Complex of thermous thermophilus ribosome (a-and p-site trna) bound to bipa-gdpcp Deposition Author(s): Ahmed, T. , Bhushan, S. , Chen, Y. , Ero, R. , Gao, Y.-G. , Kumar, V. , Tan, J.
Date: 2015-07-23 Method: ELECTRON MICROSCOPY Resolution: 5.0 Å Organism(s): Thermus Thermophilus Hb8 Sequences Data: 5AA0_AA , 5AA0_AL , 5AA0_AM , 5AA0_AN , 5AA0_AO , 5AA0_AP , 5AA0_AQ , 5AA0_AR , 5AA0_AS , 5AA0_AT , 5AA0_AU , 5AA0_AB , 5AA0_AV , 5AA0_AW , 5AA0_AX , 5AA0_AY , 5AA0_AZ , 5AA0_AC , 5AA0_AD , 5AA0_AE , 5AA0_AF , 5AA0_AI , 5AA0_AJ , 5AA0_AG , 5AA0_BA , 5AA0_BF , 5AA0_BG , 5AA0_BH , 5AA0_BI , 5AA0_BJ , 5AA0_BK , 5AA0_BL , 5AA0_BM , 5AA0_BN , 5AA0_BO , 5AA0_BP , 5AA0_BQ , 5AA0_BR , 5AA0_BS , 5AA0_BT , 5AA0_BU , 5AA0_BV , 5AA0_BW , 5AA0_BX , 5AA0_BY , 5AA0_BC , 5AA0_BD , 5AA0_BE , 5AA0_BZ , 5AA0_AH , 5AA0_AK
Crystal structures of 5-aminoimidazole ribonucleotide (air) synthetase, purm, from thermus thermophilus Deposition Author(s): Baba, S. , Ebihara, A. , Kanagawa, M. , Kawai, G. , Nakagawa, N. , Riken Structural Genomics/Proteomics Initiative (Rsgi) , Sampei, G. , Watanabe, Y.
Date: 2015-06-23 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 2.2 Å Organism(s): Thermus Thermophilus Hb8 Sequences Data: 5AVM_A , 5AVM_B , 5AVM_C , 5AVM_D , 5AVM_E , 5AVM_F , 5AVM_G , 5AVM_H
70s termination complex containing e. coli rf2 Deposition Author(s): Dunham, C.M. , Hoffer, E.D.
Date: 2015-07-31 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.29996 Å Organism(s): Escherichia Coli (Strain K12) , Escherichia Coli Str. K-12 Substr. Mg1655 , Thermus Thermophilus (Strain Hb8 / Atcc 27634 / Dsm 579) , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 5CZP_YA , 5CZP_RA , 5CZP_YO , 5CZP_RO , 5CZP_YP , 5CZP_RP , 5CZP_YQ , 5CZP_RQ , 5CZP_YR , 5CZP_RR , 5CZP_YS , 5CZP_RS , 5CZP_YT , 5CZP_RT , 5CZP_YU , 5CZP_RU , 5CZP_YV , 5CZP_RV , 5CZP_YW , 5CZP_RW , 5CZP_YX , 5CZP_RX , 5CZP_YB , 5CZP_RB , 5CZP_YY , 5CZP_RY , 5CZP_YZ , 5CZP_RZ , 5CZP_Y0 , 5CZP_R0 , 5CZP_Y1 , 5CZP_R1 , 5CZP_Y2 , 5CZP_R2 , 5CZP_Y3 , 5CZP_R3 , 5CZP_Y4 , 5CZP_R4 , 5CZP_Y5 , 5CZP_R5 , 5CZP_Y6 , 5CZP_R6 , 5CZP_Y7 , 5CZP_R7 , 5CZP_YD , 5CZP_RD , 5CZP_Y8 , 5CZP_R8 , 5CZP_Y9 , 5CZP_R9 , 5CZP_XA , 5CZP_QA , 5CZP_XB , 5CZP_QB , 5CZP_XC , 5CZP_QC , 5CZP_XD , 5CZP_QD , 5CZP_XE , 5CZP_QE , 5CZP_XF , 5CZP_QF , 5CZP_XG , 5CZP_QG , 5CZP_XH , 5CZP_QH , 5CZP_YE , 5CZP_RE , 5CZP_XI , 5CZP_QI , 5CZP_XJ , 5CZP_QJ , 5CZP_XK , 5CZP_QK , 5CZP_XL , 5CZP_QL , 5CZP_XM , 5CZP_QM , 5CZP_XN , 5CZP_QN , 5CZP_XO , 5CZP_QO , 5CZP_XP , 5CZP_QP , 5CZP_XQ , 5CZP_QQ , 5CZP_XR , 5CZP_QR , 5CZP_YF , 5CZP_RF , 5CZP_XS , 5CZP_QS , 5CZP_XT , 5CZP_QT , 5CZP_XU , 5CZP_QU , 5CZP_QV , 5CZP_XV , 5CZP_QY , 5CZP_XY , 5CZP_XX , 5CZP_QX , 5CZP_YG , 5CZP_RG , 5CZP_YH , 5CZP_RH , 5CZP_YI , 5CZP_RI , 5CZP_YN , 5CZP_RN
70s termination complex containing e. coli rf2 Deposition Author(s): Dunham, C.M. , Hoffer, E.D.
Date: 2015-08-26 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.09998 Å Organism(s): Escherichia Coli , Escherichia Coli (Strain K12) , Thermus Thermophilus (Strain Hb8 / Atcc 27634 / Dsm 579) , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 5DFE_QV , 5DFE_XV , 5DFE_YH , 5DFE_RH , 5DFE_YI , 5DFE_RI , 5DFE_YN , 5DFE_RN , 5DFE_YO , 5DFE_RO , 5DFE_YP , 5DFE_RP , 5DFE_YQ , 5DFE_RQ , 5DFE_YR , 5DFE_RR , 5DFE_YS , 5DFE_RS , 5DFE_YT , 5DFE_RT , 5DFE_YU , 5DFE_RU , 5DFE_QX , 5DFE_XX , 5DFE_YV , 5DFE_RV , 5DFE_YW , 5DFE_RW , 5DFE_YX , 5DFE_RX , 5DFE_YY , 5DFE_RY , 5DFE_YZ , 5DFE_RZ , 5DFE_Y0 , 5DFE_R0 , 5DFE_Y1 , 5DFE_R1 , 5DFE_Y2 , 5DFE_R2 , 5DFE_Y3 , 5DFE_R3 , 5DFE_Y4 , 5DFE_R4 , 5DFE_QY , 5DFE_XY , 5DFE_Y5 , 5DFE_R5 , 5DFE_Y6 , 5DFE_R6 , 5DFE_Y7 , 5DFE_R7 , 5DFE_Y8 , 5DFE_R8 , 5DFE_Y9 , 5DFE_R9 , 5DFE_XA , 5DFE_QA , 5DFE_XB , 5DFE_QB , 5DFE_XC , 5DFE_QC , 5DFE_XD , 5DFE_QD , 5DFE_XE , 5DFE_QE , 5DFE_YA , 5DFE_RA , 5DFE_XF , 5DFE_QF , 5DFE_XG , 5DFE_QG , 5DFE_XH , 5DFE_QH , 5DFE_XI , 5DFE_QI , 5DFE_XJ , 5DFE_QJ , 5DFE_XK , 5DFE_QK , 5DFE_XL , 5DFE_QL , 5DFE_XM , 5DFE_QM , 5DFE_XN , 5DFE_QN , 5DFE_XO , 5DFE_QO , 5DFE_YB , 5DFE_RB , 5DFE_XP , 5DFE_QP , 5DFE_XQ , 5DFE_QQ , 5DFE_XR , 5DFE_QR , 5DFE_XS , 5DFE_QS , 5DFE_XT , 5DFE_QT , 5DFE_XU , 5DFE_QU , 5DFE_YD , 5DFE_RD , 5DFE_YE , 5DFE_RE , 5DFE_YF , 5DFE_RF , 5DFE_YG , 5DFE_RG
Crystal structure of the thermus thermophilus 70s ribosome in complex with hygromycin-a at 3.1a resolution Deposition Author(s): Altman, R.B. , Blanchard, S.C. , Burnett, B.J. , Dinos, G. , Juette, M.F. , Lu, W. , Polikanov, Y.S. , Reynolds, K. , Starosta, A.L. , Steitz, T.A. , Terry, D.S. , Wilson, D.N.
Date: 2015-09-11 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.1 Å Organism(s): Thermus Thermophilus (Strain Hb8 / Atcc 27634 / Dsm 579) , Thermus Thermophilus Hb8 Sequences Data: 5DOX_1A , 5DOX_2A , 5DOX_1O , 5DOX_2O , 5DOX_1P , 5DOX_2P , 5DOX_1Q , 5DOX_2Q , 5DOX_1R , 5DOX_2R , 5DOX_1S , 5DOX_2S , 5DOX_1T , 5DOX_2T , 5DOX_1U , 5DOX_2U , 5DOX_1V , 5DOX_2V , 5DOX_1W , 5DOX_2W , 5DOX_1X , 5DOX_2X , 5DOX_1B , 5DOX_2B , 5DOX_1Y , 5DOX_2Y , 5DOX_1Z , 5DOX_2Z , 5DOX_10 , 5DOX_20 , 5DOX_11 , 5DOX_21 , 5DOX_12 , 5DOX_22 , 5DOX_13 , 5DOX_23 , 5DOX_14 , 5DOX_24 , 5DOX_15 , 5DOX_25 , 5DOX_16 , 5DOX_26 , 5DOX_17 , 5DOX_27 , 5DOX_1D , 5DOX_2D , 5DOX_18 , 5DOX_28 , 5DOX_19 , 5DOX_29 , 5DOX_1C , 5DOX_2C , 5DOX_1E , 5DOX_2E , 5DOX_1F , 5DOX_2F , 5DOX_1G , 5DOX_2G , 5DOX_1H , 5DOX_2H , 5DOX_1I , 5DOX_2I , 5DOX_1J , 5DOX_2J , 5DOX_1K , 5DOX_2K , 5DOX_1L , 5DOX_2L , 5DOX_1M , 5DOX_2M , 5DOX_1N , 5DOX_2N
Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna and cognate trnalys in the a-site Deposition Author(s): Demeshkina, N. , Khusainov, I. , Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2015-10-12 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.2 Å Organism(s): Escherichia Coli , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 5E7K_13 , 5E7K_1G , 5E7K_1I , 5E7K_1A , 5E7K_2I , 5E7K_2A , 5E7K_3I , 5E7K_3A , 5E7K_4I , 5E7K_4A , 5E7K_5I , 5E7K_5A , 5E7K_6I , 5E7K_6A , 5E7K_7I , 5E7K_7A , 5E7K_8I , 5E7K_8A , 5E7K_9I , 5E7K_9A , 5E7K_AI , 5E7K_AA , 5E7K_1E , 5E7K_12 , 5E7K_BI , 5E7K_BA , 5E7K_1F , 5E7K_1B , 5E7K_1K , 5E7K_2K , 5E7K_2L , 5E7K_3K , 5E7K_4K , 5E7K_4L , 5E7K_1H , 5E7K_14 , 5E7K_16 , 5E7K_1J , 5E7K_71 , 5E7K_79 , 5E7K_11 , 5E7K_19 , 5E7K_2E , 5E7K_22 , 5E7K_21 , 5E7K_29 , 5E7K_31 , 5E7K_39 , 5E7K_41 , 5E7K_49 , 5E7K_51 , 5E7K_59 , 5E7K_61 , 5E7K_69 , 5E7K_58 , 5E7K_15 , 5E7K_68 , 5E7K_25 , 5E7K_78 , 5E7K_35 , 5E7K_88 , 5E7K_45 , 5E7K_98 , 5E7K_55 , 5E7K_3E , 5E7K_32 , 5E7K_A8 , 5E7K_65 , 5E7K_B8 , 5E7K_75 , 5E7K_C8 , 5E7K_85 , 5E7K_D8 , 5E7K_95 , 5E7K_E8 , 5E7K_A5 , 5E7K_F8 , 5E7K_B5 , 5E7K_G8 , 5E7K_C5 , 5E7K_H8 , 5E7K_D5 , 5E7K_I8 , 5E7K_E5 , 5E7K_J8 , 5E7K_F5 , 5E7K_4E , 5E7K_42 , 5E7K_K8 , 5E7K_G5 , 5E7K_L8 , 5E7K_H5 , 5E7K_M8 , 5E7K_N8 , 5E7K_J5 , 5E7K_P8 , 5E7K_L5 , 5E7K_Q8 , 5E7K_M5 , 5E7K_1L , 5E7K_3L , 5E7K_5E , 5E7K_52 , 5E7K_6E , 5E7K_62 , 5E7K_7E , 5E7K_72 , 5E7K_8E , 5E7K_82
Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna and trnalys in the a-site with wobble pair Deposition Author(s): Demeshkina, N. , Khusainov, I. , Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2015-10-13 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 2.95 Å Organism(s): Escherichia Coli , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 5E81_13 , 5E81_1G , 5E81_1I , 5E81_1A , 5E81_2I , 5E81_2A , 5E81_3I , 5E81_3A , 5E81_4I , 5E81_4A , 5E81_5I , 5E81_5A , 5E81_6I , 5E81_6A , 5E81_7I , 5E81_7A , 5E81_8I , 5E81_8A , 5E81_9I , 5E81_9A , 5E81_AI , 5E81_AA , 5E81_1E , 5E81_12 , 5E81_BI , 5E81_BA , 5E81_1F , 5E81_1B , 5E81_1K , 5E81_1L , 5E81_2K , 5E81_2L , 5E81_3K , 5E81_3L , 5E81_4K , 5E81_4L , 5E81_1H , 5E81_14 , 5E81_16 , 5E81_1J , 5E81_71 , 5E81_79 , 5E81_11 , 5E81_19 , 5E81_2E , 5E81_22 , 5E81_21 , 5E81_29 , 5E81_31 , 5E81_39 , 5E81_41 , 5E81_49 , 5E81_51 , 5E81_59 , 5E81_61 , 5E81_69 , 5E81_58 , 5E81_15 , 5E81_68 , 5E81_25 , 5E81_78 , 5E81_35 , 5E81_88 , 5E81_45 , 5E81_98 , 5E81_55 , 5E81_3E , 5E81_32 , 5E81_A8 , 5E81_65 , 5E81_B8 , 5E81_75 , 5E81_C8 , 5E81_85 , 5E81_D8 , 5E81_95 , 5E81_E8 , 5E81_A5 , 5E81_F8 , 5E81_B5 , 5E81_G8 , 5E81_C5 , 5E81_H8 , 5E81_D5 , 5E81_I8 , 5E81_E5 , 5E81_J8 , 5E81_F5 , 5E81_4E , 5E81_42 , 5E81_K8 , 5E81_G5 , 5E81_L8 , 5E81_H5 , 5E81_M8 , 5E81_N8 , 5E81_J5 , 5E81_P8 , 5E81_L5 , 5E81_Q8 , 5E81_M5 , 5E81_5E , 5E81_52 , 5E81_6E , 5E81_62 , 5E81_7E , 5E81_72 , 5E81_8E , 5E81_82
Hu dna-binding protein from thermus thermophilus Deposition Author(s): Adam, P. , Meijers, R. , Nounesis, G. , Papageorgiou, A. , Petratos, K. , Stavros, P. , Vorgias, C.E.
Date: 2015-11-03 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 1.69 Å Organism(s): Thermus Thermophilus Hb8 Sequences Data: 5EKA_A
Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna and trnalys in the a-site with a u-u mismatch in the first position Deposition Author(s): Demeshkina, N. , Khusainov, I. , Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2015-11-04 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.15 Å Organism(s): Escherichia Coli K-12 , Thermus Thermophilus Hb8 , Synthetic Construct Sequences Data: 5EL4_13 , 5EL4_1G , 5EL4_1I , 5EL4_1A , 5EL4_2I , 5EL4_2A , 5EL4_3I , 5EL4_3A , 5EL4_4I , 5EL4_4A , 5EL4_5I , 5EL4_5A , 5EL4_6I , 5EL4_6A , 5EL4_7I , 5EL4_7A , 5EL4_8I , 5EL4_8A , 5EL4_9I , 5EL4_9A , 5EL4_AI , 5EL4_AA , 5EL4_1E , 5EL4_12 , 5EL4_BI , 5EL4_BA , 5EL4_1F , 5EL4_1B , 5EL4_1K , 5EL4_2K , 5EL4_2L , 5EL4_3K , 5EL4_4K , 5EL4_4L , 5EL4_1H , 5EL4_14 , 5EL4_16 , 5EL4_1J , 5EL4_71 , 5EL4_11 , 5EL4_19 , 5EL4_2E , 5EL4_22 , 5EL4_21 , 5EL4_29 , 5EL4_31 , 5EL4_39 , 5EL4_41 , 5EL4_49 , 5EL4_51 , 5EL4_59 , 5EL4_61 , 5EL4_69 , 5EL4_58 , 5EL4_15 , 5EL4_68 , 5EL4_25 , 5EL4_78 , 5EL4_35 , 5EL4_88 , 5EL4_45 , 5EL4_98 , 5EL4_55 , 5EL4_3E , 5EL4_32 , 5EL4_A8 , 5EL4_65 , 5EL4_B8 , 5EL4_75 , 5EL4_C8 , 5EL4_85 , 5EL4_D8 , 5EL4_95 , 5EL4_E8 , 5EL4_A5 , 5EL4_F8 , 5EL4_B5 , 5EL4_G8 , 5EL4_C5 , 5EL4_H8 , 5EL4_D5 , 5EL4_I8 , 5EL4_E5 , 5EL4_J8 , 5EL4_F5 , 5EL4_4E , 5EL4_42 , 5EL4_K8 , 5EL4_G5 , 5EL4_L8 , 5EL4_H5 , 5EL4_M8 , 5EL4_N8 , 5EL4_J5 , 5EL4_P8 , 5EL4_L5 , 5EL4_Q8 , 5EL4_M5 , 5EL4_1L , 5EL4_3L , 5EL4_5E , 5EL4_52 , 5EL4_6E , 5EL4_62 , 5EL4_7E , 5EL4_72 , 5EL4_8E , 5EL4_82
Structure of t. thermophilus 70s ribosome complex with mrna and trnalys in the a-site with a u-u mismatch in the second position Deposition Author(s): Demeshkina, N. , Khusainov, I. , Rozov, A. , Yusupov, M. , Yusupova, G.
Date: 2015-11-04 Method: X-RAY DIFFRACTION Resolution: 3.15 Å Organism(s): Escherichia Coli K-12 , Thermus Thermophilus Hb8 Sequences Data: 5EL5_13 , 5EL5_1G , 5EL5_1I , 5EL5_1A , 5EL5_2I , 5EL5_2A , 5EL5_3I , 5EL5_3A , 5EL5_4I , 5EL5_4A , 5EL5_5I , 5EL5_5A , 5EL5_6I , 5EL5_6A , 5EL5_7I , 5EL5_7A , 5EL5_8I , 5EL5_8A , 5EL5_9I , 5EL5_9A , 5EL5_AI , 5EL5_AA , 5EL5_1E , 5EL5_12 , 5EL5_BI , 5EL5_BA , 5EL5_1F , 5EL5_1B , 5EL5_1K , 5EL5_2K , 5EL5_2L , 5EL5_3K , 5EL5_4K , 5EL5_4L , 5EL5_1H , 5EL5_14 , 5EL5_16 , 5EL5_1J , 5EL5_71 , 5EL5_11 , 5EL5_19 , 5EL5_2E , 5EL5_22 , 5EL5_21 , 5EL5_29 , 5EL5_31 , 5EL5_39 , 5EL5_41 , 5EL5_49 , 5EL5_51 , 5EL5_59 , 5EL5_61 , 5EL5_69 , 5EL5_58 , 5EL5_15 , 5EL5_68 , 5EL5_25 , 5EL5_78 , 5EL5_35 , 5EL5_88 , 5EL5_45 , 5EL5_98 , 5EL5_55 , 5EL5_3E , 5EL5_32 , 5EL5_A8 , 5EL5_65 , 5EL5_B8 , 5EL5_75 , 5EL5_C8 , 5EL5_85 , 5EL5_D8 , 5EL5_95 , 5EL5_E8 , 5EL5_A5 , 5EL5_F8 , 5EL5_B5 , 5EL5_G8 , 5EL5_C5 , 5EL5_H8 , 5EL5_D5 , 5EL5_I8 , 5EL5_E5 , 5EL5_J8 , 5EL5_F5 , 5EL5_4E , 5EL5_42 , 5EL5_K8 , 5EL5_G5 , 5EL5_L8 , 5EL5_H5 , 5EL5_M8 , 5EL5_N8 , 5EL5_J5 , 5EL5_P8 , 5EL5_L5 , 5EL5_Q8 , 5EL5_M5 , 5EL5_1L , 5EL5_3L , 5EL5_5E , 5EL5_52 , 5EL5_6E , 5EL5_62 , 5EL5_7E , 5EL5_72 , 5EL5_8E , 5EL5_82