Crystal structure of reduced nuoef variant e222k(nuof) from aquifex aeolicus bound to nad+ Deposition Author(s): Friedrich, T. , Goeppert-Asadollahpour, S. , Wohlwend, D.
Date: 2024-05-29 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 2.54 Å Organism(s): Aquifex Aeolicus Vf5 Sequences Data: 9FIL_A , 9FIL_C , 9FIL_B , 9FIL_D
Circularly permuted lumazine synthase twisted tube with no gap between between double strands Deposition Author(s): Azuma, Y. , Koziej, L.
Date: 2024-07-12 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 2.44 Å Organism(s): Aquifex Aeolicus Vf5 Sequences Data: 9G3H_A , 9G3H_B , 9G3H_C , 9G3H_D , 9G3H_E , 9G3H_F , 9G3H_G , 9G3H_H , 9G3H_I , 9G3H_J , 9G3H_K , 9G3H_L , 9G3H_M , 9G3H_N , 9G3H_O , 9G3H_P , 9G3H_Q , 9G3H_R , 9G3H_S , 9G3H_T , 9G3H_U , 9G3H_V , 9G3H_W , 9G3H_X , 9G3H_Y , 9G3H_Z , 9G3H_AA , 9G3H_BA , 9G3H_CA , 9G3H_DA , 9G3H_EA , 9G3H_FA , 9G3H_GA , 9G3H_HA , 9G3H_IA , 9G3H_JA , 9G3H_KA , 9G3H_LA , 9G3H_MA , 9G3H_NA , 9G3H_OA , 9G3H_PA , 9G3H_QA , 9G3H_RA , 9G3H_SA , 9G3H_TA , 9G3H_UA , 9G3H_VA , 9G3H_WA , 9G3H_XA , 9G3H_YA , 9G3H_ZA , 9G3H_AB , 9G3H_BB , 9G3H_CB , 9G3H_DB , 9G3H_EB , 9G3H_FB , 9G3H_GB , 9G3H_HB , 9G3H_IB , 9G3H_JB , 9G3H_KB , 9G3H_LB , 9G3H_MB , 9G3H_NB , 9G3H_OB , 9G3H_PB , 9G3H_QB , 9G3H_RB , 9G3H_SB , 9G3H_TB , 9G3H_UB , 9G3H_VB , 9G3H_WB , 9G3H_XB , 9G3H_YB , 9G3H_ZB , 9G3H_AC , 9G3H_BC , 9G3H_CC , 9G3H_DC , 9G3H_EC , 9G3H_FC , 9G3H_GC , 9G3H_HC , 9G3H_IC , 9G3H_JC , 9G3H_KC , 9G3H_LC , 9G3H_MC , 9G3H_NC , 9G3H_OC , 9G3H_PC , 9G3H_QC , 9G3H_RC , 9G3H_SC , 9G3H_TC , 9G3H_UC , 9G3H_VC
Circularly permuted lumazine synthase twisted tube with 18 angstrom gap between double strands Deposition Author(s): Azuma, Y. , Koziej, L.
Date: 2024-07-12 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 2.85 Å Organism(s): Aquifex Aeolicus Vf5 Sequences Data: 9G3I_A , 9G3I_B , 9G3I_C , 9G3I_D , 9G3I_E , 9G3I_F , 9G3I_G , 9G3I_H , 9G3I_I , 9G3I_J , 9G3I_K , 9G3I_L , 9G3I_M , 9G3I_N , 9G3I_O , 9G3I_P , 9G3I_Q , 9G3I_R , 9G3I_S , 9G3I_T , 9G3I_U , 9G3I_V , 9G3I_W , 9G3I_X , 9G3I_Y , 9G3I_Z , 9G3I_AA , 9G3I_BA , 9G3I_CA , 9G3I_DA , 9G3I_EA , 9G3I_FA , 9G3I_GA , 9G3I_HA , 9G3I_IA , 9G3I_JA , 9G3I_KA , 9G3I_LA , 9G3I_MA , 9G3I_NA , 9G3I_OA , 9G3I_PA , 9G3I_QA , 9G3I_RA , 9G3I_SA , 9G3I_TA , 9G3I_UA , 9G3I_VA , 9G3I_WA , 9G3I_XA , 9G3I_YA , 9G3I_ZA , 9G3I_AB , 9G3I_BB , 9G3I_CB , 9G3I_DB , 9G3I_EB , 9G3I_FB , 9G3I_GB , 9G3I_HB , 9G3I_IB , 9G3I_JB , 9G3I_KB , 9G3I_LB , 9G3I_MB , 9G3I_NB , 9G3I_OB , 9G3I_PB , 9G3I_QB , 9G3I_RB , 9G3I_SB , 9G3I_TB , 9G3I_UB , 9G3I_VB , 9G3I_WB , 9G3I_XB , 9G3I_YB , 9G3I_ZB , 9G3I_AC , 9G3I_BC , 9G3I_CC , 9G3I_DC , 9G3I_EC , 9G3I_FC , 9G3I_GC , 9G3I_HC , 9G3I_IC , 9G3I_JC , 9G3I_KC , 9G3I_LC , 9G3I_MC , 9G3I_NC , 9G3I_OC , 9G3I_PC , 9G3I_QC , 9G3I_RC , 9G3I_SC , 9G3I_TC , 9G3I_UC , 9G3I_VC
Circularly permuted lumazine synthase twisted tube with 28 angstrom gap between double strands Deposition Author(s): Azuma, Y. , Koziej, L.
Date: 2024-07-12 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 3.1 Å Organism(s): Aquifex Aeolicus Vf5 Sequences Data: 9G3J_A , 9G3J_B , 9G3J_C , 9G3J_D , 9G3J_E , 9G3J_F , 9G3J_G , 9G3J_H , 9G3J_I , 9G3J_J , 9G3J_K , 9G3J_L , 9G3J_M , 9G3J_N , 9G3J_O , 9G3J_P , 9G3J_Q , 9G3J_R , 9G3J_S , 9G3J_T , 9G3J_U , 9G3J_V , 9G3J_W , 9G3J_X , 9G3J_Y , 9G3J_Z , 9G3J_AA , 9G3J_BA , 9G3J_CA , 9G3J_DA , 9G3J_EA , 9G3J_FA , 9G3J_GA , 9G3J_HA , 9G3J_IA , 9G3J_JA , 9G3J_KA , 9G3J_LA , 9G3J_MA , 9G3J_NA , 9G3J_OA , 9G3J_PA , 9G3J_QA , 9G3J_RA , 9G3J_SA , 9G3J_TA , 9G3J_UA , 9G3J_VA , 9G3J_WA , 9G3J_XA , 9G3J_YA , 9G3J_ZA , 9G3J_AB , 9G3J_BB , 9G3J_CB , 9G3J_DB , 9G3J_EB , 9G3J_FB , 9G3J_GB , 9G3J_HB , 9G3J_IB , 9G3J_JB , 9G3J_KB , 9G3J_LB , 9G3J_MB , 9G3J_NB , 9G3J_OB , 9G3J_PB , 9G3J_QB , 9G3J_RB , 9G3J_SB , 9G3J_TB , 9G3J_UB , 9G3J_VB , 9G3J_WB , 9G3J_XB , 9G3J_YB , 9G3J_ZB , 9G3J_AC , 9G3J_BC , 9G3J_CC , 9G3J_DC , 9G3J_EC , 9G3J_FC , 9G3J_GC , 9G3J_HC , 9G3J_IC , 9G3J_JC , 9G3J_KC , 9G3J_LC , 9G3J_MC , 9G3J_NC , 9G3J_OC , 9G3J_PC , 9G3J_QC , 9G3J_RC , 9G3J_SC , 9G3J_TC , 9G3J_UC , 9G3J_VC
Circularly permuted lumazine synthase triple-stranded straight tube Deposition Author(s): Azuma, Y. , Koziej, L.
Date: 2024-07-12 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 3.09 Å Organism(s): Aquifex Aeolicus Vf5 Sequences Data: 9G3M_A , 9G3M_B , 9G3M_C , 9G3M_D , 9G3M_E , 9G3M_F , 9G3M_G , 9G3M_H , 9G3M_I , 9G3M_J , 9G3M_K , 9G3M_L , 9G3M_M , 9G3M_N , 9G3M_O , 9G3M_P , 9G3M_Q , 9G3M_R , 9G3M_S , 9G3M_T , 9G3M_U , 9G3M_V , 9G3M_W , 9G3M_X , 9G3M_Y , 9G3M_Z , 9G3M_AA , 9G3M_BA , 9G3M_CA , 9G3M_DA , 9G3M_EA , 9G3M_FA , 9G3M_GA , 9G3M_HA , 9G3M_IA , 9G3M_JA , 9G3M_KA , 9G3M_LA , 9G3M_MA , 9G3M_NA , 9G3M_OA , 9G3M_PA , 9G3M_QA , 9G3M_RA , 9G3M_SA , 9G3M_TA , 9G3M_UA , 9G3M_VA , 9G3M_WA , 9G3M_XA , 9G3M_YA , 9G3M_ZA , 9G3M_AB , 9G3M_BB , 9G3M_CB , 9G3M_DB , 9G3M_EB , 9G3M_FB , 9G3M_GB , 9G3M_HB , 9G3M_IB , 9G3M_JB , 9G3M_KB , 9G3M_LB , 9G3M_MB , 9G3M_NB , 9G3M_OB , 9G3M_PB , 9G3M_QB , 9G3M_RB , 9G3M_SB , 9G3M_TB , 9G3M_UB , 9G3M_VB , 9G3M_WB , 9G3M_XB , 9G3M_YB , 9G3M_ZB , 9G3M_AC , 9G3M_BC , 9G3M_CC , 9G3M_DC , 9G3M_EC , 9G3M_FC , 9G3M_GC , 9G3M_HC , 9G3M_IC , 9G3M_JC , 9G3M_KC , 9G3M_LC , 9G3M_MC , 9G3M_NC , 9G3M_OC , 9G3M_PC , 9G3M_QC , 9G3M_RC , 9G3M_SC , 9G3M_TC , 9G3M_UC , 9G3M_VC , 9G3M_WC , 9G3M_XC , 9G3M_YC , 9G3M_ZC , 9G3M_AD , 9G3M_BD , 9G3M_CD , 9G3M_DD , 9G3M_ED , 9G3M_FD , 9G3M_GD , 9G3M_HD , 9G3M_ID , 9G3M_JD , 9G3M_KD , 9G3M_LD , 9G3M_MD , 9G3M_ND , 9G3M_OD , 9G3M_PD , 9G3M_QD , 9G3M_RD , 9G3M_SD , 9G3M_TD , 9G3M_UD , 9G3M_VD , 9G3M_WD , 9G3M_XD , 9G3M_YD , 9G3M_ZD , 9G3M_AE , 9G3M_BE , 9G3M_CE , 9G3M_DE , 9G3M_EE , 9G3M_FE , 9G3M_GE , 9G3M_HE , 9G3M_IE , 9G3M_JE , 9G3M_KE , 9G3M_LE , 9G3M_ME , 9G3M_NE , 9G3M_OE , 9G3M_PE , 9G3M_QE , 9G3M_RE , 9G3M_SE , 9G3M_TE
Circularly permuted lumazine synthase 36-pentamer spherical cage Deposition Author(s): Azuma, Y. , Koziej, L.
Date: 2024-07-12 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 3.07 Å Organism(s): Aquifex Aeolicus Vf5 Sequences Data: 9G3N_A , 9G3N_B , 9G3N_C , 9G3N_D , 9G3N_E , 9G3N_F , 9G3N_G , 9G3N_H , 9G3N_I , 9G3N_J , 9G3N_K , 9G3N_L , 9G3N_M , 9G3N_N , 9G3N_O , 9G3N_P , 9G3N_Q , 9G3N_R , 9G3N_S , 9G3N_T , 9G3N_U , 9G3N_V , 9G3N_W , 9G3N_X , 9G3N_Y , 9G3N_Z , 9G3N_AA , 9G3N_BA , 9G3N_CA , 9G3N_DA , 9G3N_EA , 9G3N_FA , 9G3N_GA , 9G3N_HA , 9G3N_IA , 9G3N_JA , 9G3N_KA , 9G3N_LA , 9G3N_MA , 9G3N_NA , 9G3N_OA , 9G3N_PA , 9G3N_QA , 9G3N_RA , 9G3N_SA , 9G3N_TA , 9G3N_UA , 9G3N_VA , 9G3N_WA , 9G3N_XA , 9G3N_YA , 9G3N_ZA , 9G3N_AB , 9G3N_BB , 9G3N_CB , 9G3N_DB , 9G3N_EB , 9G3N_FB , 9G3N_GB , 9G3N_HB , 9G3N_IB , 9G3N_JB , 9G3N_KB , 9G3N_LB , 9G3N_MB , 9G3N_NB , 9G3N_OB , 9G3N_PB , 9G3N_QB , 9G3N_RB , 9G3N_SB , 9G3N_TB , 9G3N_UB , 9G3N_VB , 9G3N_WB , 9G3N_XB , 9G3N_YB , 9G3N_ZB , 9G3N_AC , 9G3N_BC , 9G3N_CC , 9G3N_DC , 9G3N_EC , 9G3N_FC , 9G3N_GC , 9G3N_HC , 9G3N_IC , 9G3N_JC , 9G3N_KC , 9G3N_LC , 9G3N_MC , 9G3N_NC , 9G3N_OC , 9G3N_PC , 9G3N_QC , 9G3N_RC , 9G3N_SC , 9G3N_TC , 9G3N_UC , 9G3N_VC , 9G3N_WC , 9G3N_XC , 9G3N_YC , 9G3N_ZC , 9G3N_AD , 9G3N_BD , 9G3N_CD , 9G3N_DD , 9G3N_ED , 9G3N_FD , 9G3N_GD , 9G3N_HD , 9G3N_ID , 9G3N_JD , 9G3N_KD , 9G3N_LD , 9G3N_MD , 9G3N_ND , 9G3N_OD , 9G3N_PD , 9G3N_QD , 9G3N_RD , 9G3N_SD , 9G3N_TD , 9G3N_UD , 9G3N_VD , 9G3N_WD , 9G3N_XD , 9G3N_YD , 9G3N_ZD , 9G3N_AE , 9G3N_BE , 9G3N_CE , 9G3N_DE , 9G3N_EE , 9G3N_FE , 9G3N_GE , 9G3N_HE , 9G3N_IE , 9G3N_JE , 9G3N_KE , 9G3N_LE , 9G3N_ME , 9G3N_NE , 9G3N_OE , 9G3N_PE , 9G3N_QE , 9G3N_RE , 9G3N_SE , 9G3N_TE , 9G3N_UE , 9G3N_VE , 9G3N_WE , 9G3N_XE , 9G3N_YE , 9G3N_ZE , 9G3N_AF , 9G3N_BF , 9G3N_CF , 9G3N_DF , 9G3N_EF , 9G3N_FF , 9G3N_GF , 9G3N_HF , 9G3N_IF , 9G3N_JF , 9G3N_KF , 9G3N_LF , 9G3N_MF , 9G3N_NF , 9G3N_OF , 9G3N_PF , 9G3N_QF , 9G3N_RF , 9G3N_SF , 9G3N_TF , 9G3N_UF , 9G3N_VF , 9G3N_WF , 9G3N_XF
Circularly permuted lumazine synthase 24-pentamer spherical cage Deposition Author(s): Azuma, Y. , Koziej, L.
Date: 2024-07-12 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 2.76 Å Organism(s): Aquifex Aeolicus Vf5 Sequences Data: 9G3O_A , 9G3O_B , 9G3O_C , 9G3O_D , 9G3O_E , 9G3O_F , 9G3O_G , 9G3O_H , 9G3O_I , 9G3O_J , 9G3O_K , 9G3O_L , 9G3O_M , 9G3O_N , 9G3O_O , 9G3O_P , 9G3O_Q , 9G3O_R , 9G3O_S , 9G3O_T , 9G3O_U , 9G3O_V , 9G3O_W , 9G3O_X , 9G3O_Y , 9G3O_Z , 9G3O_AA , 9G3O_BA , 9G3O_CA , 9G3O_DA , 9G3O_EA , 9G3O_FA , 9G3O_GA , 9G3O_HA , 9G3O_IA , 9G3O_JA , 9G3O_KA , 9G3O_LA , 9G3O_MA , 9G3O_NA , 9G3O_OA , 9G3O_PA , 9G3O_QA , 9G3O_RA , 9G3O_SA , 9G3O_TA , 9G3O_UA , 9G3O_VA , 9G3O_WA , 9G3O_XA , 9G3O_YA , 9G3O_ZA , 9G3O_AB , 9G3O_BB , 9G3O_CB , 9G3O_DB , 9G3O_EB , 9G3O_FB , 9G3O_GB , 9G3O_HB , 9G3O_IB , 9G3O_JB , 9G3O_KB , 9G3O_LB , 9G3O_MB , 9G3O_NB , 9G3O_OB , 9G3O_PB , 9G3O_QB , 9G3O_RB , 9G3O_SB , 9G3O_TB , 9G3O_UB , 9G3O_VB , 9G3O_WB , 9G3O_XB , 9G3O_YB , 9G3O_ZB , 9G3O_AC , 9G3O_BC , 9G3O_CC , 9G3O_DC , 9G3O_EC , 9G3O_FC , 9G3O_GC , 9G3O_HC , 9G3O_IC , 9G3O_JC , 9G3O_KC , 9G3O_LC , 9G3O_MC , 9G3O_NC , 9G3O_OC , 9G3O_PC , 9G3O_QC , 9G3O_RC , 9G3O_SC , 9G3O_TC , 9G3O_UC , 9G3O_VC , 9G3O_WC , 9G3O_XC , 9G3O_YC , 9G3O_ZC , 9G3O_AD , 9G3O_BD , 9G3O_CD , 9G3O_DD , 9G3O_ED , 9G3O_FD , 9G3O_GD , 9G3O_HD , 9G3O_ID , 9G3O_JD , 9G3O_KD , 9G3O_LD , 9G3O_MD , 9G3O_ND , 9G3O_OD , 9G3O_PD
Circularly permuted lumazine synthase 12-pentamer spherical cage Deposition Author(s): Azuma, Y. , Koziej, L.
Date: 2024-07-12 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 2.08 Å Organism(s): Aquifex Aeolicus Vf5 Sequences Data: 9G3P_A , 9G3P_B , 9G3P_C , 9G3P_D , 9G3P_E , 9G3P_F , 9G3P_G , 9G3P_H , 9G3P_I , 9G3P_J , 9G3P_K , 9G3P_L , 9G3P_M , 9G3P_N , 9G3P_O , 9G3P_P , 9G3P_Q , 9G3P_R , 9G3P_S , 9G3P_T , 9G3P_U , 9G3P_V , 9G3P_W , 9G3P_X , 9G3P_Y , 9G3P_Z , 9G3P_AA , 9G3P_BA , 9G3P_CA , 9G3P_DA , 9G3P_EA , 9G3P_FA , 9G3P_GA , 9G3P_HA , 9G3P_IA , 9G3P_JA , 9G3P_KA , 9G3P_LA , 9G3P_MA , 9G3P_NA , 9G3P_OA , 9G3P_PA , 9G3P_QA , 9G3P_RA , 9G3P_SA , 9G3P_TA , 9G3P_UA , 9G3P_VA , 9G3P_WA , 9G3P_XA , 9G3P_YA , 9G3P_ZA , 9G3P_AB , 9G3P_BB , 9G3P_CB , 9G3P_DB , 9G3P_EB , 9G3P_FB , 9G3P_GB , 9G3P_HB
Cryo-em structure of wild type aquifex aeolicus rsep in complex with fab Deposition Author(s): Aruga, R. , Asahi, K. , Hirose, M. , Kato, T. , Nogi, T.
Date: 2024-08-20 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 3.95 Å Organism(s): Aquifex Aeolicus Vf5 , Mus Musculus Sequences Data: 9J82_A , 9J82_H , 9J82_L
Cryo-em structure of aquifex aeolicus rsep e18q mutant in complex with fab Deposition Author(s): Aruga, R. , Asahi, K. , Hirose, M. , Kato, T. , Nogi, T.
Date: 2024-08-20 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 3.61 Å Organism(s): Aquifex Aeolicus Vf5 , Escherichia Coli , Mus Musculus Sequences Data: 9J83_A , 9J83_H , 9J83_L , 9J83_C