLKSNNPVYGNEMFMYGRYTNVPATENIIPDYQMSKLITGGLNPNMSVVLTAPNGTEESIIKVKMERERNCYYLNWNGANWVGQVYSRLAFDTPNVDSHIFTFKINWLTHKVTAI
Clostridium perfringens beta toxin G 309 Clostridium Perfringens Cpe NDIGKTTTITRNKTSDGYTIITQNDKQIISYQSVDSSSKNEDGFTASIDARFIDDKYSSEMTTLINLTGFMSSKKEDVIKKYNLHDVTNSTAINFPVRYSISILNESINENVKIVDSIPKNTISQKTVSNTMGYKIGGSIEIEENKPKASIESEYAESSTIEYVQPDFSTIQTDHSTSKASWDTKFTETTRGNYNLKSNNPVYGNEMFMYGRYTNVPATENIIPDYQMSKLITGGLNPNMSVVLTAPNGTEESIIKVKMERERNCYYLNWNGANWVGQVYSRLAFDTPNVDSHIFTFKINWLTHKVTAI
Clostridium perfringens beta toxin H 309 Clostridium Perfringens Cpe NDIGKTTTITRNKTSDGYTIITQNDKQIISYQSVDSSSKNEDGFTASIDARFIDDKYSSEMTTLINLTGFMSSKKEDVIKKYNLHDVTNSTAINFPVRYSISILNESINENVKIVDSIPKNTISQKTVSNTMGYKIGGSIEIEENKPKASIESEYAESSTIEYVQPDFSTIQTDHSTSKASWDTKFTETTRGNYNLKSNNPVYGNEMFMYGRYTNVPATENIIPDYQMSKLITGGLNPNMSVVLTAPNGTEESIIKVKMERERNCYYLNWNGANWVGQVYSRLAFDTPNVDSHIFTFKINWLTHKVTAI
Experimental Data

Method: ELECTRON MICROSCOPY

Deposited Date: 2021-11-15
Deposition Author(s): Iacovache, I. , Zuber, B.