Crystal structure of the dolphin proline-rich antimicrobial peptide tur1a bound to the thermus thermophilus 70s ribosome Deposition Author(s): Benincasa, M. , Gambato, S. , Hilpert, K. , Hofmann, S. , Huter, P. , Innis, C.A. , Mardirossian, M. , Muller, C. , Perebaskine, N. , Tossi, A. , Wilson, D.N.
Date: 2018-01-24 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.2 Å Organism(s): Helicobacter Pylori Bacteriophage Khp30 , Haementeria Ghilianii , Fragaria Ananassa , Rhodobacter Sphaeroides (Strain Atcc 17023 / Dsm 158 / Jcm 6121 / Nbrc 12203 / Ncimb 8253 / Ath 2.4.1.) Sequences Data: 6FKR_1A , 6FKR_2A , 6FKR_1O , 6FKR_2O , 6FKR_1P , 6FKR_2P , 6FKR_1Q , 6FKR_2Q , 6FKR_1R , 6FKR_2R , 6FKR_1S , 6FKR_2S , 6FKR_1T , 6FKR_2T , 6FKR_1U , 6FKR_2U , 6FKR_1V , 6FKR_2V , 6FKR_1W , 6FKR_2W , 6FKR_1X , 6FKR_2X , 6FKR_1B , 6FKR_2B , 6FKR_1Y , 6FKR_2Y , 6FKR_1Z , 6FKR_2Z , 6FKR_10 , 6FKR_20 , 6FKR_11 , 6FKR_21 , 6FKR_12 , 6FKR_22 , 6FKR_13 , 6FKR_23 , 6FKR_14 , 6FKR_24 , 6FKR_15 , 6FKR_25 , 6FKR_16 , 6FKR_26 , 6FKR_17 , 6FKR_27 , 6FKR_1D , 6FKR_2D , 6FKR_18 , 6FKR_28 , 6FKR_19 , 6FKR_29 , 6FKR_1C , 6FKR_2C , 6FKR_1E , 6FKR_2E , 6FKR_1F , 6FKR_2F , 6FKR_1G , 6FKR_2G , 6FKR_1H , 6FKR_2H , 6FKR_1I , 6FKR_2I , 6FKR_1J , 6FKR_2J , 6FKR_1K , 6FKR_2K , 6FKR_1L , 6FKR_2L , 6FKR_1M , 6FKR_2M , 6FKR_1N , 6FKR_2N
Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna, trnafmet and cognate trnathr in the a-site Deposition Author(s): Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2018-06-14 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 2.96 Å Organism(s): Sphingobium Sp. (Strain Nbrc 103272 / Syk-6) , Haementeria Ghilianii , Fragaria Ananassa , Rhodobacter Sphaeroides (Strain Atcc 17023 / Dsm 158 / Jcm 6121 / Nbrc 12203 / Ncimb 8253 / Ath 2.4.1.) Sequences Data: 6GSJ_13 , 6GSJ_1G , 6GSJ_1I , 6GSJ_1A , 6GSJ_2I , 6GSJ_2A , 6GSJ_3I , 6GSJ_3A , 6GSJ_4I , 6GSJ_4A , 6GSJ_5I , 6GSJ_5A , 6GSJ_6I , 6GSJ_6A , 6GSJ_7I , 6GSJ_7A , 6GSJ_8I , 6GSJ_8A , 6GSJ_9I , 6GSJ_9A , 6GSJ_AI , 6GSJ_AA , 6GSJ_1E , 6GSJ_12 , 6GSJ_BI , 6GSJ_BA , 6GSJ_1F , 6GSJ_1B , 6GSJ_1K , 6GSJ_1L , 6GSJ_2K , 6GSJ_2L , 6GSJ_3K , 6GSJ_4K , 6GSJ_4L , 6GSJ_1H , 6GSJ_14 , 6GSJ_16 , 6GSJ_1J , 6GSJ_11 , 6GSJ_19 , 6GSJ_21 , 6GSJ_29 , 6GSJ_2E , 6GSJ_22 , 6GSJ_31 , 6GSJ_39 , 6GSJ_41 , 6GSJ_49 , 6GSJ_51 , 6GSJ_59 , 6GSJ_61 , 6GSJ_69 , 6GSJ_58 , 6GSJ_15 , 6GSJ_68 , 6GSJ_25 , 6GSJ_78 , 6GSJ_35 , 6GSJ_88 , 6GSJ_45 , 6GSJ_98 , 6GSJ_55 , 6GSJ_A8 , 6GSJ_65 , 6GSJ_3E , 6GSJ_32 , 6GSJ_B8 , 6GSJ_75 , 6GSJ_C8 , 6GSJ_85 , 6GSJ_D8 , 6GSJ_95 , 6GSJ_E8 , 6GSJ_A5 , 6GSJ_F8 , 6GSJ_B5 , 6GSJ_G8 , 6GSJ_C5 , 6GSJ_H8 , 6GSJ_D5 , 6GSJ_I8 , 6GSJ_E5 , 6GSJ_J8 , 6GSJ_F5 , 6GSJ_K8 , 6GSJ_G5 , 6GSJ_4E , 6GSJ_42 , 6GSJ_L8 , 6GSJ_H5 , 6GSJ_M8 , 6GSJ_N8 , 6GSJ_J5 , 6GSJ_P8 , 6GSJ_L5 , 6GSJ_Q8 , 6GSJ_M5 , 6GSJ_3L , 6GSJ_5E , 6GSJ_52 , 6GSJ_6E , 6GSJ_62 , 6GSJ_7E , 6GSJ_72 , 6GSJ_8E , 6GSJ_82
Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna, trnafmet and near-cognate trnathr in the a-site Deposition Author(s): Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2018-06-14 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.36 Å Organism(s): Adineta Vaga , Sphingobium Sp. (Strain Nbrc 103272 / Syk-6) , Haementeria Ghilianii , Fragaria Ananassa , Rhodobacter Sphaeroides (Strain Atcc 17023 / Dsm 158 / Jcm 6121 / Nbrc 12203 / Ncimb 8253 / Ath 2.4.1.) Sequences Data: 6GSK_13 , 6GSK_1G , 6GSK_1I , 6GSK_1A , 6GSK_2I , 6GSK_2A , 6GSK_3I , 6GSK_3A , 6GSK_4I , 6GSK_4A , 6GSK_5I , 6GSK_5A , 6GSK_6I , 6GSK_6A , 6GSK_7I , 6GSK_7A , 6GSK_8I , 6GSK_8A , 6GSK_9I , 6GSK_9A , 6GSK_AI , 6GSK_AA , 6GSK_1E , 6GSK_12 , 6GSK_BI , 6GSK_BA , 6GSK_1F , 6GSK_1B , 6GSK_1K , 6GSK_1L , 6GSK_2K , 6GSK_2L , 6GSK_3K , 6GSK_3L , 6GSK_4K , 6GSK_4L , 6GSK_1H , 6GSK_14 , 6GSK_16 , 6GSK_1J , 6GSK_11 , 6GSK_19 , 6GSK_21 , 6GSK_29 , 6GSK_2E , 6GSK_22 , 6GSK_31 , 6GSK_39 , 6GSK_41 , 6GSK_49 , 6GSK_51 , 6GSK_59 , 6GSK_61 , 6GSK_69 , 6GSK_58 , 6GSK_15 , 6GSK_68 , 6GSK_25 , 6GSK_78 , 6GSK_35 , 6GSK_88 , 6GSK_45 , 6GSK_98 , 6GSK_55 , 6GSK_A8 , 6GSK_65 , 6GSK_3E , 6GSK_32 , 6GSK_B8 , 6GSK_75 , 6GSK_C8 , 6GSK_85 , 6GSK_D8 , 6GSK_95 , 6GSK_E8 , 6GSK_A5 , 6GSK_F8 , 6GSK_B5 , 6GSK_G8 , 6GSK_C5 , 6GSK_H8 , 6GSK_D5 , 6GSK_I8 , 6GSK_E5 , 6GSK_J8 , 6GSK_F5 , 6GSK_K8 , 6GSK_G5 , 6GSK_4E , 6GSK_42 , 6GSK_L8 , 6GSK_H5 , 6GSK_M8 , 6GSK_N8 , 6GSK_J5 , 6GSK_P8 , 6GSK_L5 , 6GSK_Q8 , 6GSK_M5 , 6GSK_5E , 6GSK_52 , 6GSK_6E , 6GSK_62 , 6GSK_7E , 6GSK_72 , 6GSK_8E , 6GSK_82
Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna, trnafmet and cognate trnaarg in the a-site Deposition Author(s): Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2018-06-14 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.16 Å Organism(s): Sphingobium Sp. (Strain Nbrc 103272 / Syk-6) , Haementeria Ghilianii , Fragaria Ananassa , Rhodobacter Sphaeroides (Strain Atcc 17023 / Dsm 158 / Jcm 6121 / Nbrc 12203 / Ncimb 8253 / Ath 2.4.1.) Sequences Data: 6GSL_13 , 6GSL_1G , 6GSL_1I , 6GSL_1A , 6GSL_2I , 6GSL_2A , 6GSL_3I , 6GSL_3A , 6GSL_4I , 6GSL_4A , 6GSL_5I , 6GSL_5A , 6GSL_6I , 6GSL_6A , 6GSL_7I , 6GSL_7A , 6GSL_8I , 6GSL_8A , 6GSL_9I , 6GSL_9A , 6GSL_AI , 6GSL_AA , 6GSL_1E , 6GSL_12 , 6GSL_BI , 6GSL_BA , 6GSL_1F , 6GSL_1B , 6GSL_1K , 6GSL_1L , 6GSL_2K , 6GSL_2L , 6GSL_3K , 6GSL_3L , 6GSL_4K , 6GSL_4L , 6GSL_1H , 6GSL_14 , 6GSL_16 , 6GSL_1J , 6GSL_71 , 6GSL_79 , 6GSL_11 , 6GSL_19 , 6GSL_2E , 6GSL_22 , 6GSL_21 , 6GSL_29 , 6GSL_31 , 6GSL_39 , 6GSL_41 , 6GSL_49 , 6GSL_51 , 6GSL_59 , 6GSL_18 , 6GSL_28 , 6GSL_61 , 6GSL_69 , 6GSL_38 , 6GSL_48 , 6GSL_58 , 6GSL_15 , 6GSL_68 , 6GSL_25 , 6GSL_3E , 6GSL_32 , 6GSL_78 , 6GSL_35 , 6GSL_88 , 6GSL_45 , 6GSL_98 , 6GSL_55 , 6GSL_A8 , 6GSL_65 , 6GSL_B8 , 6GSL_75 , 6GSL_C8 , 6GSL_85 , 6GSL_D8 , 6GSL_95 , 6GSL_E8 , 6GSL_A5 , 6GSL_F8 , 6GSL_B5 , 6GSL_G8 , 6GSL_C5 , 6GSL_4E , 6GSL_42 , 6GSL_H8 , 6GSL_D5 , 6GSL_I8 , 6GSL_E5 , 6GSL_J8 , 6GSL_F5 , 6GSL_K8 , 6GSL_G5 , 6GSL_L8 , 6GSL_H5 , 6GSL_M8 , 6GSL_N8 , 6GSL_J5 , 6GSL_O8 , 6GSL_P8 , 6GSL_L5 , 6GSL_Q8 , 6GSL_M5 , 6GSL_5E , 6GSL_52 , 6GSL_6E , 6GSL_62 , 6GSL_7E , 6GSL_72 , 6GSL_8E , 6GSL_82
T. thermophilus hibernating 70s ribosome Deposition Author(s): Flygaard, R.K. , Jenner, L.B.
Date: 2018-07-04 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 3.28 Å Organism(s): Haementeria Ghilianii , Fragaria Ananassa Sequences Data: 6GZQ_C1 , 6GZQ_L1 , 6GZQ_M1 , 6GZQ_N1 , 6GZQ_O1 , 6GZQ_P1 , 6GZQ_Q1 , 6GZQ_R1 , 6GZQ_S1 , 6GZQ_T1 , 6GZQ_U1 , 6GZQ_D1 , 6GZQ_V1 , 6GZQ_W1 , 6GZQ_X1 , 6GZQ_Y1 , 6GZQ_Z1 , 6GZQ_A1 , 6GZQ_B1 , 6GZQ_E1 , 6GZQ_B2 , 6GZQ_C2 , 6GZQ_D2 , 6GZQ_E2 , 6GZQ_F2 , 6GZQ_G2 , 6GZQ_H2 , 6GZQ_I2 , 6GZQ_F1 , 6GZQ_J2 , 6GZQ_K2 , 6GZQ_L2 , 6GZQ_M2 , 6GZQ_N2 , 6GZQ_O2 , 6GZQ_P2 , 6GZQ_Q2 , 6GZQ_R2 , 6GZQ_S2 , 6GZQ_G1 , 6GZQ_T2 , 6GZQ_U2 , 6GZQ_V2 , 6GZQ_A2 , 6GZQ_H1 , 6GZQ_I1 , 6GZQ_J1 , 6GZQ_K1
T. thermophilus hibernating 100s ribosome (ice) Deposition Author(s): Flygaard, R.K. , Jenner, L.B.
Date: 2018-07-05 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 4.57 Å Organism(s): Haementeria Ghilianii Sequences Data: 6GZX_C1 , 6GZX_C2 , 6GZX_L1 , 6GZX_L2 , 6GZX_M1 , 6GZX_M2 , 6GZX_N1 , 6GZX_N2 , 6GZX_O1 , 6GZX_O2 , 6GZX_P1 , 6GZX_P2 , 6GZX_Q1 , 6GZX_Q2 , 6GZX_R1 , 6GZX_R2 , 6GZX_S1 , 6GZX_S2 , 6GZX_T1 , 6GZX_T2 , 6GZX_U1 , 6GZX_U2 , 6GZX_D1 , 6GZX_D2 , 6GZX_V1 , 6GZX_V2 , 6GZX_W1 , 6GZX_W2 , 6GZX_X1 , 6GZX_X2 , 6GZX_Y1 , 6GZX_Y2 , 6GZX_Z1 , 6GZX_Z2 , 6GZX_A1 , 6GZX_A2 , 6GZX_B1 , 6GZX_B2 , 6GZX_E1 , 6GZX_E2 , 6GZX_B3 , 6GZX_B4 , 6GZX_C3 , 6GZX_C4 , 6GZX_D3 , 6GZX_D4 , 6GZX_E3 , 6GZX_E4 , 6GZX_F3 , 6GZX_F4 , 6GZX_G3 , 6GZX_G4 , 6GZX_H3 , 6GZX_H4 , 6GZX_I3 , 6GZX_I4 , 6GZX_F1 , 6GZX_F2 , 6GZX_J3 , 6GZX_J4 , 6GZX_K3 , 6GZX_K4 , 6GZX_L3 , 6GZX_L4 , 6GZX_M3 , 6GZX_M4 , 6GZX_N3 , 6GZX_N4 , 6GZX_O3 , 6GZX_O4 , 6GZX_P3 , 6GZX_P4 , 6GZX_Q3 , 6GZX_Q4 , 6GZX_R3 , 6GZX_R4 , 6GZX_S3 , 6GZX_S4 , 6GZX_G1 , 6GZX_G2 , 6GZX_T3 , 6GZX_T4 , 6GZX_U3 , 6GZX_U4 , 6GZX_X3 , 6GZX_W4 , 6GZX_A3 , 6GZX_A4 , 6GZX_V3 , 6GZX_V4 , 6GZX_H1 , 6GZX_H2 , 6GZX_I1 , 6GZX_I2 , 6GZX_J1 , 6GZX_J2 , 6GZX_K1 , 6GZX_K2
T. thermophilus hibernating 100s ribosome (amc) Deposition Author(s): Flygaard, R.K. , Jenner, L.B.
Date: 2018-07-05 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 4.13 Å Organism(s): Haementeria Ghilianii , Fragaria Ananassa Sequences Data: 6GZZ_C1 , 6GZZ_C2 , 6GZZ_L1 , 6GZZ_L2 , 6GZZ_M1 , 6GZZ_M2 , 6GZZ_N1 , 6GZZ_N2 , 6GZZ_O1 , 6GZZ_O2 , 6GZZ_P1 , 6GZZ_P2 , 6GZZ_Q1 , 6GZZ_Q2 , 6GZZ_R1 , 6GZZ_R2 , 6GZZ_S1 , 6GZZ_S2 , 6GZZ_T1 , 6GZZ_T2 , 6GZZ_U1 , 6GZZ_U2 , 6GZZ_D1 , 6GZZ_D2 , 6GZZ_V1 , 6GZZ_V2 , 6GZZ_W1 , 6GZZ_W2 , 6GZZ_X1 , 6GZZ_X2 , 6GZZ_Y1 , 6GZZ_Y2 , 6GZZ_Z1 , 6GZZ_Z2 , 6GZZ_A1 , 6GZZ_A2 , 6GZZ_B1 , 6GZZ_B2 , 6GZZ_E1 , 6GZZ_E2 , 6GZZ_B3 , 6GZZ_B4 , 6GZZ_C3 , 6GZZ_C4 , 6GZZ_D3 , 6GZZ_D4 , 6GZZ_E3 , 6GZZ_E4 , 6GZZ_F3 , 6GZZ_F4 , 6GZZ_G3 , 6GZZ_G4 , 6GZZ_H3 , 6GZZ_H4 , 6GZZ_I3 , 6GZZ_I4 , 6GZZ_F1 , 6GZZ_F2 , 6GZZ_J3 , 6GZZ_J4 , 6GZZ_K3 , 6GZZ_K4 , 6GZZ_L3 , 6GZZ_L4 , 6GZZ_M3 , 6GZZ_M4 , 6GZZ_N3 , 6GZZ_N4 , 6GZZ_O3 , 6GZZ_O4 , 6GZZ_P3 , 6GZZ_P4 , 6GZZ_Q3 , 6GZZ_Q4 , 6GZZ_R3 , 6GZZ_R4 , 6GZZ_S3 , 6GZZ_S4 , 6GZZ_G1 , 6GZZ_G2 , 6GZZ_T3 , 6GZZ_T4 , 6GZZ_U3 , 6GZZ_U4 , 6GZZ_X3 , 6GZZ_W4 , 6GZZ_A3 , 6GZZ_A4 , 6GZZ_V3 , 6GZZ_V4 , 6GZZ_H1 , 6GZZ_H2 , 6GZZ_I1 , 6GZZ_I2 , 6GZZ_J1 , 6GZZ_J2 , 6GZZ_K1 , 6GZZ_K2
Circular permutant of ribosomal protein s6, adding 5aa to c terminal of p97-3, l10a mutant Deposition Author(s): Logan, D.T. , Oliveberg, M. , Wang, H.
Date: 2018-11-15 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 1.2 Å Organism(s): Haementeria Ghilianii Sequences Data: 6I69_A
Circular permutant of ribosomal protein s6, swap strand 1 , l10a mutant Deposition Author(s): Logan, D.T. , Oliveberg, M. , Wang, H.
Date: 2018-11-15 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 1.2 Å Organism(s): Haementeria Ghilianii Sequences Data: 6I6E_A
Circular permutant of ribosomal protein s6, adding 9aa to c terminal of p68-69, l75a mutant Deposition Author(s): Logan, D.T. , Oliveberg, M. , Wang, H.
Date: 2018-11-15 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 1.46 Å Organism(s): Haementeria Ghilianii , Fragaria Ananassa Sequences Data: 6I6S_A , 6I6S_B