Structure of f420 dependent methylene-tetrahydromethanopterin dehydrogenase in complex with methenyl-tetrahydromethanopterin
PDB DOI: 10.2210/pdb3iqf/pdb
Classification: OXIDOREDUCTASE Organism(s): Methanopyrus Kandleri
Deposited: 2009-08-20 Deposition Author(s): Ceh, K.E. , Demmer, U. , Ermler, U. , Moll, J. , Shima, S. , Thauer, R.K. , Warkentin, E.
Structure of f420 dependent methylene-tetrahydromethanopterin dehydrogenase in complex with methenyl-tetrahydromethanopterin
Ceh, K.E. , Demmer, U. , Ermler, U. , Moll, J. , Shima, S. , Thauer, R.K. , Warkentin, E.
Primary Citation of Related Structures: 3IQF
Proteins | ||||
---|---|---|---|---|
Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Sequence |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | A | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | B | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | C | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | D | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | E | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | F | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | G | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | H | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | I | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | J | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | K | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | L | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
Method: X-RAY DIFFRACTION
Deposited Date: 2009-08-20 Deposition Author(s): Ceh, K.E. , Demmer, U. , Ermler, U. , Moll, J. , Shima, S. , Thauer, R.K. , Warkentin, E.