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4V6D
Crystal structure of the e. coli 70s ribosome in an intermediate state of ratcheting Deposition Author(s): Cate, J.H.D. , Dunkle, J.A. , Zhang, W.
Date: 2009-06-27 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.814 Å Organism(s): Escherichia Coli , Escherichia Coli K-12 , Synthetic Construct Sequences Data: 4V6D_AB , 4V6D_CB , 4V6D_AK , 4V6D_CK , 4V6D_AL , 4V6D_CL , 4V6D_AM , 4V6D_CM , 4V6D_AN , 4V6D_CN , 4V6D_AO , 4V6D_CO , 4V6D_AP , 4V6D_CP , 4V6D_AQ , 4V6D_CQ , 4V6D_AR , 4V6D_CR , 4V6D_AS , 4V6D_CS , 4V6D_AT , 4V6D_CT , 4V6D_AC , 4V6D_CC , 4V6D_AU , 4V6D_CU , 4V6D_AA , 4V6D_AV , 4V6D_CV , 4V6D_AW , 4V6D_CW , 4V6D_BA , 4V6D_DA , 4V6D_BB , 4V6D_BC , 4V6D_DC , 4V6D_BD , 4V6D_DD , 4V6D_BE , 4V6D_DE , 4V6D_BF , 4V6D_DF , 4V6D_AD , 4V6D_CD , 4V6D_BG , 4V6D_DG , 4V6D_BH , 4V6D_DH , 4V6D_BI , 4V6D_DI , 4V6D_BJ , 4V6D_DJ , 4V6D_BK , 4V6D_DK , 4V6D_BL , 4V6D_DL , 4V6D_BM , 4V6D_DM , 4V6D_BN , 4V6D_DN , 4V6D_BO , 4V6D_DO , 4V6D_BP , 4V6D_DP , 4V6D_AE , 4V6D_CE , 4V6D_BQ , 4V6D_DQ , 4V6D_BR , 4V6D_DR , 4V6D_BS , 4V6D_DS , 4V6D_BT , 4V6D_DT , 4V6D_BU , 4V6D_DU , 4V6D_BV , 4V6D_DV , 4V6D_BW , 4V6D_DW , 4V6D_BX , 4V6D_DX , 4V6D_BY , 4V6D_DY , 4V6D_BZ , 4V6D_DZ , 4V6D_AF , 4V6D_CF , 4V6D_B0 , 4V6D_D0 , 4V6D_B1 , 4V6D_D1 , 4V6D_B2 , 4V6D_D2 , 4V6D_B3 , 4V6D_D3 , 4V6D_B4 , 4V6D_D4 , 4V6D_CA , 4V6D_DB , 4V6D_AG , 4V6D_CG , 4V6D_AH , 4V6D_CH , 4V6D_AI , 4V6D_CI , 4V6D_AJ , 4V6D_CJ
4V6E
Crystal structure of the e. coli 70s ribosome in an intermediate state of ratcheting Deposition Author(s): Cate, J.H.D. , Dunkle, J.A. , Zhang, W.
Date: 2009-06-28 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.712 Å Organism(s): Escherichia Coli , Escherichia Coli K-12 , Synthetic Construct Sequences Data: 4V6E_AB , 4V6E_CB , 4V6E_AK , 4V6E_CK , 4V6E_AL , 4V6E_CL , 4V6E_AM , 4V6E_CM , 4V6E_AN , 4V6E_CN , 4V6E_AO , 4V6E_CO , 4V6E_AP , 4V6E_CP , 4V6E_AQ , 4V6E_CQ , 4V6E_AR , 4V6E_CR , 4V6E_AS , 4V6E_CS , 4V6E_AT , 4V6E_CT , 4V6E_AC , 4V6E_CC , 4V6E_AU , 4V6E_CU , 4V6E_AA , 4V6E_AV , 4V6E_AX , 4V6E_CV , 4V6E_CX , 4V6E_AW , 4V6E_CW , 4V6E_BA , 4V6E_DA , 4V6E_BB , 4V6E_BC , 4V6E_DC , 4V6E_BD , 4V6E_DD , 4V6E_BE , 4V6E_DE , 4V6E_BF , 4V6E_DF , 4V6E_AD , 4V6E_CD , 4V6E_BG , 4V6E_DG , 4V6E_BH , 4V6E_DH , 4V6E_BI , 4V6E_DI , 4V6E_BJ , 4V6E_DJ , 4V6E_BK , 4V6E_DK , 4V6E_BL , 4V6E_DL , 4V6E_BM , 4V6E_DM , 4V6E_BN , 4V6E_DN , 4V6E_BO , 4V6E_DO , 4V6E_BP , 4V6E_DP , 4V6E_AE , 4V6E_CE , 4V6E_BQ , 4V6E_DQ , 4V6E_BR , 4V6E_DR , 4V6E_BS , 4V6E_DS , 4V6E_BT , 4V6E_DT , 4V6E_BU , 4V6E_DU , 4V6E_BV , 4V6E_DV , 4V6E_BW , 4V6E_DW , 4V6E_BX , 4V6E_DX , 4V6E_BY , 4V6E_DY , 4V6E_BZ , 4V6E_DZ , 4V6E_AF , 4V6E_CF , 4V6E_B0 , 4V6E_D0 , 4V6E_B1 , 4V6E_D1 , 4V6E_B2 , 4V6E_D2 , 4V6E_B3 , 4V6E_D3 , 4V6E_B4 , 4V6E_D4 , 4V6E_CA , 4V6E_DB , 4V6E_AG , 4V6E_CG , 4V6E_AH , 4V6E_CH , 4V6E_AI , 4V6E_CI , 4V6E_AJ , 4V6E_CJ
4V6K
Structural insights into cognate vs. near-cognate discrimination during decoding. Deposition Author(s): Agirrezabala, X. , Frank, J. , Green, R. , Lei, J. , Ortiz-Meoz, R.F. , Schreiner, E. , Schulten, K. , Trabuco, L.G.
Date: 2011-01-07 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 8.25 Å Organism(s): Escherichia Coli , Escherichia Coli Dh1 , Escherichia Coli K-12 , Escherichia Coli O157:H7 Sequences Data: 4V6K_AA , 4V6K_AJ , 4V6K_AK , 4V6K_AL , 4V6K_AM , 4V6K_AN , 4V6K_AO , 4V6K_AP , 4V6K_AQ , 4V6K_AR , 4V6K_AS , 4V6K_AB , 4V6K_AT , 4V6K_AU , 4V6K_AV , 4V6K_AW , 4V6K_AX , 4V6K_AY , 4V6K_AZ , 4V6K_AC , 4V6K_AD , 4V6K_AE , 4V6K_AF , 4V6K_AG , 4V6K_BA , 4V6K_BB , 4V6K_BE , 4V6K_BC , 4V6K_BD , 4V6K_BF , 4V6K_BG , 4V6K_BH , 4V6K_BI , 4V6K_BJ , 4V6K_BK , 4V6K_BL , 4V6K_BM , 4V6K_BN , 4V6K_BO , 4V6K_BP , 4V6K_BQ , 4V6K_BR , 4V6K_BS , 4V6K_BT , 4V6K_BU , 4V6K_BV , 4V6K_BW , 4V6K_BX , 4V6K_BY , 4V6K_AH , 4V6K_AI
4V6L
Structural insights into cognate vs. near-cognate discrimination during decoding. Deposition Author(s): Agirrezabala, X. , Frank, J. , Green, R. , Lei, J. , Ortiz-Meoz, R.F. , Schreiner, E. , Schulten, K. , Trabuco, L.G.
Date: 2011-01-07 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 13.2 Å Organism(s): Escherichia Coli , Escherichia Coli Dh1 , Escherichia Coli K-12 , Escherichia Coli O157:H7 Sequences Data: 4V6L_AA , 4V6L_AK , 4V6L_AL , 4V6L_AM , 4V6L_AN , 4V6L_AO , 4V6L_AP , 4V6L_AQ , 4V6L_AR , 4V6L_AS , 4V6L_AT , 4V6L_AB , 4V6L_AE , 4V6L_AU , 4V6L_AV , 4V6L_AW , 4V6L_AX , 4V6L_AY , 4V6L_BA , 4V6L_BB , 4V6L_BC , 4V6L_BD , 4V6L_BE , 4V6L_AC , 4V6L_BF , 4V6L_BG , 4V6L_BH , 4V6L_BI , 4V6L_BJ , 4V6L_BK , 4V6L_BL , 4V6L_BM , 4V6L_BN , 4V6L_BO , 4V6L_AD , 4V6L_BP , 4V6L_BQ , 4V6L_BR , 4V6L_BS , 4V6L_BT , 4V6L_BU , 4V6L_BV , 4V6L_BW , 4V6L_BX , 4V6L_BY , 4V6L_AF , 4V6L_BZ , 4V6L_AG , 4V6L_AH , 4V6L_AI , 4V6L_AJ
4V6M
Structure of the ribosome-secye complex in the membrane environment Deposition Author(s): Beatrix, B. , Becker, T. , Beckmann, R. , Berninghausen, O. , Frauenfeld, J. , Funes, S. , Gartmann, M. , Gumbart, J. , Mielke, T. , Schulten, K. , Van Der Sluis, E.O.
Date: 2011-02-08 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 7.1 Å Organism(s): Escherichia Coli , Escherichia Coli 536 , Escherichia Coli Dh1 , Escherichia Coli K-12 , Escherichia Coli O157:H7 , Synthetic Construct Sequences Data: 4V6M_AA , 4V6M_AF , 4V6M_AG , 4V6M_AH , 4V6M_AI , 4V6M_AJ , 4V6M_AK , 4V6M_AL , 4V6M_AM , 4V6M_AN , 4V6M_AO , 4V6M_AX , 4V6M_AP , 4V6M_AQ , 4V6M_AR , 4V6M_AS , 4V6M_AT , 4V6M_AU , 4V6M_B7 , 4V6M_B8 , 4V6M_BA , 4V6M_BB , 4V6M_AV , 4V6M_B5 , 4V6M_B6 , 4V6M_BD , 4V6M_BE , 4V6M_BF , 4V6M_BG , 4V6M_BH , 4V6M_BI , 4V6M_BJ , 4V6M_BK , 4V6M_AZ , 4V6M_BL , 4V6M_BM , 4V6M_BN , 4V6M_BO , 4V6M_BP , 4V6M_BQ , 4V6M_BR , 4V6M_BS , 4V6M_BT , 4V6M_BU , 4V6M_A0 , 4V6M_A1 , 4V6M_BV , 4V6M_BW , 4V6M_BX , 4V6M_BY , 4V6M_BZ , 4V6M_B0 , 4V6M_B1 , 4V6M_B2 , 4V6M_B3 , 4V6M_B4 , 4V6M_AB , 4V6M_AC , 4V6M_AD , 4V6M_AE
4V7I
Ribosome-secy complex. Deposition Author(s): Gumbart, J.C. , Schreiner, E. , Schulten, K. , Trabuco, L.G. , Villa, E.
Date: 2009-10-21 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 9.6 Å Organism(s): Escherichia Coli , Escherichia Coli K-12 , Methanocaldococcus Jannaschii Sequences Data: 4V7I_A7 , 4V7I_AF , 4V7I_AG , 4V7I_AH , 4V7I_AI , 4V7I_AJ , 4V7I_AK , 4V7I_AL , 4V7I_AM , 4V7I_AN , 4V7I_AO , 4V7I_A8 , 4V7I_AP , 4V7I_AQ , 4V7I_AR , 4V7I_AS , 4V7I_AT , 4V7I_AU , 4V7I_AV , 4V7I_AW , 4V7I_AX , 4V7I_AY , 4V7I_AA , 4V7I_AZ , 4V7I_A0 , 4V7I_A1 , 4V7I_A2 , 4V7I_A3 , 4V7I_A4 , 4V7I_BA , 4V7I_BB , 4V7I_BC , 4V7I_BD , 4V7I_AB , 4V7I_BE , 4V7I_BF , 4V7I_BG , 4V7I_BH , 4V7I_BI , 4V7I_BJ , 4V7I_BK , 4V7I_BL , 4V7I_BM , 4V7I_BN , 4V7I_AC , 4V7I_BO , 4V7I_BP , 4V7I_BQ , 4V7I_BR , 4V7I_BS , 4V7I_BT , 4V7I_BU , 4V7I_A5 , 4V7I_A6 , 4V7I_AD , 4V7I_AE
4V7J
Structure of rele nuclease bound to the 70s ribosome (precleavage state) Deposition Author(s): Andersen, K.R. , Brodersen, D.E. , Dunham, C.M. , Gao, Y.-G. , Gerdes, K. , Hentschel, J. , Kelley, A.C. , Neubauer, C. , Ramakrishnan, V.
Date: 2009-11-02 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.3 Å Organism(s): Escherichia Coli K-12 , Thermus Thermophilus , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 4V7J_AB , 4V7J_BB , 4V7J_AK , 4V7J_BK , 4V7J_AL , 4V7J_BL , 4V7J_AM , 4V7J_BM , 4V7J_AN , 4V7J_BN , 4V7J_AO , 4V7J_BO , 4V7J_AP , 4V7J_BP , 4V7J_AQ , 4V7J_BQ , 4V7J_AR , 4V7J_BR , 4V7J_AS , 4V7J_BS , 4V7J_AT , 4V7J_BT , 4V7J_AC , 4V7J_BC , 4V7J_AU , 4V7J_BU , 4V7J_AY , 4V7J_BY , 4V7J_AA , 4V7J_BA , 4V7J_AX , 4V7J_BX , 4V7J_AV , 4V7J_BV , 4V7J_AW , 4V7J_BW , 4V7J_AD , 4V7J_BD , 4V7J_AE , 4V7J_BE , 4V7J_AF , 4V7J_BF , 4V7J_AG , 4V7J_BG , 4V7J_AH , 4V7J_BH , 4V7J_AI , 4V7J_BI , 4V7J_AJ , 4V7J_BJ , 4V7J_AZ , 4V7J_BZ , 4V7J_A0 , 4V7J_B0 , 4V7J_A1 , 4V7J_B1 , 4V7J_A2 , 4V7J_B2 , 4V7J_A3 , 4V7J_B3 , 4V7J_A4 , 4V7J_B4 , 4V7J_A5 , 4V7J_B5 , 4V7J_A6 , 4V7J_B6 , 4V7J_A7 , 4V7J_B7 , 4V7J_A8 , 4V7J_B8 , 4V7J_A9 , 4V7J_B9
4V7K
Structure of rele nuclease bound to the 70s ribosome (postcleavage state) Deposition Author(s): Andersen, K.R. , Brodersen, D.E. , Dunham, C.M. , Gao, Y.-G. , Gerdes, K. , Hentschel, J. , Kelley, A.C. , Neubauer, C. , Ramakrishnan, V.
Date: 2009-11-02 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.6 Å Organism(s): Escherichia Coli K-12 , Thermus Thermophilus , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 4V7K_AB , 4V7K_BB , 4V7K_AK , 4V7K_BK , 4V7K_AL , 4V7K_BL , 4V7K_AM , 4V7K_BM , 4V7K_AN , 4V7K_BN , 4V7K_AO , 4V7K_BO , 4V7K_AP , 4V7K_BP , 4V7K_AQ , 4V7K_BQ , 4V7K_AR , 4V7K_BR , 4V7K_AS , 4V7K_BS , 4V7K_AT , 4V7K_BT , 4V7K_AC , 4V7K_BC , 4V7K_AU , 4V7K_BU , 4V7K_AY , 4V7K_BY , 4V7K_AA , 4V7K_BA , 4V7K_AX , 4V7K_BX , 4V7K_AV , 4V7K_BV , 4V7K_AW , 4V7K_BW , 4V7K_AD , 4V7K_BD , 4V7K_AE , 4V7K_BE , 4V7K_AF , 4V7K_BF , 4V7K_AG , 4V7K_BG , 4V7K_AH , 4V7K_BH , 4V7K_AI , 4V7K_BI , 4V7K_AJ , 4V7K_BJ , 4V7K_AZ , 4V7K_BZ , 4V7K_A0 , 4V7K_B0 , 4V7K_A1 , 4V7K_B1 , 4V7K_A2 , 4V7K_B2 , 4V7K_A3 , 4V7K_B3 , 4V7K_A4 , 4V7K_B4 , 4V7K_A5 , 4V7K_B5 , 4V7K_A6 , 4V7K_B6 , 4V7K_A7 , 4V7K_B7 , 4V7K_A8 , 4V7K_B8 , 4V7K_A9 , 4V7K_B9
4V8I
Crystal structure of yfia bound to the 70s ribosome. Deposition Author(s): Blaha, G.M. , Polikanov, Y.S. , Steitz, T.A.
Date: 2011-12-12 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 2.7 Å Organism(s): Escherichia Coli K-12 , Thermus Thermophilus Sequences Data: 4V8I_AA , 4V8I_CA , 4V8I_AJ , 4V8I_CJ , 4V8I_AK , 4V8I_CK , 4V8I_AL , 4V8I_CL , 4V8I_AM , 4V8I_CM , 4V8I_AN , 4V8I_CN , 4V8I_AO , 4V8I_CO , 4V8I_AP , 4V8I_CP , 4V8I_AQ , 4V8I_CQ , 4V8I_AR , 4V8I_CR , 4V8I_AS , 4V8I_CS , 4V8I_AB , 4V8I_CB , 4V8I_AT , 4V8I_CT , 4V8I_AU , 4V8I_CU , 4V8I_AY , 4V8I_CY , 4V8I_BA , 4V8I_DA , 4V8I_BB , 4V8I_DB , 4V8I_BD , 4V8I_DD , 4V8I_BE , 4V8I_DE , 4V8I_BF , 4V8I_DF , 4V8I_BG , 4V8I_DG , 4V8I_BH , 4V8I_DH , 4V8I_AC , 4V8I_CC , 4V8I_BI , 4V8I_DI , 4V8I_BN , 4V8I_DN , 4V8I_BO , 4V8I_DO , 4V8I_BP , 4V8I_DP , 4V8I_BQ , 4V8I_DQ , 4V8I_BR , 4V8I_DR , 4V8I_BS , 4V8I_DS , 4V8I_BT , 4V8I_DT , 4V8I_BU , 4V8I_DU , 4V8I_BV , 4V8I_DV , 4V8I_AD , 4V8I_CD , 4V8I_BW , 4V8I_DW , 4V8I_BX , 4V8I_DX , 4V8I_BY , 4V8I_DY , 4V8I_BZ , 4V8I_DZ , 4V8I_B0 , 4V8I_D0 , 4V8I_B1 , 4V8I_D1 , 4V8I_B2 , 4V8I_D2 , 4V8I_B3 , 4V8I_D3 , 4V8I_B4 , 4V8I_D4 , 4V8I_B5 , 4V8I_D5 , 4V8I_AE , 4V8I_CE , 4V8I_B6 , 4V8I_D6 , 4V8I_B7 , 4V8I_D7 , 4V8I_B8 , 4V8I_D8 , 4V8I_B9 , 4V8I_D9 , 4V8I_AF , 4V8I_CF , 4V8I_AG , 4V8I_CG , 4V8I_AH , 4V8I_CH , 4V8I_AI , 4V8I_CI
4V8Q
Complex of smpb, a tmrna fragment and ef-tu-gdp-kirromycin with the 70s ribosome Deposition Author(s): Gillet, R. , Kelley, A.C. , Neubauer, C. , Ramakrishnan, V.
Date: 2011-12-10 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.1 Å Organism(s): Escherichia Coli K-12 , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 4V8Q_A0 , 4V8Q_A9 , 4V8Q_AA , 4V8Q_AB , 4V8Q_AC , 4V8Q_AD , 4V8Q_AE , 4V8Q_AF , 4V8Q_AG , 4V8Q_AH , 4V8Q_AJ , 4V8Q_A1 , 4V8Q_AK , 4V8Q_AN , 4V8Q_AO , 4V8Q_AP , 4V8Q_AQ , 4V8Q_AR , 4V8Q_AS , 4V8Q_AT , 4V8Q_AU , 4V8Q_AV , 4V8Q_A2 , 4V8Q_AW , 4V8Q_AX , 4V8Q_AY , 4V8Q_AZ , 4V8Q_B2 , 4V8Q_BA , 4V8Q_BB , 4V8Q_BC , 4V8Q_BD , 4V8Q_BE , 4V8Q_A3 , 4V8Q_BF , 4V8Q_BG , 4V8Q_BH , 4V8Q_BI , 4V8Q_BJ , 4V8Q_BK , 4V8Q_BL , 4V8Q_BM , 4V8Q_BN , 4V8Q_BO , 4V8Q_A4 , 4V8Q_BP , 4V8Q_BQ , 4V8Q_BR , 4V8Q_BS , 4V8Q_BT , 4V8Q_BU , 4V8Q_BV , 4V8Q_BW , 4V8Q_BX , 4V8Q_BY , 4V8Q_BZ , 4V8Q_A5 , 4V8Q_A6 , 4V8Q_A7 , 4V8Q_A8