The structure of native coenzyme f420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase at 2.4a resolution
PDB DOI: 10.2210/pdb1u6j/pdb
Classification: OXIDOREDUCTASE Organism(s): Methanopyrus Kandleri
Deposited: 2004-07-30 Deposition Author(s): Ermler, U. , Hagemeier, C.H. , Shima, S. , Thauer, R.K. , Warkentin, E.
The structure of native coenzyme f420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase at 2.4a resolution
Ermler, U. , Hagemeier, C.H. , Shima, S. , Thauer, R.K. , Warkentin, E.
Primary Citation of Related Structures: 1U6J
Proteins | ||||
---|---|---|---|---|
Molecule | Chains | Sequence Length | Organism | Sequence |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | A | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | B | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | C | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | D | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | E | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | F | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | G | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | H | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | I | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | J | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | K | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase | L | 283 | Methanopyrus Kandleri | MTVAKAIFIKCGNLGTSMMMDMLLDERADREDVEFRVVGTSVKMDPECVEAAVEMALDIAEDFEPDFIVYGGPNPAAPGPSKAREMLADSEYPAVIIGDAPGLKVKDEMEEQGLGYILVKPDAMLGARREFLDPVEMAIYNADLMKVLAATGVFRVVQEAFDELIEKAKEDEISENDLPKLVIDRNTLLEREEFENPYAMVKAMAALEIAENVADVSVEGCFVEQDKERYVPIVASAHEMMRKAAELADEARELEKSNDAVLRTPHAPDGKVLSKRKFMEDPE |
Method: X-RAY DIFFRACTION
Deposited Date: 2004-07-30 Deposition Author(s): Ermler, U. , Hagemeier, C.H. , Shima, S. , Thauer, R.K. , Warkentin, E.