Atomic cryoem structure of a nonenveloped virus suggests how membrane penetration protein is primed for cell entry
PDB DOI: 10.2210/pdb3iyl/pdb
Classification: VIRUS Organism(s): Grass Carp Reovirus
Deposited: 2010-02-02 Deposition Author(s): Fang, Q. , Hui, W. , Jin, L. , Zhang, X. , Zhou, Z.H.
Proteins | ||||
---|---|---|---|---|
Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Sequence |
Outer capsid VP4 | A | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | B | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | C | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | D | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | E | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | F | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | G | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | H | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | I | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | J | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | K | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | L | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | M | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | N | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | O | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | P | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | Q | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | R | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | S | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Outer capsid VP4 | T | 648 | Grass Carp Reovirus | MGNVQTSVNTYNITGDGNSFTPTSDMTSTAAPAIDLKPGVLNPTGKLWRPVGTSVATIDSLAIVSDRFGQYSFVNEGMRETFSKALFDINMWQPLFQATKTGCGPIVLSSFTTTTSGYVGATAGDALDNPVTNGVFISTVQIMNLQRTIAARMRDVALWQKHLDTAMTMLTPDISAGSASCNWKSLLAFAKDILPLDNLCLTYPNEFYNVAIHRYPALKPGNPDTKLPDAQAHPLGEVAGAFNAATSEVGSLVGSSSTLSQAISTMAGKDLDLIEADTPLPVSVFTPSLAPRSYRPAFIKPEDAKWIAEFNNSSLIRKTLTYSGATYTVQLGPGPTRVIDMNAMIDSVLTLDVSGTILPYDTNPDLSTSVPAFVLIQTSVPIQQVTTAANITAITVVSAAGASAINLAINVRGQPRFNMLHLQATFERETITGIPYIYGLGTFLIPSPTSSSNFSNPTLMDGLLTVTPVLLRETTYKGEVVDAIVPATVMANQTSEEVASALANDAIVLVSNHLNKLANVVGDAIPVASRTDDSATSAIVSRLAVQHKLSQVGQASPTPPDYPLLWRRAKRAASMFVSNPSLALQVGIPVLTQSGMLSALTSGVGTALRTGSLGKGVTDASEKLRARQSLTVAKQAFFDQIGSLWPGK |
Core protein VP6 | U | 412 | Grass Carp Reovirus | MAQRQFFGLTYNFYGQPAPLFDLNDLQELAGCYARPWTSRFSHLAISTGSLPVWSARYPSVASRNIVVNTLLGAHLNPFAGGQITSHQGITWRDPVLSSLAPVPAIQPPPVWAVAENVLLDSNNYPTYVLNLSSMWPINQDVHIMTMWALSDQGPIYHLEVPVDPMPAATTAALMAYTGVPIAHLAQTAYRFAGQLPQSPDSTMVSTIRWLSAIWFGSLTGRLNRSRTCNGFYFEFAKPALNPDQAVLKWNDGARAAPPAAAQSSYIRCISPHWQHQIVEVAGALMSQSVTAVTGLPALIDEATLPAWSQGVANLTGNGQGVVPCLDYNPVPMAAARHLQWRQDGLITAAQEAQLNNDYTAYALTIERHLTAMLVANPIAAGRMPIQPFNAADFGQAGQTAAAVALAQAMFV |
Core protein VP6 | V | 412 | Grass Carp Reovirus | MAQRQFFGLTYNFYGQPAPLFDLNDLQELAGCYARPWTSRFSHLAISTGSLPVWSARYPSVASRNIVVNTLLGAHLNPFAGGQITSHQGITWRDPVLSSLAPVPAIQPPPVWAVAENVLLDSNNYPTYVLNLSSMWPINQDVHIMTMWALSDQGPIYHLEVPVDPMPAATTAALMAYTGVPIAHLAQTAYRFAGQLPQSPDSTMVSTIRWLSAIWFGSLTGRLNRSRTCNGFYFEFAKPALNPDQAVLKWNDGARAAPPAAAQSSYIRCISPHWQHQIVEVAGALMSQSVTAVTGLPALIDEATLPAWSQGVANLTGNGQGVVPCLDYNPVPMAAARHLQWRQDGLITAAQEAQLNNDYTAYALTIERHLTAMLVANPIAAGRMPIQPFNAADFGQAGQTAAAVALAQAMFV |
VP1 | W | 1299 | Grass Carp Reovirus | MAAVFGIQLVPKLNTSTTRRTFLPLRFDLLLDRLQSTNLHGVLYRALDFNPVDRSATVIQTYPPLNAWSPHHAFIENPLDYRDWTEFIHDRALAFVGVLTQRYPLTQNAQRYTNPLVLGAAFGDFLNARSIDIFLDRLFYDPTQDSPITAITKFPYQWTIDSNVTTDSVRTSAGCKYITLYGYDPSRPSTPATYGKHRPTYATVFYYSTLPARSRLLANLAAGPTVLEHFDSPTYGPHLLLPQTGDVLGYSSSLISQAALLMVESVMDALRDNANASASTAVTRLDQSYHPVTSFDPSTFNTLLQRATNLALLAVQGVQSESAIPAIPTMSDVRSFVARLMAEGDPQQWFPYRVDQILYWPESPFVPPIGPFYAPFRPVNFPFTTGSYTVVPDASRPLRLLPQYRNATITVQQADDAYEDTALSPLITTHGFCVTGGVFTSIYDISGDPTAYPPAQLVDAPNDYFDRERMARRDLFRRLRAPADRSAIKDRAVFDFLASLVNPTTANPVLDTSFSMAYLGASSAHANADEPVILADIRSGSIPGLPIPRRIVQFGYDVVHGSLLDLSRAVPTGTFGLVYADLDQVEDAGTDMPAANRAAIAMLGTALQMTTAGGVSVLKVNFPTRAFWTQVFNLYATHATTLHLVKPTIVNSSEVFLVFGGRQSNGALRSTTALQRALLSLYARNAAIDRAVTHIPFFGVPDDGTSDLGIDAVRLFDPMFSDAVANLPSNALASLVSRVVPSSIMFTRVPSNGPVSTTIYGKRTFLSNRRRARLRDVPMLITTTLVHQRRFTTPPTFTLFSSEAVPVTTLVAAGYNSFISEQTRNPNLAHLLDLGTGPECRILSLIPPTLQVTMSDSRPCAELMASFDPALTAYVQGDYSTAAFWNGIRCDSATAIFTIGAAAAAAGTDLIAFVQQLIPRIVAAGGTRMWLQLNTPLYEVSSLPDLIEIDLRDHVYRFNGGERVEPYADPVPLQQAIAALLPAAALSWHTLSPTCDWLPYIIGVGSPLNLSDINTAISYSRLTPILHIDTTTPPLRVNPVPTPLNQQCAIRITSLDPAAVLSVQHNGVEVIGGTPGNVISVAGAAALQYILANQEFLLQFTPTLPGIFDVFLTTLGQPPVPRGSFTITPPPTTVALNMPPPRQLDFTDVGNDARITCDPYYQLAVCIFKDGQYVRVNPEKASVVTNAPNRDLHFVLDLADNHVLLYLCDVTPSGLGDRIAFPIVDIYRIAFPRNTPVRASLPYTGGGAHLTSGGNPFMSLTTPPAVLPAGVALAALSTSVATQYPTYTLPAGVYEYVIE |
VP3 | X | 1214 | Grass Carp Reovirus | MPRRSARKAQSAIASPADTNVVPAKDAPTTNSPPSTTSPNQAAADANQQQAGIVSSQSGPNAVGDSAPSSSVNNDGDIITRPTSDSIAAVANATKPAAVVSDPQSMKVTPIVNPSSYVCNVCNARFSTMSALSEHLRSDHRDDASTLLATPMINNAIRSFLTAWDDIRILSPDVSSKSLSAYLDSAVANGPELIIEDTGLCTSFMLLDNIPSAHLTKELIGFTWFMQMYQMTPPLPEGAVNRIVCMTNWASLGDEGRGLEVRLPPPTDSSVHAYKTVLSRGYIDNAQFNPLALRSNVLLMLLQFTLSNLKINKSSTFTSDVTTITSGRMIRAFEGRPELLALAYPGRAVLPTQTKNAQFLSTAIADRIGRLDRANLIGGEVSAMVECMELCDALTLHIRETYIMLLRSMHQDPTQIVQIVNECANNLLNSTIPISLRPTILCPWFASSEDLRLQQVMHLVNISSNTAAALPLVEALSTLLRSVTPLVLDPTVLTNAITTISESTTQTISPISEILRLLQPMGNDYAAFWKCIASWAYNGLVTTVLSEDAFPDSSQSITHLPSMWKCLFLTLAGPMTSDPHSPVKVFMALANLLAQPEPIAIGVPGMHQTTPASQFSHPGVWPPGFLNPQLINPQQAPLLRAFAEHIRANWPQPSEFGYGSTLQGSANLFIPSNRMVYPWPNQPLPRLTVAPTYDSAMSNWISTTIAFFIRVVNSVNMTATVNDLTRRTMTGVMTAMRQVKTMTPFYIQHMCPTELSVLASVTVTPPFQVPFTRLVQNDVITNVLVARVDPAQRGDAAVDIRATHATFAAALPVDPAAIVVAMLCGQTETNLIPSHHYGKAFAPLFASNAMFTRNQRAVITREAFVCARSAVAQCQDAGFLVPRPLDALRQFDVTSAAAAEIMHAVNDAFKTAFDLDGALLDGLALYGDPRIADLSAAYLQYGGNVVREHVPPGPSHIHRALQQVESTFMAEMNLFNVARGNLYLVQTATNGNWSPMAPVAAPPFVRGGPNVRVVGRFGTIVPRPNGLEPQLIDDGNVPRDIAGDWVYPSDVLQVSVAVFRDYVWPMVKAGRTRVLVELGHYVYTLHYYDPQISLDEAPILEEWLSKINPAGIPPVPFCIPIPQVYPCITARRVHYAFTSENNNDSLFSTNAASIDTAFGENAAVSPLRWPGLVDPNYRVGTNDLPNRITLYNSLYRYNFTYPTLDGIMYVRSAT |
VP3 | Y | 1214 | Grass Carp Reovirus | MPRRSARKAQSAIASPADTNVVPAKDAPTTNSPPSTTSPNQAAADANQQQAGIVSSQSGPNAVGDSAPSSSVNNDGDIITRPTSDSIAAVANATKPAAVVSDPQSMKVTPIVNPSSYVCNVCNARFSTMSALSEHLRSDHRDDASTLLATPMINNAIRSFLTAWDDIRILSPDVSSKSLSAYLDSAVANGPELIIEDTGLCTSFMLLDNIPSAHLTKELIGFTWFMQMYQMTPPLPEGAVNRIVCMTNWASLGDEGRGLEVRLPPPTDSSVHAYKTVLSRGYIDNAQFNPLALRSNVLLMLLQFTLSNLKINKSSTFTSDVTTITSGRMIRAFEGRPELLALAYPGRAVLPTQTKNAQFLSTAIADRIGRLDRANLIGGEVSAMVECMELCDALTLHIRETYIMLLRSMHQDPTQIVQIVNECANNLLNSTIPISLRPTILCPWFASSEDLRLQQVMHLVNISSNTAAALPLVEALSTLLRSVTPLVLDPTVLTNAITTISESTTQTISPISEILRLLQPMGNDYAAFWKCIASWAYNGLVTTVLSEDAFPDSSQSITHLPSMWKCLFLTLAGPMTSDPHSPVKVFMALANLLAQPEPIAIGVPGMHQTTPASQFSHPGVWPPGFLNPQLINPQQAPLLRAFAEHIRANWPQPSEFGYGSTLQGSANLFIPSNRMVYPWPNQPLPRLTVAPTYDSAMSNWISTTIAFFIRVVNSVNMTATVNDLTRRTMTGVMTAMRQVKTMTPFYIQHMCPTELSVLASVTVTPPFQVPFTRLVQNDVITNVLVARVDPAQRGDAAVDIRATHATFAAALPVDPAAIVVAMLCGQTETNLIPSHHYGKAFAPLFASNAMFTRNQRAVITREAFVCARSAVAQCQDAGFLVPRPLDALRQFDVTSAAAAEIMHAVNDAFKTAFDLDGALLDGLALYGDPRIADLSAAYLQYGGNVVREHVPPGPSHIHRALQQVESTFMAEMNLFNVARGNLYLVQTATNGNWSPMAPVAAPPFVRGGPNVRVVGRFGTIVPRPNGLEPQLIDDGNVPRDIAGDWVYPSDVLQVSVAVFRDYVWPMVKAGRTRVLVELGHYVYTLHYYDPQISLDEAPILEEWLSKINPAGIPPVPFCIPIPQVYPCITARRVHYAFTSENNNDSLFSTNAASIDTAFGENAAVSPLRWPGLVDPNYRVGTNDLPNRITLYNSLYRYNFTYPTLDGIMYVRSAT |
Method: ELECTRON MICROSCOPY
Deposited Date: 2010-02-02 Deposition Author(s): Fang, Q. , Hui, W. , Jin, L. , Zhang, X. , Zhou, Z.H.