Cryoem structure of type ii secretion system secretin gspd in e.coli k12
PDB DOI: 10.2210/pdb5wq7/pdb
Classification: PROTEIN TRANSPORT Organism(s): Escherichia Coli K-12
Deposited: 2016-11-23 Deposition Author(s): Li, X. , Yan, Z. , Yin, M.
Proteins | ||||
---|---|---|---|---|
Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Sequence |
Putative type II secretion system protein D | A | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | B | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | C | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | D | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | E | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | F | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | G | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | H | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | I | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | J | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | K | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | L | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | M | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | N | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Putative type II secretion system protein D | O | 627 | Escherichia Coli K-12 | ENEQYGANFNNADIRQFVEIVGQHLGKTILIDPSVQGTISVRSNDTFSQQEYYQFFLSILDLYGYSVITLDNGFLKVVRSANVKTSPGMIADSSRPGVGDELVTRIVPLENVPARDLAPLLRQMMDAGSVGNVVHYEPSNVLILTGRASTINKLIEVIKRVDVIGTEKQQIIHLEYASAEDLAEILNQLISESHGKSQMPALLSAKIVADKRTNSLIISGPEKARQRITSLLKSLDVEESEEGNTRVYYLKYAKATNLVEVLTGVSEKLKDEKGNARKPSSSGAMDNVAITADEQTNSLVITADQSVQEKLATVIARLDIRRAQVLVEAIIVEVQDGNGLNLGVQWANKNVGAQQFTNTGLPIFNAAQGVADYKKNGGITSANPAWDMFSAYNGMAAGFFNGDWGVLLTALASNNKNDILATPSIVTLDNKLASFNVGQDVPVLSGSQTTSGDNVFNTVERKTVGTKLKVTPQVNEGDAVLLEIEQEVSSVDSSSNSTLGPTFNTRTIQNAVLVKTGETVVLGGLLDDFSKEQVSKVPLLGDIPLVGQLFRYTSTERAKRNLMVFIRPTIIRDDDVYRSLSKEKYTRYRQEQQQRIDGKSKALVGSEDLPVLDENTFNSHAPAPSSR |
Method: ELECTRON MICROSCOPY