PDBi (Protein Data Bank in India)

All in One Protein Databank
Home About Help Resources External Links Contact Us
Advanced Search
FASTA Sequence PDB Format mmCIF Format
FASTA Sequence PDB Format PDB Format(gz) PDBx/mmCIF Format PDBx/mmCIF Format(gz) PDBML/XML Format Validation Full PDF Validation CIF

1J0B

Crystal structure analysis of the acc deaminase homologue complexed with inhibitor

PDB DOI: 10.2210/pdb1j0b/pdb

Classification: LYASE
Organism(s): Pyrococcus Horikoshii

Deposited: 2002-11-12
Deposition Author(s): Fujino, A. , Honma, M. , Ose, T. , Tanaka, I. , Yao, M.

Experimental Data Snapshot

Method: X-RAY DIFFRACTION
Resolution: 2.7 Å

Literature

Crystal structure analysis of the acc deaminase homologue complexed with inhibitor

Fujino, A. , Honma, M. , Ose, T. , Tanaka, I. , Yao, M.

Primary Citation of Related Structures: 1J0B


Proteins
Molecule Chains Sequence Length Organism Sequence
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase A 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase B 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase C 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase D 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase E 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase F 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase G 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase H 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase I 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase J 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase K 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase L 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase M 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase N 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase O 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase P 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase Q 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase R 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase S 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase T 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase U 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase V 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase W 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase X 325 Pyrococcus Horikoshii MHPKIFALLAKFPRVELIPWETPIQYLPNISREIGADVYIKRDDLTGLGIGGNKIRKLEYLLGDALSKGADVVITVGAVHSNHAFVTGLAAKKLGLDAILVLRGKEELKGNYLLDKIMGIETRVYDAKDSFELMKYAEEIAEELKREGRKPYVIPPGGASPIGTLGYVRAVGEIATQSEVKFDSIVVAAGSGGTLAGLSLGLSILNEDIRPVGIAVGRFGEVMTSKLDNLIKEAAELLGVKVEVRPELYDYSFGEYGKITGEVAQIIRKVGTREGIILDPVYTGKAFYGLVDLARKGELGEKILFIHTGGISGTFHYGDKLLSLL
Experimental Data

Method: X-RAY DIFFRACTION

Deposited Date: 2002-11-12
Deposition Author(s): Fujino, A. , Honma, M. , Ose, T. , Tanaka, I. , Yao, M.