PDBi (Protein Data Bank in India)

All in One Protein Databank
Home About Help Resources External Links Contact Us
Advanced Search
FASTA Sequence PDB Format mmCIF Format
FASTA Sequence PDB Format PDB Format(gz) PDBx/mmCIF Format PDBx/mmCIF Format(gz) PDBML/XML Format Validation Full PDF Validation CIF

6J3Q

Capsid structure of a freshwater cyanophage siphoviridae mic1

PDB DOI: 10.2210/pdb6j3q/pdb

Classification: VIRUS
Organism(s): Microcystis Phage Mic1

Deposited: 2019-01-05
Deposition Author(s): Chen, Y. , Jiang, Y.L. , Jin, H. , Ju, J. , Li, W.F. , Yang, F. , Zhang, J.T. , Zhou, C.Z. , Zhou, K.

Experimental Data Snapshot

Method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3.53 Å

6j3q
Literature

Capsid structure of a freshwater cyanophage siphoviridae mic1

Chen, Y. , Jiang, Y.L. , Jin, H. , Ju, J. , Li, W.F. , Yang, F. , Zhang, J.T. , Zhou, C.Z. , Zhou, K.

Primary Citation of Related Structures: 6J3Q


Proteins
Molecule Chains Sequence Length Organism Sequence
major capsid protein A 348 Microcystis Phage Mic1 MAKLNLAVLNNVFSELLTQEINRSATFLGLLSKYPERKSNIQWGVGMGGTTATGVAITGSAPAASMDATLPAQLPISAASVQSTFTLNLKEIEESKEQVTNEELRNLLEAQMRNAVEEIATTLNKKLYDGSGAIADGGLIGLSIAASGQDYAGISSATYPLWNVSEVDAWDANATGTDKRQALKTDFMLELDRKIRYRPGAYDLILTTPKVVEQYKKVFEANRSYQIMTFDGQRVPLIDLGFNVAGYMGRPIIDDVFCSRTRTAAESAITTALGTAVDEGVMYFLKKDDLRFYSTPVVGAFSANGVYTLMRQLAQTSLYVDNFVVGCIPQLQLTTRKNVGVIKNIKVG
cement protein B 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
cement protein C 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
cement protein D 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
major capsid protein E 348 Microcystis Phage Mic1 MAKLNLAVLNNVFSELLTQEINRSATFLGLLSKYPERKSNIQWGVGMGGTTATGVAITGSAPAASMDATLPAQLPISAASVQSTFTLNLKEIEESKEQVTNEELRNLLEAQMRNAVEEIATTLNKKLYDGSGAIADGGLIGLSIAASGQDYAGISSATYPLWNVSEVDAWDANATGTDKRQALKTDFMLELDRKIRYRPGAYDLILTTPKVVEQYKKVFEANRSYQIMTFDGQRVPLIDLGFNVAGYMGRPIIDDVFCSRTRTAAESAITTALGTAVDEGVMYFLKKDDLRFYSTPVVGAFSANGVYTLMRQLAQTSLYVDNFVVGCIPQLQLTTRKNVGVIKNIKVG
major capsid protein F 348 Microcystis Phage Mic1 MAKLNLAVLNNVFSELLTQEINRSATFLGLLSKYPERKSNIQWGVGMGGTTATGVAITGSAPAASMDATLPAQLPISAASVQSTFTLNLKEIEESKEQVTNEELRNLLEAQMRNAVEEIATTLNKKLYDGSGAIADGGLIGLSIAASGQDYAGISSATYPLWNVSEVDAWDANATGTDKRQALKTDFMLELDRKIRYRPGAYDLILTTPKVVEQYKKVFEANRSYQIMTFDGQRVPLIDLGFNVAGYMGRPIIDDVFCSRTRTAAESAITTALGTAVDEGVMYFLKKDDLRFYSTPVVGAFSANGVYTLMRQLAQTSLYVDNFVVGCIPQLQLTTRKNVGVIKNIKVG
major capsid protein U 348 Microcystis Phage Mic1 MAKLNLAVLNNVFSELLTQEINRSATFLGLLSKYPERKSNIQWGVGMGGTTATGVAITGSAPAASMDATLPAQLPISAASVQSTFTLNLKEIEESKEQVTNEELRNLLEAQMRNAVEEIATTLNKKLYDGSGAIADGGLIGLSIAASGQDYAGISSATYPLWNVSEVDAWDANATGTDKRQALKTDFMLELDRKIRYRPGAYDLILTTPKVVEQYKKVFEANRSYQIMTFDGQRVPLIDLGFNVAGYMGRPIIDDVFCSRTRTAAESAITTALGTAVDEGVMYFLKKDDLRFYSTPVVGAFSANGVYTLMRQLAQTSLYVDNFVVGCIPQLQLTTRKNVGVIKNIKVG
major capsid protein V 348 Microcystis Phage Mic1 MAKLNLAVLNNVFSELLTQEINRSATFLGLLSKYPERKSNIQWGVGMGGTTATGVAITGSAPAASMDATLPAQLPISAASVQSTFTLNLKEIEESKEQVTNEELRNLLEAQMRNAVEEIATTLNKKLYDGSGAIADGGLIGLSIAASGQDYAGISSATYPLWNVSEVDAWDANATGTDKRQALKTDFMLELDRKIRYRPGAYDLILTTPKVVEQYKKVFEANRSYQIMTFDGQRVPLIDLGFNVAGYMGRPIIDDVFCSRTRTAAESAITTALGTAVDEGVMYFLKKDDLRFYSTPVVGAFSANGVYTLMRQLAQTSLYVDNFVVGCIPQLQLTTRKNVGVIKNIKVG
major capsid protein W 348 Microcystis Phage Mic1 MAKLNLAVLNNVFSELLTQEINRSATFLGLLSKYPERKSNIQWGVGMGGTTATGVAITGSAPAASMDATLPAQLPISAASVQSTFTLNLKEIEESKEQVTNEELRNLLEAQMRNAVEEIATTLNKKLYDGSGAIADGGLIGLSIAASGQDYAGISSATYPLWNVSEVDAWDANATGTDKRQALKTDFMLELDRKIRYRPGAYDLILTTPKVVEQYKKVFEANRSYQIMTFDGQRVPLIDLGFNVAGYMGRPIIDDVFCSRTRTAAESAITTALGTAVDEGVMYFLKKDDLRFYSTPVVGAFSANGVYTLMRQLAQTSLYVDNFVVGCIPQLQLTTRKNVGVIKNIKVG
major capsid protein X 348 Microcystis Phage Mic1 MAKLNLAVLNNVFSELLTQEINRSATFLGLLSKYPERKSNIQWGVGMGGTTATGVAITGSAPAASMDATLPAQLPISAASVQSTFTLNLKEIEESKEQVTNEELRNLLEAQMRNAVEEIATTLNKKLYDGSGAIADGGLIGLSIAASGQDYAGISSATYPLWNVSEVDAWDANATGTDKRQALKTDFMLELDRKIRYRPGAYDLILTTPKVVEQYKKVFEANRSYQIMTFDGQRVPLIDLGFNVAGYMGRPIIDDVFCSRTRTAAESAITTALGTAVDEGVMYFLKKDDLRFYSTPVVGAFSANGVYTLMRQLAQTSLYVDNFVVGCIPQLQLTTRKNVGVIKNIKVG
major capsid protein Y 348 Microcystis Phage Mic1 MAKLNLAVLNNVFSELLTQEINRSATFLGLLSKYPERKSNIQWGVGMGGTTATGVAITGSAPAASMDATLPAQLPISAASVQSTFTLNLKEIEESKEQVTNEELRNLLEAQMRNAVEEIATTLNKKLYDGSGAIADGGLIGLSIAASGQDYAGISSATYPLWNVSEVDAWDANATGTDKRQALKTDFMLELDRKIRYRPGAYDLILTTPKVVEQYKKVFEANRSYQIMTFDGQRVPLIDLGFNVAGYMGRPIIDDVFCSRTRTAAESAITTALGTAVDEGVMYFLKKDDLRFYSTPVVGAFSANGVYTLMRQLAQTSLYVDNFVVGCIPQLQLTTRKNVGVIKNIKVG
major capsid protein Z 348 Microcystis Phage Mic1 MAKLNLAVLNNVFSELLTQEINRSATFLGLLSKYPERKSNIQWGVGMGGTTATGVAITGSAPAASMDATLPAQLPISAASVQSTFTLNLKEIEESKEQVTNEELRNLLEAQMRNAVEEIATTLNKKLYDGSGAIADGGLIGLSIAASGQDYAGISSATYPLWNVSEVDAWDANATGTDKRQALKTDFMLELDRKIRYRPGAYDLILTTPKVVEQYKKVFEANRSYQIMTFDGQRVPLIDLGFNVAGYMGRPIIDDVFCSRTRTAAESAITTALGTAVDEGVMYFLKKDDLRFYSTPVVGAFSANGVYTLMRQLAQTSLYVDNFVVGCIPQLQLTTRKNVGVIKNIKVG
cement protein 0 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
cement protein 3 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
cement protein 1 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
cement protein 4 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
cement protein 2 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
cement protein 6 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
cement protein 5 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
cement protein 7 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
cement protein 8 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
cement protein 9 99 Microcystis Phage Mic1 MPLVYTPAVRGGANPASGSYLLDPQYVNSGVDILQATYGYNINGTANADQLLQRDAILAILEYALKDTAFVNAIQAVAAGSGVTTPASFVSACVTKLTA
Experimental Data

Method: ELECTRON MICROSCOPY

Deposited Date: 2019-01-05
Deposition Author(s): Chen, Y. , Jiang, Y.L. , Jin, H. , Ju, J. , Li, W.F. , Yang, F. , Zhang, J.T. , Zhou, C.Z. , Zhou, K.